January 3rd, 2014
Агроинфильтрация и агроинфекция PVX являются обычными функциональными анализами для преходящей эктопической экспрессии генов в растениях. Эти методы являются эффективными анализами в стратегиях effectoromics (быстрое сопротивление и открытие гена авируляции) и имеют решающее значение для современных исследований в молекулярной патологии растений. Они отвечают спросу на надежный функциональный анализ высокой пропускной способности на заводах.
Общая цель данного эксперимента состоит в том, чтобы проверить, распознаются ли эффекторы патогенов устойчивыми белками в растениях. Это достигается путем предварительного заражения листьев растений жидкой культурой агробактерий или через агроинфекцию PVX, которая будет временно экспрессировать эффекторы в тканях растения. Затем растениям дают инкубироваться, и растения оценивают на гибель клеток.
Получены результаты, показывающие реакцию на гибель клеток при распознавании временно экспрессируемых перебежчиков белками резистентности у растений. Основное преимущество этих методик перед существующими методами, такими как генетические исследования с молекулярными маркерами, заключается в том, что это функциональные анализы. Они не только показывают, что ген устойчивости присутствует в растении, но и что он работает и что защитные реакции активно индуцируются.
Эти методы могут помочь ответить на ключевые вопросы молекулярной патологии растений, такие как быстрое обнаружение устойчивости ботов и генов РА и уголовных болезней AFI, наличие которых у обеих последовательностей генома Демонстрация процедуры будет выполнена du, аспирантом из лаборатории Для создания растений картофеля. Выращивание растений in vitro в стерильных пластиковых банках, содержащих большее количество шиге, скуга или среды рассеянного склероза, в климатических камерах при температуре 18 градусов Цельсия с 16-часовым восьмичасовым дневным ночным режимом в течение двух недель. Когда растения подрастают, белые корни переносят их в горшки со стерилизованной почвой.
В регулируемых тепличных отсеках для растений, используемых в этих экспериментах, используются четырех-пятинедельные семена, выращенные NCOA hamana, и четырех-пятинедельные саженцы картофеля, полученные in vitro. Готовить агробактериальную культуру начинают с заполнения 50 миллилитровых пробирок 10 миллилитрами среды YEB, дополненной одним микролитром ацетофенона, 100 микролитрами MES и соответствующими антибиотиками. Далее пипеткой вводят 20 микролитров глицеринового запаса нужных штаммов агробактерий, содержащих интересующий ген, в YEB.
Инкубируйте культуры при температуре 28 градусов Цельсия и 200 об/мин в течение одного-двух дней до наружного диаметра 600 около 1,0. Соберите клетки центрифугированием при давлении 3000 GS в течение 10 минут. Затем слейте супернат и снова суспендируйте гранулу.
В свежеприготовленных ММА средний до OD 600 0,3. Осторожно переведите клетки в вихрь, чтобы восстановить их суспензию для совместной инфильтрации двух бактериальных штаммов. Смешайте культуру в соотношении один к одному.
Дайте культурам постоять при комнатной температуре от одного до шести часов, прежде чем проникать в растения. Тем временем пометьте растения, которые будут инфильтрированы, штаммом и дату проведения эксперимента для проведения инфильтрации, надев защитные очки. С помощью одномиллилитрового шприца без иглы осторожно и медленно вводите суспензии агробактерий в листовые панели.
Вносите не менее трех растений и трех листьев на растение, чтобы они служили тройками, чтобы избежать перекрестного заражения. Меняйте или стерилизуйте перчатки между инфильтрациями и не поливайте растения до следующего дня. После инокуляции примерно через три дня после инфильтрации оцените растения на гибель клеток по шкале от нуля до 100%, где ноль означает отсутствие симптомов.
100%указывает на конфлюенсную гибель клеток и промежуточные значения, варьирующиеся от склероза до возрастающих уровней гибели клеток. Проведите агроинфекцию PVX у двух-трехнедельных растений и растений, выращенных из семян хамана, и двух-трехнедельных пересадках картофеля, выращенных in vitro, до трех миллилитров YEB с добавлением антибиотиков. Добавьте 20 микролитров глицеринового запаса агробактерий, инкубируйте при 28 градусах Цельсия и 200 оборотах в минуту до наружного диаметра 600 около 1,0.
Разложите около 300 микролитров каждого штамма агробактерии на агаровые пластины LB с антибиотиками и инкубируйте при температуре 28 градусов Цельсия в течение одного-двух дней. Используйте шпатель для сбора агробактерии. Затем следует привить лист с большим количеством бактерий.
Опустите зубочистку в культуру и с ее помощью проткните растение. Прививайте каждый лист в нескольких местах через листья на растение и три растения на сорт. Через две недели после прививки оцените макроскопически, качественно записав каждое пятно как «да» или «нет».
Затем рассчитайте процент ответивших сайтов и сравните с показанными элементами управления. Вот репрезентативные результаты агроинфильтрации в конце hamana и двух сортах картофеля, Solenium JI 3 49 dash three и CV Desiree примерно через три дня после инокуляции. Происходит слияние клеточной гибели в листовой панели, инфильтрированной смесью агробактерии штамма AGL одного PVRG, содержащего P bin плюс R три A и PK семь WG два A VR три A , при этом смертельного ответа не происходит при отрицательном контроле PI плюс R три A или PK семь WG два A VR три A на этом рисунке PVX агроинфекция n и два вида картофеля S один Kae 3 54 dash one и S micro DOUM 360 dash one показаны примерно через две недели после прививки.
Происходит расширение клеточной гибели в местах, инокулированных положительным контролем PGR 1 0 6 CRN two. Он кодирует ген, вызывающий общую гибель клеток от Phytophthora Infest и PGR 1 0 6 в одном, который кодирует ген от P Infest. Гибель расширяющихся клеток не наблюдается на участке, инокулированном отрицательным контролем PGR 1 0 6 пустой лунки.
При попытке выполнить эту процедуру важно помнить о выращивании растительного материала хорошего качества. Этот метод проложил путь к изучению омики эффектов в картофеле и других видах растений для исследователей в области молекулярной патологии растений и селекции растений. После просмотра этого видео у вас должно сложиться хорошее понимание того, как проводить эффективный и надежный высокопроизводительный функциональный анализ гена can у растений.
В этой статье рассматриваются агроинфильтрация и агроинфекция PVX как методы для временного эктопического экспрессии генов в растениях. Эти методы важны для функциональных анализов в эффекторомике, способствуя открытию генов устойчивости и авируленции в молекулярной фитопатологии.
Functional validation of resistance genes in plant systems supports early-stage target de-risking in agrochemical and biopesticide discovery. Agroinfiltration and PVX agroinfection provide rapid, high-throughput assays to confirm effector recognition and defense activation, reducing reliance on genetic markers alone. These methods enable mechanistic interrogation of host-pathogen interactions, informing lead identification and predictive confidence in trait validation pipelines.
The method fits within early discovery workflows where functional validation follows gene identification and precedes lead optimization in trait development pipelines.