-1::1
Simple Hit Counter
Skip to content

Products

Solutions

×
×
Sign In

RU

EN - EnglishCN - 简体中文DE - DeutschES - EspañolKR - 한국어IT - ItalianoFR - FrançaisPT - Português do BrasilPL - PolskiHE - עִבְרִיתRU - РусскийJA - 日本語TR - TürkçeAR - العربية
Sign In Start Free Trial

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

Behavior
Biochemistry
Bioengineering
Biology
Cancer Research
Chemistry
Developmental Biology
View All
JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

Biological Techniques
Biology
Cancer Research
Immunology
Neuroscience
Microbiology
JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduate courses

Analytical Chemistry
Anatomy and Physiology
Biology
Calculus
Cell Biology
Chemistry
Civil Engineering
Electrical Engineering
View All
JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

Advanced Biology
Basic Biology
Chemistry
View All
JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

Biology
Chemistry

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

Accounting
Finance
Macroeconomics
Marketing
Microeconomics

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Authors

Teaching Faculty

Librarians

K12 Schools

Biopharma

Products

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduates

JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Solutions

Authors
Teaching Faculty
Librarians
K12 Schools
Biopharma

Language

ru_RU

EN

English

CN

简体中文

DE

Deutsch

ES

Español

KR

한국어

IT

Italiano

FR

Français

PT

Português do Brasil

PL

Polski

HE

עִבְרִית

RU

Русский

JA

日本語

TR

Türkçe

AR

العربية

    Menu

    JoVE Journal

    Behavior

    Biochemistry

    Bioengineering

    Biology

    Cancer Research

    Chemistry

    Developmental Biology

    Engineering

    Environment

    Genetics

    Immunology and Infection

    Medicine

    Neuroscience

    Menu

    JoVE Encyclopedia of Experiments

    Biological Techniques

    Biology

    Cancer Research

    Immunology

    Neuroscience

    Microbiology

    Menu

    JoVE Core

    Analytical Chemistry

    Anatomy and Physiology

    Biology

    Calculus

    Cell Biology

    Chemistry

    Civil Engineering

    Electrical Engineering

    Introduction to Psychology

    Mechanical Engineering

    Medical-Surgical Nursing

    View All

    Menu

    JoVE Science Education

    Advanced Biology

    Basic Biology

    Chemistry

    Clinical Skills

    Engineering

    Environmental Sciences

    Physics

    Psychology

    View All

    Menu

    JoVE Lab Manual

    Biology

    Chemistry

    Menu

    JoVE Business

    Accounting

    Finance

    Macroeconomics

    Marketing

    Microeconomics

Start Free Trial
Loading...
Home
JoVE Journal
Developmental Biology
Крупномасштабные данио рерио эмбриональных Сердце Вскрытие для транскрипционных анализа
Крупномасштабные данио рерио эмбриональных Сердце Вскрытие для транскрипционных анализа
JoVE Journal
Developmental Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Developmental Biology
Large-scale Zebrafish Embryonic Heart Dissection for Transcriptional Analysis

Крупномасштабные данио рерио эмбриональных Сердце Вскрытие для транскрипционных анализа

Full Text
15,273 Views
10:00 min
January 12, 2015

DOI: 10.3791/52087-v

Verónica A. Lombardo*1,2,3, Cécile Otten*1,2, Salim Abdelilah-Seyfried1,2,3

1Max Delbrück Center for Molecular Medicine, 2Institute of Biochemistry and Biology,University of Potsdam, 3Institute of Molecular Biology,Medizinische Hochschule Hannover

AI Banner

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

This article presents a protocol for collecting functional hearts from live zebrafish embryos through rapid manual dissection. The method allows for the extraction of cardiac-specific mRNA, facilitating the analysis of gene expression profiles during heart development.

Key Study Components

Area of Science

  • Cardiac development
  • Zebrafish model
  • Gene expression analysis

Background

  • Zebrafish are a valuable model for studying vertebrate heart development.
  • Understanding cardiac gene expression is crucial for insights into developmental biology.
  • Transgenic zebrafish can be used to visualize specific heart tissues.
  • RNA extraction from isolated hearts is essential for transcriptome analysis.

Purpose of Study

  • To develop a reliable method for isolating beating hearts from zebrafish embryos.
  • To enable the extraction of cardiac-specific RNA for further analysis.
  • To investigate gene expression at various developmental stages.

Methods Used

  • Anesthetizing zebrafish embryos for dissection.
  • Pipetting embryos to release hearts from embryonic bodies.
  • Filtration steps to separate hearts from debris.
  • Manual sorting of fluorescently labeled hearts.

Main Results

  • Successful collection of functional hearts from embryos.
  • Extraction of sufficient amounts of cardiac-specific RNA.
  • Facilitation of transcriptome analysis to study gene expression.
  • Insights into differences in gene expression between wild and mutant hearts.

Conclusions

  • The developed protocol is effective for cardiac RNA extraction.
  • This method can advance research in heart development and genetics.
  • Future studies can leverage this approach to explore cardiac function in zebrafish.

Frequently Asked Questions

What is the significance of using zebrafish for heart studies?
Zebrafish are a powerful model organism due to their transparent embryos and rapid development, allowing for real-time observation of heart development.
How does the dissection method affect RNA quality?
Careful dissection minimizes contamination and ensures high-quality RNA extraction from the isolated hearts.
What are the advantages of using transgenic zebrafish?
Transgenic zebrafish can express fluorescent proteins, aiding in the visualization and isolation of specific tissues like the heart.
Can this method be applied to other organs?
While this protocol is tailored for hearts, similar techniques can be adapted for other organs in zebrafish.
What are the potential applications of this research?
This research can inform studies on congenital heart defects and the genetic basis of heart diseases.
How can the findings be used in comparative studies?
The method allows for comparisons of gene expression between wild-type and mutant zebrafish, enhancing our understanding of genetic influences on heart development.

Для анализа профилей экспрессии генов сердечных во данио развития сердца, общей РНК должны быть извлечены из изолированных сердцах. Здесь мы приводим протокол для сбора функционал / бьющееся сердце быстрым ручной вскрытия из эмбрионов данио рерио, чтобы получить сердечно-специфической мРНК.

Общая цель этой процедуры заключается в сборе сердец путем быстрого ручного препарирования из живых эмбрионов рыбок данио-рерио для получения специфичного для сердца Mr.NA. Это достигается путем предварительного пипетирования, многократного обезболивания эмбрионов вверх и вниз через узкий кончик пипетки, чтобы одновременно освободить сердца от эмбриональных тел. Затем вскрытые сердца отделяются от эмбрионального мусора в два этапа быстрой фильтрации. Затем сердечки с флуоресцентной маркировкой вручную сортируются от оставшегося мусора.

Наконец, сердечная специфическая РНК извлекается из собранных сердец. В конечном счете, протокол вскрытия сердца используется для сбора достаточного количества эмбриональных сердец для проведения транскриптомного анализа. Этот метод поможет задать ключевые вопросы в области развития сердца чешуйниц, например, какие транскрипты экспрессируются в сердце на разных стадиях развития, а также сравнить дикую и мутантную экспрессию сердца.

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

Sign In Start Free Trial

Explore More Videos

Биология развития выпуск 95 данио эмбрион сердце рассечение РНК RT-КПЦР

Related Videos

Сердце Dissection в личинок, несовершеннолетних и взрослых данио рерио, Danio rerio

06:43

Сердце Dissection в личинок, несовершеннолетних и взрослых данио рерио, Danio rerio

Related Videos

22.5K Views

Иммуноокрашивание расчлененного данио рерио Эмбриональные сердца

06:23

Иммуноокрашивание расчлененного данио рерио Эмбриональные сердца

Related Videos

18.4K Views

Вскрытие сердца: метод наблюдения за развитием сердца у рыбок данио

04:58

Вскрытие сердца: метод наблюдения за развитием сердца у рыбок данио

Related Videos

3.8K Views

Восстановление взрослых данио сердца для высокой пропускной приложений

06:51

Восстановление взрослых данио сердца для высокой пропускной приложений

Related Videos

13K Views

Выделение и характеристика отдельных клеток из эмбрионов данио рерио

09:25

Выделение и характеристика отдельных клеток из эмбрионов данио рерио

Related Videos

15.3K Views

Свет лист флуоресцентной микроскопии для захвата 4-мерного изображения эффектов модуляции напряжения сдвига на развивающихся сердце данио рерио

06:51

Свет лист флуоресцентной микроскопии для захвата 4-мерного изображения эффектов модуляции напряжения сдвига на развивающихся сердце данио рерио

Related Videos

8.9K Views

Анализ перемещения миокардной механической деформации (DIAMOND) показывает сегментную гетерогенность сердечной функции у эмбриональных зебрафиш

09:15

Анализ перемещения миокардной механической деформации (DIAMOND) показывает сегментную гетерогенность сердечной функции у эмбриональных зебрафиш

Related Videos

5.5K Views

Световая листовая микроскопия быстрой сердечной динамики у эмбрионов рыбок данио

07:29

Световая листовая микроскопия быстрой сердечной динамики у эмбрионов рыбок данио

Related Videos

5.1K Views

CRISPR-Cas9-опосредованные точные правки в сердцах рыбок данио

06:52

CRISPR-Cas9-опосредованные точные правки в сердцах рыбок данио

Related Videos

4.1K Views

Функциональная визуализация сердца у эмбрионов рыбок данио с использованием стандартной микроскопии и видеоанализа: применение в экологических и биомедицинских исследованиях

04:11

Функциональная визуализация сердца у эмбрионов рыбок данио с использованием стандартной микроскопии и видеоанализа: применение в экологических и биомедицинских исследованиях

Related Videos

766 Views

JoVE logo
Contact Us Recommend to Library
Research
  • JoVE Journal
  • JoVE Encyclopedia of Experiments
  • JoVE Visualize
Business
  • JoVE Business
Education
  • JoVE Core
  • JoVE Science Education
  • JoVE Lab Manual
  • JoVE Quizzes
Solutions
  • Authors
  • Teaching Faculty
  • Librarians
  • K12 Schools
  • Biopharma
About JoVE
  • Overview
  • Leadership
Others
  • JoVE Newsletters
  • JoVE Help Center
  • Blogs
  • JoVE Newsroom
  • Site Maps
Contact Us Recommend to Library
JoVE logo

Copyright © 2026 MyJoVE Corporation. All rights reserved

Privacy Terms of Use Policies
WeChat QR code