Отбор проб морской воды и сбор
17 июня 2009 г.
Это видео документы методы сбора проб воды прибрежных морских и обработка их для различных приложений, включая вниз по течению концентрация биомассы, нуклеиновые кислоты очистки, сотовые изобилие, питательных веществ и следов анализ газа.
Здравствуйте, я Елена Кова из лаборатории Стивена Халлама на факультете микробиологии и иммунологии Университета Британской Колумбии. Сегодня мы покажем вам процедуру сбора морской воды для физического, химического и биологического анализа. Мы используем эту процедуру в нашей лаборатории для изучения океанических графических параметров морских вод.
Итак, приступим. Сначала назначается количество забросов и глубина при каждом забросе, затем определяются глубины отбора проб и общий объем, который должен быть собран для текущего заброса. Убедитесь, что устройства для отбора проб воды и воды находятся в открытом положении, а все клапаны и патрубки закрыты.
Прикрепите CTD к основанию лески и опустите его в воду на наибольшую глубину в профиле. Установите устройство для отбора проб на линию сразу после CTD. Убедитесь, что леска правильно вставлена в кронштейн устройства и винты затянуты.
Прикрепите к каждому устройству утяжеленный мессенджер, за исключением самой большой глубины отбора проб, прежде чем опускать его в воду. Опустите линию и расстояние между первой указанной глубиной и следующей, затем установите другое устройство для отбора проб. Обратите внимание, что для интервалов глубины, где отбираются пробы воды большого объема, в общей сложности две бутылки объемом 12 литров загружаются последовательно на расстоянии примерно 0,75 метра друг от друга.
После того, как все устройства будут на линии, опустите линию на самую глубокую глубину и дайте пройти две минуты. Отправьте посыльного вниз, поставив каждое устройство в закрытое положение. Подождите несколько минут, прежде чем восстановить линию.
Чтобы убедиться, что все устройства закрыты, смотайте леску и выгрузите каждое устройство на палубу, когда оно выходит из воды. Для глубины, требующей больших объемов образцов для очистки белковой ДНК или РНК, используйте два устройства для отбора проб в тандеме. Соберите РНК сразу из одного флакона и отфильтруйте его на корабле.
После отбора проб химикатов и питательных веществ в другой бутылке слейте оставшуюся воду в автомобиль, чтобы получить окончательный объем объемом 20 литров. Для образцов небольшого объема отведите один литр воды для фильтрации в стерильных бутылках Nalgene. Как правило, пробы малого объема с 16 интервалов глубины собираются как 16 проб по одному литру, а шесть проб по 20 литров — как пробы большого объема.
При сборе проб газа всегда отбирайте пробы кислорода и следов газа. Сначала прикрепите тонкий кусок трубки к крану устройства для отбора проб воды. Поместите другой конец трубки во флаконы с сывороткой glos.
Промойте флакон с сывороткой три раза, но возьмите пробу воды и наполните ее до переполнения, чтобы не было пузырьков воздуха. Добавьте 50 микролитров хлорида ртути во флакон с сывороткой. Будьте осторожны, чтобы не занести в образец пузырьки воздуха.
Закройте флакон с сывороткой резиновой пробкой с алюминиевым колпачком, а затем храните его на льду для сбора образцов для измерения питательных веществ, включая нитраты, фосфаты и силикаты. Сначала промойте шприц объемом 60 мл с образцом воды. Затем подсоедините дисковый фильтр акро диаметром 0,2 микрометра в линию.
Протолкните примерно два мл воды через шприц. Для продувки фильтра. Ополосните полиэтиленовую бутылку примерно 10 мл фильтрованной воды три раза.
Встряхните бутылку при ополаскивании, затем добавьте фильтрованную пробу воды в бутылки примерно на три четверти. Храните образец на льду. Опорожните пробирки для сбора дистальных вод для сбора проб для измерения аммиака.
Сначала промойте пробирки для сбора, но пробойтесь воды полностью. Наполните мерный цилиндр объемом 10 мл пробоотборной водопроводной трубкой пятью мл пробной воды из градуированного цилиндра и опорожните оставшуюся часть баллона. Затем добавьте пять мл обратно в пустой цилиндр.
После забора проб со всех глубин было по 7,5 мл аммонийного рабочего реагента в каждую пробирку. Чтобы собрать образцы для подсчета клеток, заполните предварительно маркированную пробирку Falcon объемом 50 мл, содержащую 5,4 мл, 37% формальной высоты, до отметки 50 мл до конечной концентрации 4%. Храните образец на льду для сбора образцов.
Для измерения сероводорода. Заполните предварительно маркированную пробирку Falcon объемом 50 мл с тремя мл 20% ацетата цинка доверху. Следите за тем, чтобы не переполнить трубку.
Храните образец на льду, чтобы собрать небольшие объемы. Для концентрации биомассы. Наполните литровые бутылки Nalgene доверху, чтобы собрать большие объемы для концентрации биомассы.
Наполните 20 литров карбоев доверху. Окончательный результат отбора проб морской воды составляет примерно от 32 до 48. Пробы газа, 32 пробы аммония.
16 образцов сероводорода. 16 образцов для подсчета клеток. Шесть 20-литровых автомобилей, 16 литровых бутылок и четыре стерекса.
Пункт второй, два микрометра, фильтры, содержащие микробную биомассу, сохраняются на потом. Выделение РНК. Мы только что продемонстрировали, как собирать различные виды проб воды для биохимического анализа.
Это требует большой подготовки и планирования. Поэтому выделите два дня до поездки на наведение порядка и один день после нее на очистку, не допускайте попадания соленой воды в насос перальта или в алюминиевый ящик заго, используемый для транспортировки полевого оборудования. Относитесь к оборудованию с уважением и оно будет хорошо служить долгое время.
Вот и все. Спасибо за просмотр и удачи в ваших экспериментах.
Просмотрите полный транскрипт и получите доступ к тысячам научных видео
Обзор
Это видео документирует методы сбора образцов прибрежных морских вод и их обработки для различных дальнейших приложений, включая концентрацию биомассы, очистку нуклеиновых кислот, определение изобилия клеток, анализ питательных веществ и микрогазов.
Ключевые компоненты исследования
Область науки
- Морская биология
- Экология
- Микробиология
Фон
- Понимание океанографических параметров важно для изучения морских экосистем.
- Отбор водных образцов необходим для различных анализов в морских исследованиях.
- Можно использовать различные методы для сбора и обработки морских водных образцов.
- Точные методы отбора образцов обеспечивают надежные данные для дальнейших приложений.
Цель исследования
- Демонстрировать процедуру сбора морской воды для анализа.
- Показать важность правильных методов отбора образцов в морских исследованиях.
- Предоставить ресурс для исследователей, изучающих морские экосистемы.
Используемые методы
- Определение количества заборов и глубин для отбора образцов.
- Определение общего объема воды, подлежащей сбору.
- Использование устройств для отбора водных образцов go flow и kin.
- Проверка закрытых всех клапанов и кранах перед отбором образцов.
Основные результаты
- Успешный сбор образцов морской воды для различных анализов.
- Демонстрация эффективных методов отбора образцов.
- Подготовка образцов для дальнейших приложений.
- Взгляд на океанографические параметры морских вод.
Выводы
- Правильные методы отбора образцов жизненно важны для точных морских исследований.
- Собранные образцы могут быть использованы для различных научных анализов.
- Эта процедура может быть воспроизведена в других морских исследованиях.
Часто задаваемые вопросы
Executive Industry Relevance
Robust seawater sampling and collection protocols are foundational for generating high-quality datasets in marine biopharma discovery, enabling accurate assessment of environmental variables and biological materials. These methods underpin downstream analyses such as nucleic acid purification, cell abundance quantification, and nutrient profiling, which are critical for target validation and mechanistic de-risking in marine-derived drug discovery. Standardized collection ensures reproducibility and comparability across discovery programs, supporting portfolio-wide decision-making.
Strategic Applications in Biopharma R&D
Early Discovery & Target Validation
- Enables precise interrogation of marine microbial communities for novel target identification.
- Supports functional validation of environmental samples for pathway elucidation.
- Facilitates mechanistic de-risking by providing uncontaminated, well-characterized input material.
- Improves predictive confidence in early-stage marine bioprospecting.
Screening & Assay Development
- Delivers standardized, high-integrity samples for downstream assay development.
- Ensures reproducibility in cell abundance and nutrient quantification workflows.
- Provides scalable sample volumes for parallel screening and method optimization.
- Enables reliable evaluation of marine-derived compounds and bioactivities.
Translational & Preclinical Research
- Aligns environmental sampling with translational biomarker discovery when marine systems are disease-relevant.
- Maintains continuity from environmental collection through preclinical validation of marine bioactives.
- Supports risk-adjusted advancement by ensuring sample traceability and quality.
- Reduces ambiguity in linking environmental variables to biological outcomes.
Pipeline & Workflow Integration
Seawater sampling and collection methods are positioned at the front end of the marine biopharma discovery continuum, providing foundational material for workflows spanning target validation, screening, and translational research.
- Discovery Biology: Supplies uncontaminated, well-characterized samples for hypothesis testing and pathway analysis.
- Screening: Enables reproducible, quantitative readouts for cell counts, nutrient levels, and trace gas analyses.
- Analytics: Supports robust statistical comparison of environmental and biological variables across conditions.
- Translational Research: Facilitates alignment of environmental sampling with downstream biomarker and preclinical studies when relevant.
- Enterprise Reuse: Establishes a standardized protocol adaptable across marine sampling campaigns and R&D programs.
Operational & Enterprise Impact
- Scientific Value: Increases predictive confidence and reduces mechanistic ambiguity in marine-derived target validation.
- Operational Value: Promotes standardization, reproducibility, and scalability in sample collection and processing.
- Strategic Value: Enables informed go/no-go decisions and capital-efficient portfolio management by ensuring data integrity.
- Portfolio Impact: Supports risk-adjusted prioritization and advancement of marine biopharma assets.
Implementation Considerations
- Requires technical expertise in marine sampling and environmental parameter control.
- Demands specialized instrumentation such as CTD sensors, Niskin or Go-Flo bottles, and filtration systems.
- Necessitates rigorous cross-team standardization to ensure data comparability.
- Must be adaptable to varying marine environments and sample volume requirements.
- Logistical planning is essential to minimize contamination and preserve sample integrity during collection and processing.
Biopharma FAQs
Chapters in this video
0:05
Title
0:10
Introduction
0:37
Water Collection
3:07
Gas Sample Collection
4:04
Nutrient Sample Collection (includes nitrate, phosphate, and silicate)
4:58
Ammonia Sample Collection
5:46
Sample Collection for Cell Enumeration
6:13
Sample Collection for Hydrogen Sulfide Measurements
6:36
Small Volume Collection for Biomass Concentration
6:51
Large Volume Collection for Biomass Concentration
7:04
Representative Results/Outcome
7:42
Conclusion
