Все эксперименты на животных были одобрены Институциональным комитетом по уходу и использованию животных Пекинского университета китайской медицины (BUCM-2024110107-4103).
Коллекция активных компонентов и целей
YGP включает Rehmannia glutinosa, Aconitum carmichaelii, Cinnamomum cassia, Dioscorea opposita, Cornus officinalis, Cuscuta chinensis, Angelica sinensis, Eucommia ulmoides, Cervi Cornus Colla и Lycium barbarum. Эти названия трав вводились в базу данных и аналитическую платформу традиционных китайских медицинских систем фармакологии (TCMSP) для извлечения их соединений. Активные соединения были скринингированы с использованием критериев пероральной биодоступности (OB ≥ 30%) и подобия препарата (DL ≥ 0,18) 19,20,21. Соответствующие мишени каждого соединения были получены из TCMSP и стандартизированы в генные символы с помощью базы данных UniProt. Мишени, связанные с простатитом, были извлечены из базы данных GeneCards с использованием ключевого слова «простатит», а для включения в исследование были отобраны гены с показателем релевантности выше среднего.
Создание регулирующей сети YGP против простатита
Пересечение мишеней, связанных с YGP, и простатитом, было определено как набор потенциальных терапевтических целей. Эти мишени были импортированы в Cytoscape (версия 3.9.1) для построения сети соединений-мишеней заболеваний. Анализ топологии сети проводился с помощью плагина CytoHubba, и ключевые компоненты были определены на основе значений максимальной центральности клик (MCC) 22.
Анализ сетей взаимодействия белков и белков (PPI)
Перекрывающиеся цели импортировались в базу данных STRING (версия 11.5), при этом организм был настроен на Homo sapiens. Минимальный требуемый балл взаимодействия был установлен на уровне ≥ 0,7, а отключённые узлы былискрыты 23. Данные взаимодействия экспортировались в формате TSV и визуализировались в Cytoscape. Гены хаба были дополнительно идентифицированы с помощью плагина CytoHubba на основе центральной степени.
Анализ пути KEGG и обогащения GO
Общие мишени были загружены на платформу Metascape для анализа путей Киотской энциклопедии генов и геномов (KEGG). Входные и аналитические виды были установлены как Homo sapiens. Был проведён анализ обогащения путей KEGG. Пути дополнительно фильтровались на основе их связи с простатитом, определённой опубликованной литературой и аннотациями в базах данных. Оставшиеся пути ранжировались по их значениям Log P. Наверх обогащённые пути KEGG визуализировались с помощью пузырьковых графиков.
Молекулярная стыковка
Ключевые мишени были выбраны из сети PPI на основе центральной степени, а активные соединения идентифицированы из регуляторной сети YGP-prostatitis на основе значений MCC для последующего анализа стыковки. Структуры белков были получены из базы данных AlphaFold Protein Structure в формате PDB, а структуры лигандов были скачаны из TCMSP в формате mol224. Молекулярная стыковка проводилась с помощью онлайн-платформы CB-Dock225. До стыковки белковые структуры автоматически предварительно обрабатывались путём удаления молекул воды, добавления атомов водорода и заполнения недостающих остатков. Фиксировались аффинности связи, а тепловые карты создавались с помощью GraphPad Prism (версия 10.1.2). Трёхмерные структуры лиганд-белковых комплексов с наименьшими показателями Vina визуализировались с помощью ChimeraX, а двумерные диаграммы взаимодействия были сгенерированы с помощью LigPlus.
Подготовка из водного экстракта YGP
Растительные компоненты YGP были приготовлены в соответствии с традиционным соотношением формул, включая 24 г обработанного корня Rehmannia glutinosa (Shudihuang), 6 г обработанного латерального корня Aconitum carmichaelii (Fuzi), 6 г коры Cinnamomum cassia (Rougui), 12 г корневища Dioscorea напротив (Shanyao), 9 г плода Cornus officinalis (Shanzhuyu), 12 г семени Cuscuta chinensis (Tusizi), 12 г обработанного желатина из рогов Cervi Cornus Colla (Lujiaojiao), 12 г плода Lycium barbarum (Gouqi), 9 г корня Angelica sinensis (Danggui) и 12 г коры Eucommia ulmoides (Duzhong). Все травы, кроме Aconitum carmichaelii и Cervi Cornus Colla, замачивались в дистиллированной воде в 6 раз большей от общей массы на 30 минут, а Aconitum carmichaelii замачивался отдельно в 6-кратной дистиллированной воде. Aconitum carmichaelii сначала отварили с помощью электрического нагревательного устройства в течение 1 часа, после чего оставшиеся травы, за исключением Cervi Cornus Colla, добавлялись и дважды отваривались по 1 час в каждом цикле. Cervi Cornus Colla затем плавили в водяной бане при температуре 60–70 °C до полного растворения и включения в экстракт. После охлаждения напой фильтровали через двухслойную марлю, алицитировали, замораживали при -20 °C в течение 48 часов и лиофилизировали для получения порошкового экстракта.
Модель животных и экспериментальный дизайн
Самцы крыс рода Спраг-Доули (8 недель, вес 200–220 г) содержались в определённых условиях, свободных от патогенов, с 12-часовым циклом света и темноты и свободным доступом к корму и воде. Через неделю акклиматизации крыс случайным образом делили на три группы (n = 6 на группу): контрольные, модельные и YGP-группы. Хронический простатит был вызван интрапростативным введением 3% растворакаррагинана 26. Кратковременно крыс анестезировали изофлураном (3–4% для индукции и 1,5–2% для поддержания), а также был сделан разрез на середине живота, чтобы обнажить простату. В каждую вентральную долю простаты было введено всего 25 мкл раствора 3% каррагинана. Контрольная группа получила внутрипростатную инъекцию только обычного физиологического физиологического раствора. Послеоперационный пенициллин (2,5 × 105 U/кг) вводился внутримышечно в течение 3 дней.
Порошок лиофилизированного экстракта YGP был приготовлен из навара и восстановлен в 0,9% стерильном нормальном физиологическом растворе для получения равномерной суспензии для перорального гаважа (10,54 г/кг/сутки). Крысы из группы YGP получали пероральное введение экстракта YGP (10 мл/кг), а контрольные и модельные группы — эквивалентный объём 0,9% стерильного физиологического раствора. Через 4 недели крыс были анестезиированы пентобарбиталом натрием (50 мг/кг, интрабрюшинная инъекция), а ткани предстательной железы были взяты после жертвоприношения в соответствии с этическими нормами.
Гистопатологическое исследование
Ткани предстательной железы фиксировались в 4% параформальдегиде в течение 24 часа, обезвоживались с помощью градированного этанола (75% спирта 4 часа, 85% спирта 2 часа, 90% спирта 2 часа, 95% спирта 1 часа, абсолютный этанол 1 час), очищены в ксилоле и добавлены в парафин. Срезы (4–5 мкм) затем подвергались окрашиванию HE согласно стандартнымпроцедурам 27. Кратковременно срезы депарафинизировали, регидратировали, окрашили гематоксилином, дифференцировали и контрокрашивали эозином. После обезвоживания и монтажа срезы наблюдались под световым микроскопом для гистопатологической оценки.
Гистопатологическое воспаление оценивалось с помощью полуколичественной системы оценки, основанной на инфильтрации воспалительных клеток, пролиферации фибробластов, морфологии ацинаров и статусе секреции. Инфильтрация воспалительных клеток оценивалась как 0 (нет инфильтрации), 2 (лёгкая инфильтрация), 4 (умеренная инфильтрация) и 6 (тяжёлая инфильтрация). Пролиферация фибробластов оценивалась как 0 (отсутствует), 1 (лёгкая), 2 (умеренная) и 3 (тяжелая). Ацинарная морфология оценивалась как 0 (большой ацинарный просвет), 1 (умеренно уменьшенный просвет), 2 (заметно уменьшенный просвет) и 3 (окклюзия или исчезновение ацинарных просветов). Статус секреции оценивался как 0 (обильная секреция), 1 (умеренная секреция), 2 (скудная секреция) и 3 (отсутствие секреции). Общий гистопатологический балл рассчитывался как сумма всех четырёх параметров, при этом более высокие показатели указывали на более тяжёлое повреждение ткани предстательной железы ивоспаление 28.
ЭЛИЗА
Ткани предстательной железы (100 мг) промывались ледяным фосфат-буферным физиологическим раствором (PBS) и гомогенизировались в буфере лизис, дополненном ингибиторами протеаз. Гомогенаты инкубировали при 4 °C в течение 30–120 минут и центрифугировали при 5000 × г в течение 15 минут при 4 °C для сбора супернатантов. Уровень белка TNF-α и IL-6 измерялся с помощью наборов ELISA согласно инструкции производителя. Стандарты и образцы добавлялись к пластинам с 96 лунками и инкубировали при 37 °C, после чего следовала последовательная инкубация с биотинилированными антителами и конъюгатами ферментов. После промывки добавляли раствор субстрата для проявления цвета, и реакция прерывалась стоп-раствором. Поглощение измерялось при 450 нм с помощью считывателя микропластин. Концентрации цитокинов рассчитывались на основе стандартных кривых.
qRT-PCR
Общая РНК была извлечена из тканей простаты методом на основе столбцов и количественно измерена поглощением на 260 и 280 нм для оценки чистоты. Образцы РНК были обратно транскрипированы в кДНК при 42 °C в течение 15 минут с помощью комплекта обратной транскрипции. qRT-PCR проводилась с использованием термоциклера при следующих условиях: начальная денатурация при 95 °C в течение 3 минут, затем 40 циклов при 95 °C в течение 10 с и 60 °C в течение 30 с. Последовательности праймеров, используемые в этом исследовании, перечислены в дополнительной таблице 1. Флуоресцентные сигналы собирались во время этапа отжига/расширения. Уровни экспрессии TNF-α и IL-6 были нормализованы до внутреннего референсного гена GAPDH. Относительная экспрессия генов рассчитывалась с помощью метода 2−ΔΔCt .
Статистический анализ
Все данные представлены в виде среднего ± стандартного отклонения (SD). Статистический анализ проводился с помощью программного обеспечения GraphPad Prism (версия 10.1.2). Распределение данных оценивалось на нормальность перед анализом. Различия между несколькими группами анализировались с помощью одностороннего анализа дисперсии (ANOVA), а затем последовал пост-хок тест Тьюки для множественных сравнений. Значение p < 0,05 считалось статистически значимым.