16 сентября 2011 г.
Мы разработали методику для тестирования белок-белковых взаимодействий в растение. Желтый флуоресцентный белок (YFP) расщепляется на два непересекающихся фрагментов. Каждый фрагмент клонировали в рамке интересующего гена через шлюз системы, что позволяет выражение плавления белков. Восстановление сигнала YFP только тогда, когда следствие белки взаимодействуют.
Чтобы проверить взаимодействие между двумя белками, два интересующих их гена должны быть клонированы в наш БФ и векторы с использованием техники шлюзового желания. Эти конструкции преобразуются в аэрий GV 3 1 0 1. Бактериальные культуры GV 3 1 0 1, содержащие конструирование, будут смешиваться и проникать в листья.
Если два белка-кандидата взаимодействуют друг с другом, сигнал YFP можно наблюдать с помощью фокуса результата в Мексике. Основной целью метода BFC является проверка взаимодействия между двумя белками. В vavo мы создали серию шлюзосовместимых BFC и IS двух гибридных векторов, которые предоставляют исследователям простые в использовании инструменты для выполнения двух гибридных анализов BFC и ISTO.
В этом видео мы продемонстрируем простоту использования нашей системы BFC. Чтобы проверить белок, белковые взаимодействия не должны выходить за пределы системы экспрессии. Для начала нужно подготовить GV 3 1 0 1 бактериальную культуру.
Вам нужно выбрать одну колонию из вашей тарелки и привить пяти самцам среды YEB соответствующие антибиотики. Затем нужно встряхнуть эту культуру на ночь при температуре 28 градусов. Скорость составляет 200 пробежек в минуту.
Бактериальные культуры должны быть готовы на следующее утро. Убедитесь, что бактерии D переросли. Выньте культуры из инкубатора и перенесите по одному самцу каждой культуры в стерильную центрифужную пробирку объемом 1,5 самца.
Поместите пробирки центрифуги в настольную центрифугу. Уменьшите количество бактерий при 1000 г в течение 10 минут при комнатной температуре, выбросьте снет. Затем наблюдайте за пенатом, добавляя один прием инфильтрационной среды, и повторите оценку по петтингу несколько раз.
Повторите шаг стирки еще два раза. Это важно, потому что это помогает удалить следы антибиотиков в бактериальной среде, которые вызывают у вас уплотнения растений после инфильтрации. После окончательной промывки операционную суспензию поддона в 0,5 единицы инфильтрационной среды от 600 единиц этой бактериальной суспензии используют спектрофотометр с использованием инфильтрационной среды в качестве контроля банка.
После измерения наружного диаметра необходимо отрегулировать внешний диаметр с помощью инфильтрационной среды. Итоговый OD должен быть в диапазоне от одного до 1,2. Вы должны подготовить все бактериальные суспензии, прежде чем переходить к следующему этапу.
Перенесите равное количество бактериальных суспензий, соответствующих двум белкам-кандидатам, и смешайте их в новой 1,5-дюймовой мужской трубке Отрицательная смесь бактерий теперь относится к инфильтрату. Подготовьте все комбинации и не забудьте включить негативный контроль. Вы должны использовать пять-шесть недельных кодов и наилучшим образом использовать растения для проникновения.
Вы можете удалить растения из комнаты для выращивания и поместить их на ночь за час до проникновения, чтобы открыть штормовую атаку. Это поможет в процессе проникновения. Наберите около 100 микролитров Резуса взвешенных бактерий.
Смешайте возле одного самца соскочивший наконечник шприца без иглы. Приложите кончик шприца к нижней стороне листа ly. Поддержите пальцем верхнюю сторону колена.
В общем, надавите на поршень. Вы должны быть в состоянии видеть, как жидкость диффундирует через лист, но чувствует, что мезоболее тонкие воздушные пространства после инфильтрации позволяют проникнуть в воздух с помощью маркерного пера. В противном случае, через два дня, вы не сможете идентифицировать инфильтрированный А. Если вам необходимо инфильтровать С другой смесью бактерий, обязательно распылите на перчатку 50% этанол или смените перчатки G между инфильтрациями.
Старайтесь оставлять расстояние в один метр между просадками, чтобы предотвратить перекрестное заражение. Сигналы PFA следует контролировать каждые 24 часа с момента инфильтрации до пяти дней. Для хранения образца можно использовать два чехла разных размеров.
Сначала нанесите одну каплю мини-воды на рукав с надрезной крышкой. Затем отрежьте небольшой кусочек ткани ножа в пределах инфильтрированной зоны. Старайтесь избегать тошноты вены в пробе.
Положите отрезанную ткань ножа в воду на горку, под нее опуститесь, накройте ее с помощью рукава меньшего размера и слегка прижмите. Теперь образец можно наблюдать под мексикой. Здесь мы используем этот NACA T CSS P два конфокальных Мексики для визуализации сигнала BIFC.
Можно использовать даже обычный аромат Мексика. Конфокальный обеспечивает более качественное изображение и обнаруживает слабые сигналы. Параметр YFP можно использовать для обнаружения сигналов VFC в данной системе NCA P two.
Вы можете просто дважды щелкнуть по этой предустановке YFP здесь, которая автоматически включит возбуждение и установит дальность обнаружения излучения. Если вы используете другую систему, обратитесь к руководству, чтобы правильно настроить параметры. Мы надеемся, что после просмотра этого видео вы сможете провести BFCE для тестирования белковых взаимодействий с использованием системы экспрессии unbe MI Transcend.
Также можно применять эту процедуру к табаку и растениям AY. Наши векторы BFC также содержат HA и флаг соответственно, поэтому вы также можете выполнить co IP для проверки взаимодействий, если это необходимо.
Просмотрите полный транскрипт и получите доступ к тысячам научных видео
Это исследование представляет новую технику для тестирования взаимодействий белков в растениях с использованием подхода с разделенным желтым флуоресцентным белком (YFP). Клонируя фрагменты YFP в рамке с генами интереса, исследователи могут наблюдать реконституцию YFP, что указывает на взаимодействия белков.
Protein-protein interaction analysis in plant systems supports target validation and mechanistic de-risking in agrochemical and biologics discovery. The Gateway-compatible BiFC system enables reproducible, in vivo interaction screening with quantitative fluorescence readouts, improving predictive confidence in early-stage target assessment. This approach reduces reliance on indirect assays and supports cross-functional collaboration between plant biology and translational research teams.
The BiFC system fits within the early discovery continuum, supporting hypothesis testing and assay development prior to lead identification efforts in plant-based therapeutic discovery.