17 июня 2009 г.
Это видео документы методы сбора проб воды прибрежных морских и обработка их для различных приложений, включая вниз по течению концентрация биомассы, нуклеиновые кислоты очистки, сотовые изобилие, питательных веществ и следов анализ газа.
Здравствуйте, я Елена Кова из лаборатории Стивена Халлема кафедры микробиологии и иммунологии Университета Британской Колумбии. Сегодня мы продемонстрируем вам процедуру отбора проб морской воды для физического, химического и биологического анализа. Мы используем этот метод в нашей лаборатории для изучения океанографических параметров морских вод.
Итак, приступим. Сначала определяются количество забросов и глубина каждого из них, затем определяются глубины отбора проб и общий объем воды, который необходимо собрать за текущий заброс. Убедитесь, что пробоотборные устройства go-flow и kin находятся в открытом положении, а все клапаны и краны закрыты.
Прикрепите CTD к основанию троса и опустите его в воду до максимальной глубины профиля. Сразу за CTD закрепите на тросе устройство для отбора проб. Убедитесь, что трос правильно установлен в кронштейне устройства и винты затянуты.
Прикрепите утяжеленный посыльный груз к каждому устройству, кроме устройства для самого глубокого забора проб, перед погружением в воду. Опускайте линию на расстояние от первой заданной глубины до следующей, затем устанавливайте следующее устройство для отбора проб. Обратите внимание, что для интервалов глубин, где собираются пробы воды большого объема, последовательно устанавливаются две бутыли по 12 литров с интервалом примерно 0.75 meters.
После того как все устройства будут размещены на тросе, опустите трос на максимальную глубину и подождите две минуты. Спустите вниз посыльный груз, чтобы перевести каждое устройство в закрытое положение. Подождите несколько минут перед подъемом троса.
Чтобы убедиться, что все устройства закрыты, выберите леску и выгружайте каждое устройство на палубу по мере его извлечения из воды. Для глубин, требующих больших объемов проб для очистки белков, ДНК или РНК, используйте два устройства для отбора проб последовательно. Немедленно извлеките РНК из одной бутыли и профильтруйте её на борту судна.
После отбора проб химических веществ и биогенных элементов из другого флакона слейте оставшуюся воду в канистру, чтобы получить конечный объем 20 литров. Для проб малого объема отберите один литр воды в стерильные флаконы Nalgene для последующей фильтрации. Как правило, пробы малого объема отбираются из 16 интервалов глубины в виде 16 проб по одному литру, а пробы большого объема отбираются в виде шести проб по 20 литров.
При сборе проб газа всегда отбирайте пробы кислорода и микропримесей газов. Сначала прикрепите тонкий отрезок трубки к крану устройства для отбора проб воды. Поместите другой конец трубки в стеклянные флаконы для сыворотки.
Промойте флакон для сыворотки трижды, используя пробу воды, и заполните его до перелива, чтобы исключить появление пузырьков воздуха. Добавьте во флакон 50 µL хлорида ртути. Будьте осторожны, чтобы в пробу не попали пузырьки воздуха.
Герметизируйте флакон с сывороткой резиновой пробкой С, закрепив её алюминиевым колпачком, и поместите его на лёд для последующего отбора проб для измерения содержания биогенов, включая нитраты, фосфаты и силикаты. Сначала промойте шприц объемом 60 cc пробующей водой. Затем установите в линию фильтр AcroDisc с порами 0.2 micrometer.
Пропустите через шприц примерно 2 ml воды, чтобы промыть фильтр. Трижды промойте полиэтиленовый флакон, используя примерно 10 ml фильтрованной воды.
При промывании встряхните флаконы, затем наполните их отфильтрованной пробой воды примерно на три четверти. Храните пробу на льду. Опорожните пробирки для сбора проб от дистиллированной воды перед сбором образцов для измерения содержания аммиака.
Сначала промойте пробирки для сбора образцов, используя саму пробу воды. Наполните мерный цилиндр объемом 10 мл пробоводой, отмерьте 5 мл пробы, перелив ее из цилиндра, и слейте остаток жидкости. Затем снова перелейте эти 5 мл в пустой цилиндр.
После сбора образцов со всех глубин добавьте в каждую пробирку 7,5 ml рабочего реагента аммония. Для сбора образцов для подсчета клеток заполните предварительно промаркированную пробирку Falcon объемом 50 ML, содержащую 5,4 ml 37% формальдегида, до метки 50 ml для достижения конечной концентрации 4%. Следите за тем, чтобы содержимое не переливалось через край пробирки. Храните образцы на льду до момента сбора.
Для измерения содержания сероводорода. Наполните предварительно маркированную пробирку Falcon объемом 50 ML, содержащую три ml 20% ацетата цинка, доверху. Следите за тем, чтобы содержимое пробирки не перелилось.
Храните образец на льду для сбора малых объемов. Для концентрирования биомассы заполните доверху однолитровые бутыли Nalgene для сбора больших объемов.
Заполните 20-литровые бутыли доверху. В результате отбора проб морской воды получается примерно от 32 до 48 образцов. Газовые пробы — 32, пробы на аммоний — 32.
16 образцов сероводорода. 16 образцов для подсчета клеток. Шесть 20-литровых канистр, 16 однолитровых бутылей и четыре контейнера Sterex.
Фильтры с порами 2,2 мкм, содержащие микробную биомассу, сохраняют для дальнейшего использования. Выделение РНК. Мы только что продемонстрировали, как собирать различные виды проб воды для биохимического анализа.
Это требует тщательной подготовки и планирования. Поэтому выделите два дня до поездки, чтобы привести все в порядок, и один день после нее для очистки; не допускайте попадания соленой воды в перистальтический насос или в алюминиевый кейс Zago, используемый для транспортировки полевого оборудования. Бережно относитесь к оборудованию, и оно будет долго вам служить.
На этом всё. Спасибо за просмотр и удачи в ваших экспериментах.
Просмотрите полный транскрипт и получите доступ к тысячам научных видео
В данном видео демонстрируются методы сбора проб прибрежных морских вод и их подготовки для различных последующих применений, включая концентрирование биомассы, очистку нуклеиновых кислот, определение численности клеток, а также анализ содержания биогенных веществ и микропримесей газов.
Надежные протоколы отбора и сбора проб морской воды являются основой для создания высококачественных наборов данных при поиске биофармацевтических соединений в морской среде, обеспечивая точную оценку переменных окружающей среды и биологических материалов. Эти методы лежат в основе последующих анализов, таких как очистка нуклеиновых кислот, количественное определение содержания клеток и профилирование питательных веществ, которые имеют решающее значение для валидации мишеней и снижения механистических рисков при поиске лекарств морского происхождения. Стандартизированный сбор обеспечивает воспроизводимость и сопоставимость в рамках программ поиска, поддерживая принятие решений по всему портфелю разработок.
Методы отбора и сбора проб морской воды находятся в начале континуума поиска биофармацевтических препаратов морского происхождения, обеспечивая базовым материалом рабочие процессы, охватывающие валидацию мишеней, скрининг и трансляционные исследования.