Секвенирование растений стены Heteroxylans Использование ферментативной, химической (метилирование) и физический (масс-спектрометрия, ядерный магнитный резонанс) Методики

7.4K просмотров

Цитируется: 1

11:49 мин.

24 марта 2016 г.

10.3791/53748-v

24 марта 2016 г.

7.4K просмотров

Sunil Ratnayake¹ , Kristina Ford¹ , Antony Bacic¹

¹ARC Centre of Excellence in Plant Cell Walls, School of BioSciences, University of Melbourne

Этот протокол описывает конкретные методы, используемые для структурной характеристики восстановительных конечных (RE) и внутренних областей гликозильных последовательностей гтероксиланов путем мечения RE 2 аминобензамидом перед ферментативным (эндоксиланазным) гидролизом, а затем анализа полученных олигосахаридов с использованием масс-спектрометрии (MS) и ядерного магнитного резонанса (NMR).

Больше видео

Секвенирование гетероксиланов

обработка эндоксиланазой

маркировка 2AB

анализ методом MALDI-TOF-MS

RP-HPLC-ESI-QTOF-MS

анализ методом ESI-MSn

ЯМР-спектроскопия

метилирование олигосахаридов

характеристика полисахаридов

секвенирование гликанов

Chapters in this video

0:05

Заголовок

0:53

Маркировка сахарного остатка восстанавливающего конца (ВК) водорастворимых арабиноксиланов (W-sol AXs) 2-аминобензамидом (2AB)

2:11

Получение ксилоолигосахаридов из маркированных 2AB водорастворимых арабиноксиланов

3:34

Матрично-активированная лазерная десорбция-ионизация с времяпролетным масс-спектрометрическим анализом (MALDI-TOF MS)

4:48

Масс-спектрометрия с ионизацией электрораспылением и квадрупольно-времяпролетным анализатором (ESI-QTOF MS)

6:20

ESI-MSⁿ

7:30

Спектроскопия ядерного магнитного резонанса (ЯМР) на ядрах H¹

8:45

Результаты: гликозильные последовательности восстанавливающего конца (ВК) и внутренних областей гетероксиланов

10:34

Заключение