Все представленные здесь результаты адаптированы из сопутствующих исследований4,8,9,10, проведенных той же исследовательской группой в соответствии с единым этическим одобрением учреждения (FDASU-Rec IM112105).
Характеристика наноматериалов и выделение стволовых клеток
Стандартизированный рабочий процесс на начальном этапе позволяет количественно подтвердить свойства скаффолда и фенотипы стволовых клеток. После синтеза подготовленные наноматериалы проверяют с помощью ПЭМ высокого разрешения и XRD для подтверждения размера частиц и кристалличности (Рисунок 1A,B). Параллельно с этим DPSCs или SCAPs, выделенные путем ферментативного переваривания, демонстрируют активную адгезию и пролиферацию в полной культурной среде. Анализ методом проточной цитометрии подтверждает иммунофенотип собранных клеток на 3-м пассаже, выявляя высокую экспрессию мезенхимальных маркеров (CD44, CD43) и подтверждая их негемопоэтическое происхождение по отсутствию CD45 (Рисунок 1C).
Определение безопасной концентрации материала и пролиферации
При культивировании стволовых клеток в последовательных разведениях наноматериалов (50–1.56 µg/mL) в течение 72 ч четырехпараметрическая логистическая регрессия количества жизнеспособных клеток позволяет получить надежное значение EC₅₀ (нелинейная сигмовидная модель «доза-ответ», как описано в шаге 4.1). Значения жизнеспособности по MTT, превышающие 100%, указывают на стимуляцию пролиферации относительно необработанного контроля, так как значения нормируются по группе отрицательного контроля (необработанные клетки приняты за 100%). Например, значение ~196% для Nano-NeoMTA2 отражает биоактивную стимуляцию митохондриальной активности, а не абсолютную выживаемость клеток >100%9.
В нескольких исследованиях с применением данного стандартизированного протокола были установлены значения EC₅₀, равные 7,9 µg/mL (Nano-NeoMTA2, SCAPs)8 и 9,92 µg/mL (Nano-NeoMTA2, DPSCs)10, с использованием четырехпараметрической логистической модели (шаг 4.1), что подтверждает безопасные рабочие концентрации для использования в анализах на дифференцировку, описанных в данном протоколе. Эти значения внесены в Таблицу 1 в качестве репрезентативных показателей валидации.
Количественная оценка остеогенной и одонтогенной дифференцировки (оценка по двум маркерам)
Метод двойной иммунофлуоресценции позволяет получить два различных взаимодополняющих показателя результата из одного и того же препарата клеток. Для остеогенной оценки H-баллы RANKL статистически значимо различали все четыре группы: клетки, культивированные с Nano-NeoMTA2, демонстрировали существенно более высокую экспрессию RANKL, чем отрицательный контроль, что согласуется с усиленной активацией остеобластоподобных клеток (Рисунок 2A, Таблица 1)8,9. При одонтогенной оценке H-баллы DMP-1 выявили выраженную одонтобластоподобную дифференцировку в DPSC, культивируемых с Nano-NeoMTA2, при этом H-баллы были значимо выше, чем в группах с наногидроксиапатитом и отрицательным контролем, что подтверждает преимущественную направленность дентиногенеза (Рисунок 3A, Таблица 1)10. Идентичность клеток была подтверждена с помощью фазово-контрастной микроскопии и по характерным морфологическим критериям (веретеновидная или полигональная морфология) перед проведением оценки.
Активность ЩФ была спектрофотометрически определена для всех групп при 405 нм, служа ранним ферментативным маркером как остеогенной, так и одонтогенной дифференцировки (Таблица 1). Спектрофотометрический МТТ-анализ подтвердил, что все наноматериалы в безопасных концентрациях, рассчитанных на основе EC₅₀, обеспечивали высокую жизнеспособность клеток по сравнению с отрицательным контролем, что согласуется с представленными репрезентативными значениями (Таблица 1).
Неоптимальные и неудачные результаты экспериментов
Неоптимальные результаты обобщены в таблице 2. Низкая жизнеспособность клеток при MTT-анализе обычно указывает на то, что концентрация наноматериала превышает порог EC₅₀ или что УФ-стерилизации было недостаточно. Непостоянное поглощение при определении ALP (CV > 20%) обычно свидетельствует о неравномерной плотности посева или неполной гомогенизации лизирующего буфера. Слабый или отсутствующий сигнал иммунофлуоресценции для RANKL или DMP-1 чаще всего является результатом инактивации антител, недостаточной пермеабилизации или чрезмерной фиксации; решение этих проблем заключается в использовании свежего 4% формальдегида и одноразовых аликвот антител. Перекрестная реактивность между каналами RANKL и DMP-1 должна быть исключена путем анализа изображений контрольных образцов только со вторичными антителами перед проведением подсчета.

Рисунок 1: Стандартизированная характеристика наноматериалов и валидация фенотипа стволовых клеток. (A) Спектры XRD, подтверждающие кристаллическую фазу и структурную целостность наночастиц. (B) Репрезентативные ПЭМ-изображения, демонстрирующие наноразмер частиц, морфологию и гомогенную дисперсию синтезированных биоматериалов; сравнение NeoMTA2 и гидроксиапатита. Изображения с малым увеличением представлены для (a) NeoMTA2 и (b) гидроксиапатита, а изображения с большим увеличением приведены для (c) NeoMTA2 и (d) гидроксиапатита. Масштабные отрезки показаны в левом нижнем углу. (C) Протокол гейтирования при проточной цитометрии для характеристики стволовых клеток. Репрезентативные многопараметрические диаграммы рассеяния (dot plots) показывают клетки, окрашенные на CD44, CD73 (помечено как CD43 PE на исходных графиках) и CD45. Субпопуляции CD44+ и CD73+ были выделены (гейтированы) в соответствии с экспрессией CD45. Панели A и C адаптированы из работы Zaki et al.8 (CC BY-NC-SA) , а панель B адаптирована из работы Habib et al.10 (CC BY-NC). Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 2Количественная и полуколичественная оценка остеогенной дифференцировки методом иммунофлуоресцентного окрашивания на RANKL. (A) Репрезентативные микрофотографии высокого разрешения, полученные методом иммунофлуоресценции, демонстрирующие экспрессию критического остеогенного белкового маркера RANKL в микроокружении 2D-скаффолда: (a) клетки отрицательного контроля образуют небольшие колонии со слабой мембранной экспрессией RANKL, тогда как (b) клетки положительного контроля демонстрируют увеличение количества остеобластоподобных колоний с плотной гомогенной экспрессией. Стволовые клетки, обработанные (c) NHAP, (d) NHAP/хитозаном и (e) наночастицами биоактивного стекла, проявляют признаки глубокой дифференцировки, характеризующейся образованием крупных слившихся остеобластоподобных колоний с интенсивной гомогенной локализацией RANKL как в мембране, так и в ядре; адаптировано из: Эльшахат и соавт.4. (B) Столбчатые диаграммы, представляющие количественную оценку экспрессии RANKL по H-score в различных исследованиях. Применение методики H-score для нормализации данных иммунофлуоресценции. Путем математического интегрирования интенсивности визуального окрашивания (по шкале от 0 до 3) с процентом положительно окрашенных клеток H-score преобразует качественную микроскопию в надежный полуколичественный показатель, значительно снижая субъективную предвзятость наблюдателя. (а) Сравнение Nano-NeoMTA2 (7.9 µg/mL) и наночастиц биоактивного стекла (NBG; 500 µg/mL) по сравнению с положительным контролем в остеогенной среде (OM-PC) и отрицательным контролем в среде DMEM (DMEM-NC). NBG вызвал наиболее высокий профиль экспрессии (p &p < 0,001). Адаптировано из Abdelaziz et al. 9 (CC BY-NC-ND 4.0). (b) Оценка наногидроксиапатита (NHAP; 10µg/mL), композит NHAP/хитозан (10 µg/mL), и NBG (500 µg/mL) по сравнению с контрольными группами, при этом для NHAP/хитозана наблюдались максимальные значения H-score. Адаптировано из Elshahat et al.4 (CC BY 4.0). (c) Оценка Nano-NeoMTA2 (7.9 µg/mL) по сравнению с NHAP (10 µg/mL) и контрольных групп, что демонстрирует значительно повышенную экспрессию RANKL в Nano-NeoMT; адаптировано из: Zaki et al.8. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 3: Репрезентативные изображения иммунофлуоресценции и анализ H-показателя. (A) Оценка экспрессии белка дентинного матрикса (DMP-1) методом иммунофлуоресцентной микроскопии в экспериментальных группах; зеленая флуоресценция указывает на положительное окрашивание поликлональными антителами к DMP-1. (a) Отрицательный контроль: стволовые клетки пульпы зуба человека (hDPSCs) в недифференцирующей среде (UM) демонстрируют небольшие клеточные агрегаты со слабой, равномерной экспрессией DMP-1 (+). (b) Положительный контроль: hDPSCs в одонтогенной среде (OM) демонстрируют расширение колоний, характеризующихся плотными, гомогенными сигналами DMP-1 (++). (c) Наногидроксиапатит (10 μg/mL) и (d) Nano-NeoMTA2 (9.92 μg/mL): дифференцированные hDPSCs образуют крупные, сливающиеся колонии одонтобластоподобных клеток, демонстрирующих выраженную гомогенную экспрессию DMP-1, локализованную в мембранах и ядрах. Увеличение: ×10. Желтые круги указывают на одонтобластоподобные колонии; желтые стрелки обозначают интенсивную экспрессию DMP-1. (B) Столбчатая диаграмма, представляющая количественную оценку H-показателя экспрессии белка дентинного матрикса в исследуемых группах. Между оцениваемыми группами наблюдалось высокозначимое различие, при этом самый высокий H-показатель был отмечен в когорте Nano-NeoMTA2 (169.33 ± 4.04), за которой следовал наногидроксиапатит (140.33 ± 2.52) и отрицательный контроль (15.33 ± 1.53). Панели A и B адаптированы из Habib et al.10 (CC BY-NC). Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
| Анализ / Параметр | Наноматериал / тип клеток | Репрезентативное значение (среднее ± СО) | Нормализация | Пожалуйста, предоставьте исходный текст для перевода. |
| Жизнеспособность клеток (МТТ-тест) |
| Жизнеспособность по МТТ | Nano-NeoMTA2 (7.9 µg/mL) / SCAP-белки | ~196%
(OD = 1,56 ± 0.24) | Нормализовано относительно необработанного контроля
(DMEM-NC = 100%) | Абдельазиз и др.⁹ |
| Жизнеспособность по МТТ | Хитозан-нГК (10 µg/mL) / SCAPs (синаптические белки, ассоциированные с белками-помощниками) | ~99.97% | Нормализовано относительно необработанного контроля
(DMEM-NC = 100%) | Эль-Шахат и др.⁴ |
| Жизнеспособность по методу МТТ — положительный контроль | ОМ-ПК / SCAPs | 113.46%
(OD = 0,93 ± 0.03) | Нормировано относительно необработанного контроля
(DMEM-NC = 100%) | Абдельазиз и др.⁹ |
| Определение жизнеспособности методом МТТ — отрицательный контроль | DMEM-NC / SCAPs | 100%
(ОП = 0,82 ± 0.02)
— Контрольный базовый уровень | DMEM-NC, принятый за 100%
контроль для всех групп | Абдельазиз и др.⁹ |
| Активность щелочной фосфатазы (ЩФ) |
| Активность ЩФ | Биоактивные стеклянные наночастицы
(500 µg/mL) / SCAPs (специфические антигены цитоплазмы сперматозоидов) | 69.86 ± 0,98 Ед/л | Нормализовано по общему содержанию белка
(Ед/мг белка, метод Брэдфорд/BCA-анализ) | Абдельазиз и др.⁹ |
| Активность ЩФ — положительный контроль | ОМ-ПК / SCAPs | 77.68 ± 1,28 Ед/л | Нормализовано по общему содержанию белка
(Ед/мг белка, метод Брэдфорда/BCA-анализ) | Абдельазиз и др.⁹ |
| Активность ЩФ — отрицательный контроль | DMEM-NC / SCAPs | 55.81 ± 1,6 Ед/л | Нормализовано по общему содержанию белка
(ед./мг белка, метод Брэдфорда/BCA) | Абдельазиз и др.⁹ |
| Безопасная концентрация материала (EC₅₀) |
| Электропроводность₅₀ (SCAP — специфические белки, активирующие синусоидальные капилляры) | Nano-NeoMTA2 / SCAPs | 7.9 µg/mL | Четырехпараметрическая логистическая модель
(нелинейная сигмоидальная зависимость «доза-эффект),
GraphPad Prism 9) | Заки и др.⁸ |
| Электропроводность₅₀ (ДСКп) | Nano-NeoMTA2 / стволовые клетки пульпы глубокого слоя (СКПГС) | 9.92 µg/mL | Четырехпараметрическая логистическая модель
(нелинейная сигмоидальная зависимость «доза — ответ»,
GraphPad Prism 9) | Хабиб и др.10 |
| H-Score — экспрессия белка RANKL (остеогенный маркер) |
H-показатель (RANKL)
Остеогенный маркер | Nano-NeoMTA2 (7.9 µg/mL) / SCAPs (специфические для цитоплазмы белки-активаторы) | 164 ± 4
(шкала 0–300) | Общее количество видимых клеток в поле зрения
(фазово-контрастная микроскопия) | Заки и др.⁸ |
H-балл (RANKL)
Остеогенный маркер | нГА (10 µg/mL) / SCAP (цитоплазматические белки, активируемые стрессом) | 68 ± 3
(шкала 0–300) | Общее количество видимых клеток в поле зрения
(фазово-контрастная микроскопия) | Заки и др.⁸ |
H-балл (RANKL)
Положительный контроль | ОМ-ПК / SCAPs | 84 ± 1
(шкала 0–300) | Общее количество видимых клеток в поле зрения
(фазово-контрастная микроскопия) | Заки и др.⁸ |
H-показатель (RANKL)
Отрицательный контроль | DMEM-NC / SCAPs | 18 ± 1
(шкала 0–300) | Общее количество видимых клеток в поле зрения
(фазово-контрастная микроскопия) | Заки и соавт.⁸ |
| H-score — экспрессия белка DMP-1 (одонтогенный маркер) |
H-Score (DMP-1)
Одонтогенный маркер | Nano-NeoMTA2 (9.92 µg/mL) / ДСК (дентальные стволовые клетки) | 169.33 ± 4.04
(шкала 0–300) | Общее количество видимых клеток в поле зрения
(фазово-контрастная микроскопия) | Хабиб и др.10 |
H-Score (DMP-1)
Одонтогенный маркер | нГА (10 µg/mL) / ДПСК (дентальные стволовые клетки пульпы) | 140.33 ± 2.52
(шкала 0–300) | Общее число видимых клеток в поле зрения
(фазово-контрастная микроскопия) | Habib и соавт.10 |
H-Score (DMP-1)
Отрицательный контроль | DMEM-NC / ДСК (зубные пульпальные стволовые клетки) | 15.33 ± 1.53
(шкала 0–300) | Общее количество видимых клеток в поле зрения
(фазово-контрастная микроскопия) | Хабиб и др.10 |
H-балл (DMP-1)
Одонтогенный маркер
[Положительный контроль -OM-PC] | ОМ-ПК / ДПСК | ~103 индекс H (H-score)
(шкала 0–300) | Общее количество клеток в поле зрения
(фазово-контрастная микроскопия) | Хабиб и др.
Eur Endod J, 202610 |
| H-показатель = Σ(i × Pi): i = интенсивность окрашивания (1, 2 или 3); Pi = процент клеток на каждом уровне интенсивности (0–100%); диапазон 0–300. Жизнеспособность по МТТ, выраженная относительно группы DMEM-NC, принятой за 100% (контрольный образец). Активность ЩФ, выраженная в Ед/л на основании ферментативного дефосфорилирования п-нитрофенилфосфата; далее нормализованная по общему содержанию белка (Ед/мг белка). OM-PC = остеогенно/одонтогенная индукционная среда (положительный контроль). DMEM-NC = модифицированная среда Игла в модификации Дульбекко (отрицательный контроль). |
Таблица 1: Репрезентативные результаты стандартизированного рабочего процесса оценки in vitro. Репрезентативные количественные результаты из ранее опубликованных исследований, демонстрирующие пролиферацию клеток, активность щелочной фосфатазы и иммунофлуоресцентный анализ, выполненные с использованием стандартизированного протокола.
| Наблюдаемая проблема | Потенциальная причина | Рекомендуемое решение |
Низкая жизнеспособность клеток в МТТ-тесте
(OD < необработанного контроля) | Концентрация наноматериала превышает EC₅₀, недостаточная УФ-стерилизация или неадекватная дисперсия наночастиц. | Повторно определить EC₅₀ (Раздел 4). Увеличить время УФ-стерилизации до 30 min. Проверить однородность суспензии наночастиц с помощью зондового ультразвукового воздействия (40 W, 30 s вкл/выкл, 3 цикла при 4 °C) непосредственно перед использованием. |
| CV жизнеспособности в МТТ-тесте >15% между повторами | Ошибка пипетирования, неравномерный посев клеток или варьирование времени/температуры инкубации с МТТ. | Использовать калиброванный многоканальный дозатор для всех добавлений. Подтвердить плотность посева с помощью гемоцитометра перед высевом на планшет. Соблюдать строгий режим инкубации в течение 4 h при 37 °C в увлажненном CO₂-инкубаторе. Использовать «холостую» лунку для коррекции фона. |
| Противоречивые значения абсорбции ALP (CV >20% между лунками) | Неравномерная плотность посева клеток, неполный лизис клеток или нестабильность пипетирования при добавлении субстрата. | Строго придерживаться плотности 1 × 10⁴ клеток/лунка в 24-луночных планшетах. Тщательно перемешивать буфер для лизиса на вортексе перед использованием. Соблюдать одинаковое время инкубации при лизисе (10 min, 4 °C, осторожное покачивание). Проверить фоновую абсорбцию в «холостой» лунке без клеток. |
Слабый или отсутствующий сигнал иммунофлуоресценции RANKL
(шаг 5.4a) | Инактивация антител из-за неправильного хранения, избыточная фиксация, снижающая доступность эпитопа, или недостаточная пермеабилизация. | Готовить свежий 4% формальдегид непосредственно перед использованием. Добавить 0.1% Triton X-100 для пермеабилизации (10 min, RT) перед блокировкой. Титровать разведение первичных антител (начать с 1:200). Использовать срез ткани в качестве положительного контроля. Разливать сток антител по аликвотам, чтобы избежать повторных циклов замораживания-оттаивания. |
Слабый или отсутствующий сигнал иммунофлуоресценции DMP-1
(шаг 5.4b) | Инактивация антител в результате циклов замораживания-оттаивания, неоптимальное разведение первичных антител или несовместимость видов животных, в которых были получены первичные и вторичные антитела. | Разлить антитела anti-DMP-1 по аликвотам, чтобы избежать циклов замораживания-оттаивания. Титровать разведение, начиная с 1:200. Подтвердить совместимость видов между первичными (DMP-1) и вторичными антителами. Использовать срез ткани дентина в качестве положительного контроля для DMP-1. |
Перекрестная реактивность между каналами флуоресценции
RANKL и DMP-1 | Спектральное перекрывание эмиссионных спектров при использовании одного и того же флуорохрома для обоих вторичных антител или недостаточный разнос каналов на флуоресцентном микроскопе. | Использовать спектрально различающиеся флуорохромы вторичных антител для RANKL и DMP-1 (например, Alexa Fluor 488 для одного маркера и Alexa Fluor 594 для другого). Перед оценкой независимо изучить изображения контроля только с вторичными антителами для каждого канала. Получать изображения RANKL и DMP-1 по отдельности, используя режим последовательного сбора данных. |
Высокий неспецифический фон при
иммунофлуоресцентном окрашивании | Недостаточная блокировка белков, слишком высокая концентрация вторичных антител или неадекватные этапы промывки между инкубациями. | Увеличить время блокировки до 2 h при RT. Увеличить разведение вторичных антител до 1:1000. Подтвердить специфичность с помощью контроля только с вторичными антителами (без первичных). Убедиться в полноте всех промывок в PBS (3 × 5 min каждая). |
Межэкспертная вариабельность H-score
(каппа Коэна <0.7, шаг 5.6) | Непоследовательное применение четырехступенчатой шкалы интенсивности окрашивания (0, 1+, 2+, 3+) разными наблюдателями или недостаточная калибровка перед сессиями оценки. | Провести совместную калибровку с использованием репрезентативных тренировочных изображений перед формальной оценкой. Использовать идентичные настройки отображения изображений (яркость, контрастность) для всех наблюдателей. Оценивать минимум пять полей зрения при большом увеличении на лунку и рассчитывать каппу через каждые 10 полей для мониторинга дрейфа. |
Кривая EC₅₀ не сходится
или плохое соответствие модели (шаг 4.1) | Недостаточное количество точек данных, узкий диапазон концентраций или недостижение однородности суспензии перед посевом. | Расширить диапазон серийных разведений, включив как минимум 6 концентраций в пределах 50–1.56 µg/mL. Убедиться, что зонковая соникация проводится непосредственно перед каждым этапом разведения. Повторить опыт минимум с 3 независимыми биологическими повторами. Подтвердить, что CV <15% между повторами. |
Таблица 2: Критические параметры и руководство по поиску и устранению неисправностей. Распространенные технические проблемы, возникающие при выполнении протокола, их потенциальные причины и рекомендуемые решения для повышения воспроизводимости экспериментов и качества данных. Сокращения: CV = коэффициент вариации; RT = комнатная температура.