$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
- 3D-органотипические модели колоректального рака представляют собой культуры in vitro, спроектированные для имитации микроокружения опухоли in vivo. Культура часто содержит стромальные клетки, такие как фибробласты, совместно культивируемые с эпителиальными клетками колоректального рака, в подходящем микроокружении внеклеточного матрикса.
В укоренившихся культурах опухолевые клетки с метастатическим потенциалом проникают во внеклеточный матрикс. Чтобы изолировать эти вторгающиеся клетки, сначала обработайте органотипическую модель формальдегидом для фиксации клеток и внеклеточного матрикса. Инкубируйте с алкоголем для обезвоживания образца.
Далее заделите в жидкий парафин для создания тканевого блока. Используйте ультрамикротом для получения тонко нарезанных срезов. Установите секции на соответствующее предметное стекло
.
Добавьте ксилол для депарафинизации срезов. Последовательно инкубируйте срезы в уменьшающихся концентрациях этанола для регидратации образцов.
Лечите Cresyl Violet для окрашивания и дифференцировки клеток колоректального рака из микроокружения. Положите предметное стекло на предметный столик для микроскопа лицевой стороной вниз. С помощью соответствующего программного обеспечения определите клетки, которые необходимо микрорасчленить, и очертите границы. Выстрелите лазером, чтобы разрезать выделенный участок и собрать микрорассеченный участок.
В следующем протоколе мы покажем выделение клеток колоректального рака из 3D-органотипической модели кокультуры с помощью лазерной микродиссекции.
- Извлеките из колодца всю органику, в том числе и капроновый лист, и поместите его на пищевую пленку. Разделите органотипный и нейлоновый лист пополам с помощью чистого одноразового скальпеля и зафиксируйте обе половинки в формальдегиде на 24 часа при комнатной температуре. Замените формальдегид на 70% этанол через 24 часа и оставьте на ночь перед заделкой в парафин, срезом и окрашиванием.
Чтобы выполнить лазерную микродиссекцию, сначала разрезают органотипическое вещество толщиной до 10 микрон на предметные стекла, установленные на мембране. После обработки участков в соответствии с текстовым протоколом подготовьтесь к проведению лазерной микродиссекции с использованием выбранной платформы.
Поместите предметное стекло витражной частью для микродисперсии лицевой стороной вниз на предметный столик микроскопа. Вмонтируйте микроцентрифужную пробирку объемом 0,5 мл в кассету для сбора и добавьте 50 микролитров буфера для лизиса клеток в колпачок, в который будет собираться микрорассеченная ткань. Находясь под прямым зрением, используйте джойстик для идентификации интересующей ткани, а с помощью программного интерфейса аннотируйте окрашенный органический участок, выделяя клетки, подлежащие микродиссекции, на фронте инвазии опухоли.
Дайте команду лазеру выстрелить, который должен одновременно вырезать выделенный участок и протолкнуть микрорассеченную ткань в колпачок микроцентрифужной трубки. Приступайте к обработке образцов подходящим методом для извлечения интересующего аналита.