Автоматизированный анализ распределения фрагментов cfDNA по размерам на основе капиллярного электрофореза: метод изучения распределения фрагментов ДНК по размерам фрагментов ДНК, выделенных из биожидкостей на основе капиллярного электрофореза: метод изучения распределения по размерам фрагментов ДНК, выделенных из биожидкостей на основе микрочипов ДНК

Умирающая клетка выделяет фрагменты свободной от клеток или cfDNA за пределы клетки. Чтобы проанализировать распределение фрагментов cfDNA по размерам, начните с многолуночного ДНК-чипа – миниатюрной капиллярной электрофоретической системы. Каждая лунка в чипе содержит множество микрофлюидных разделительных каналов в своем основании.

Загрузите гелевую матрицу из полисахарида и смесь флуоресцентного красителя в предназначенную для этого лунку на чипе. Поместите чип на грунтовочный узел, оснащенный пустым шприцем. Закройте узел грунтовки и нажмите на поршень, чтобы создать давление вниз. Это облегчает поступление вязкого геля из лунки в соответствующий сепарационный канал

.

Откройте сборку и заполните оставшиеся лунки суспензией cfDNA и лестницей ДНК известного диапазона размеров. Установите микросхему на анализатор фрагментов. Сильное напряжение приводит к поступлению суспензии cfDNA из пробных лунок в разделительный канал, предварительно загруженный гелевой матрицей, где ДНК окрашивается красителем.

По мере того, как ДНК движется от катода к аноду, более мелкие фрагменты ДНК быстрее мигрируют через гель, в то время как более крупные фрагменты движутся медленнее. Это приводит к разде