May 5th, 2016
Многоцветное флуоресцентное детектирование в капельной микрофлюидике обычно включает в себя громоздкие и сложные системы детектирования на основе эпифлуоресцентного микроскопа. Здесь мы опишем компактную и модульную схему многоцветного обнаружения, которая использует массив оптических волокон для временного кодирования многоцветных данных, собранных одним фотодетектором.
Общая цель этой процедуры — продемонстрировать простое применение микрофлюоресцентного детектирования капель с помощью оптических волокон. Этот метод может помочь ответить на ключевые вопросы высокопроизводительного биологического скрининга, такие как идентификация редких фенотипов и направленная эволюция ферментов. Основное преимущество этого метода заключается в том, что он позволяет легко и недорого применять флуоресцентное детектирование в капельной микрофлюидике.
Для начала поместите предварительно очищенную кремниевую пластину диаметром три дюйма на вакуумный патрон установки для нанесения покрытий. Затем нанесите один миллилитр SU-8 3050 в центр пластины и вращайте пластину, чтобы получить слой фоторезиста толщиной 80 микрометров. Снимите пластину с покрытием с отверткой и поместите ее на горячую плиту, нагретую до 135 градусов Цельсия.
Через 30 минут выньте пластину и дайте ей остыть до комнатной температуры. Затем поместите пластину на плоскую поверхность и выровняйте маску первого слоя по пластине. Подставьте пластину под коллимированный светодиод мощностью 190 милливатт и яркостью 365 нанометров в течение трех минут.
После экспонирования поместите пластину на конфорку с температурой 135 градусов Цельсия на одну минуту, а затем дайте ей остыть до комнатной температуры. Когда клетка остынет, поместите ее обратно на прядильную машину и прикрепите ее к патрону. Нанесите дополнительный миллилитр SU-8 3050 в центр пластины и вращайте в течение 20 секунд со скоростью 500 об/мин.
затем 30 секунд при 5 000 оборотов в минуту. Далее выпекаем на конфорке. Дайте ему остыть до комнатной температуры, а затем поместите обратно на поверхность выравнивания маски.
С помощью области препарирования вручную выровняйте маску второго слоя по шаблонным меткам выравнивания на пластине. После правильного выравнивания экспонируйте пластину с покрытием на 4-1/2 минуты, используя те же условия, что и раньше. После экспонирования поместите пластину на горячую плиту при температуре 135 градусов Цельсия на одну минуту, затем охладите пластину и прикрепите ее обратно к отжимной машине.
Нанесите один миллилитр SU-8 3050 на пластину в третий раз и вращайте, чтобы добавить дополнительные 100 микрометров фоторезиста. Выньте и выпекайте на конфорке при температуре 135 градусов Цельсия в течение 30 минут. Затем охладите его до комнатной температуры и поместите на выравнивающую поверхность.
Совместите маску третьего слоя с предыдущей геометрией и экспонируйте покрытую пластину в предыдущих условиях в течение девяти минут. После экспонирования поместите пластину на конфорку с температурой 135 градусов Цельсия на одну минуту, а затем охладите ее до комнатной температуры. Как только маска остынет, проявите ее, погрузив в размешанную ванночку с проявителем на 30 минут.
Наконец, промойте в изопропаноле, а затем выпекайте ее в последний раз в течение одной минуты на конфорке при температуре 135 градусов Цельсия. Храните разработанный мастер в 100-миллиметровой чашке Петри до формовки. Приготовьте смесь PDMS в соотношении 10:1, смешав 50 граммов силиконовой основы с пятью граммами отвердителя в пластиковом стаканчике.
Смешайте содержимое с помощью вращающегося инструмента, а затем дегазируйте смесь внутри эксикатора в течение 30 минут или до тех пор, пока не будут удалены все пузырьки воздуха. Залейте дегазированный PDMS над подготовленным мастером до получения толщины в три миллиметра. Затем поместите чашку Петри обратно в эксикатор для дальнейшей дегазации.
Как только все пузырьки будут удалены, выпекайте прибор при температуре 80 градусов Цельсия в течение 80 минут. После охлаждения вырежьте устройство из формы с помощью скальпеля так, чтобы телегеометрия 120 микрометров и телегеометрия 220 микрометров были доступны со стороны устройства. Затем пробейте входные и выходные отверстия жидкости биопсийным пуансоном 0,75 мм.
Плазменная обработка устройства функциональной стороной вверх вместе с предварительно очищенным стеклянным стеклом и кислородной плазмой 1 миллибар в течение 20 секунд в плазменном очистителе мощностью 300 Вт. Приклейте устройство, плотно поместив узорчатую сторону устройства PDMS на обработанную плазмой сторону предметного стекла. Затем поместите устройство в духовку с температурой 80 градусов Цельсия и верните собранное устройство на 40 минут.
После запекания с помощью шприца промойте устройство фторированной жидкостью для обработки поверхности, чтобы сделать каналы гидрофобными. Затем сразу же запекайте прибор при температуре 80 градусов Цельсия в течение 10 минут, чтобы растворитель испарился. Подготовьте два волокна лазерного возбуждения, сняв изоляцию с последних пяти миллиметров оптических волокон.
Кроме того, подготовьте волокно для сбора флуоресцентного сигнала, сняв изоляцию с последних пяти миллиметров большего оптического волокна. Осмотрите кончики всех волокон под микроскопом. Если кончики не заканчиваются ровной поверхностью, зафиксируйте концы волокнистым накладкой.
Затем прикрепите соединитель лазерного волокна к лазеру мощностью 50 милливатт и 405 нанометров и прикрепите к лазеру одно из волокон сердцевины 105 микрометров. Направьте зачищенный конец датчика измерителя мощности лазера и используйте точную регулировку лазерного соединителя для максимизации мощности лазера. Выполните тот же процесс для настройки другого волокна с помощью лазера мощностью 50 милливатт и длиной 473 нанометра.
Затем установите четырехполосовой фильтр на фотоумножитель с помощью линзовых трубок, блокирующих лазерный свет и пропускающих излучаемую флуоресценцию. Прикрепите оптоволоконную муфту так, чтобы свет проходил через фильтры до попадания на фотоумножитель. Далее присоедините собирающее волокно к муфте для волокна.
Поместите изготовленный микрофлюидный чип на предметное столико инвертированного микроскопа в сочетании с цифровой камерой, способной выдерживать выдержку не менее 100 микросекунд. Осторожно работая с боков, вставьте волокно, связанное с лазером 473 нанометра, в самый дальний восходящий канал 120 микрометров. Следите за тем, чтобы не проколоть основной канал потока.
Затем вставьте волокно, связанное с лазером 405 нм, в самый дальний боковой канал высотой 120 микрометров, обеспечивая расстояние между волокнами 300 микрометров. Наконец, вставьте более крупное волокно, связанное с фотоумножителем, в канал высотой 220 микром, перпендикулярный двум волокнам лазерного возбуждения. Наполните пятимиллилитровый шприц, наполненный HFE 7500, содержащим 2%-ное ионное фторповерхностно-активное вещество, и установите его на входное отверстие масляного распорки устройства обнаружения с помощью трубки PE2.
Затем наполните шприц смешанной эмульсией FITC и синим красителем и установите его на вертикально ориентированный шприцевой насос, соединенный с устройством в качестве входа для обратной инъекции капель с помощью трубки PE2. Подсоедините отрезок полиэтиленовой трубки от выхода устройства к контейнеру для отходов. Затем заправьте устройство, запустив каждый из насосов со скоростью 1000 микролитров в час до тех пор, пока не станет видно, что масло и капли регулярно соединяются в устройстве и стекают вниз по потоку.
Отрегулируйте скорость потока таким образом, чтобы масло со спейсером работало со скоростью 6 000 микролитров в час, а капли — со скоростью 100 микролитров в час, обеспечивая значительное расстояние между каплями, проходящими через зону обнаружения. Затем включите лазеры и запустите программу сбора данных. Затем отрегулируйте усиление фотоумножителя таким образом, чтобы сигналы более чем в 100 раз превышали базовый уровень шума.
Наконец, отрегулируйте мощность лазера так, чтобы все пики дублета были четко видны на одной линейно масштабируемой временной трассе. Капля, протекающая по каналу детектирования, сталкивается с дискретными областями возбуждения перед каждым из оптических волокон, связанных с лазером. Детектирующее волокно регистрирует излучаемую флуоресценцию с временным сдвигом с разделением пиков, которое коррелирует со временем, которое требуется капле для перемещения из одной области возбуждения в другую.
Это избавляет от необходимости дополнительной светофильтрации и отдельных фотоумножителей. Эффективность схемы детектирования была проверена путем детектирования смешанной эмульсии капель, содержащих красители, которые возбуждают на 405 нанометрах и на 473 нанометрах. На этом графике показано четкое разделение между четырьмя типами повторно вводимых капель при потоке с частотой примерно 50 Гц.
Динамический диапазон и абсолютная чувствительность детектора исследовали путем измерения только капель флуоресцеина. Данные показывают способность системы обнаруживать концентрации красителя в диапазоне от 0,1 до 100 наномоляров. После просмотра этого видео у вас должно сложиться хорошее понимание того, как реализовать простую и компактную систему обнаружения флуоресценции с использованием массива вставленных оптических волокон и одного фотодетектора.
View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos
В этой статье представлен компактный и модульный многократный флуоресцентный детектор для микросхемы с капельками. Метод использует массив оптических волокон для временного кодирования многократных данных, что упрощает процесс обнаружения.
This method addresses the need for compact, cost-effective fluorescence detection in droplet microfluidics, enabling high-throughput screening for rare phenotypes and enzyme evolution. By using optical fibers to temporally encode multicolor signals, it eliminates complex optical filtering, reducing system complexity and maintenance burden. This supports early discovery workflows where scalable, reproducible assays are critical for target validation and lead identification.
The method fits within the discovery continuum from assay development to lead identification, providing a reusable detection module for droplet-based screening campaigns.