26 сентября 2016 г.
Протокол обеспечивает методологию солюбилизировать аэробную из гранулированного ила с целью извлечения альгинатлиазной как внеклеточные полимеры (ALE).
Общая цель данного эксперимента состоит в том, чтобы продемонстрировать методологию экстракции для получения структурных внеклеточных полимерных веществ или EPS из биопены, в частности, из аэробного гранулированного осадка. Этот метод может помочь ответить на ключевые вопросы в области гранулированного осадка. Например, понимание процесса грануляции, анализ состава пенополистирола.
Основное преимущество данной методики заключается в том, что наличие гелеобразующих пенящихся полимеров в пенополистироле можно проверить за короткое время. Центрифугируйте гранулированный осадок при температуре 4000 G и четырех градусах Цельсия в течение 20 минут и сцеживайте надосадочную жидкость. Соберите гранулы в гранулы для экстракции.
Разогрейте 150 миллилитров водопроводной воды в стеклянном стакане объемом 1 000 миллилитров на магнитной мешалке до 80 градусов Цельсия. Переложите три грамма гранул в колбу с перегородкой объемом 250 миллилитров и заполните колбу до 50 миллилитров деминерализованной водой. Добавьте в колбу 0,67 грамма декагидрата карбоната натрия, чтобы получить концентрацию карбоната натрия 0,5% от веса на объем.
Поставьте колбу с этой смесью на водяную баню. Накройте колбу и стакан стакана отдельно алюминиевой фольгой, чтобы предотвратить испарение. Перемешивайте смесь в течение 35 минут при 400 об/мин и 80 градусах Цельсия.
Переложите смесь в центрифужную пробирку объемом 50 миллилитров. Центрифугируйте пробирку, содержащую смесь, при температуре 4 000 G и четырех градусах Цельсия в течение 20 минут. Соберите надосадочную жидкость и выбросьте гранулы.
Этап диализа является необязательным для получения структурного пенополистирола из аэробного гранулированного осадка. Но у него есть ряд преимуществ, которые описаны в протоколе. Поместите надосадочную жидкость в диализный мешок с молекулярной массой 3500 дальтон и диализируйте в течение 24 часов против 1000 мл ультрачистой воды.
Меняйте воду для диализа через 12 часов, чтобы усилить эффект диализа. Переложите диализованный экстракт в стеклянный стакан объемом 250 мл и медленно перемешайте экстракцию при 100 об/мин и комнатной температуре. Постоянно контролируйте изменения PH с помощью PH-электрода, добавляя при этом 1 моляр соляной кислоты к конечному PH 2,2 05 для получения эля в кислой форме.
После регулировки PH до 2,2 переложите экстракт в центрифужную пробирку объемом 50 мл и центрифугируйте при температуре 4000 G и четырех градусах Цельсия в течение двадцати минут. Выбросьте надосадочную жидкость и соберите гелеобразную гранулу. Гелеобразная гранула представляет собой эль в кислой форме.
Чтобы получить натриевую форму эля, медленно добавьте в гель 0,5 молярного гидроксида натрия, при этом медленно перемешивайте гель стеклянной палочкой вручную до достижения PH 8,5. С помощью пастеровской пипетки медленно капните экстракт натриевого эля в раствор хлорида кальция. Если экстрагированный пенополистирол обладает ионными гидрогелеобразующими свойствами, образуются каплевидные шарики.
В качестве альтернативы, если экстрагированный ЭПС не обладает ионными гидрогелеобразующими свойствами, экстракт будет диспергироваться в растворе хлорида кальция. Держите гидрогелевые шарики и раствор хлорида кальция в течение 30 минут. С помощью ложки выньте гидрогелевые шарики из раствора хлорида кальция и перенесите их в раствор ЭДТА.
Храните гидрогелевые шарики в 10 мл раствора ЭДТА в течение трех часов при температуре четыре градуса Цельсия. Этот тест демонстрирует один из примеров тестов на стабильность, описанных в протоколе. Следите за тем, есть ли видимый распад бусин во время хранения, чтобы оценить, могут ли бусины выдержать эти условия.
Если экстракция прошла успешно, аэробный гранулированный осадок будет солюбизован после стадии щелочной экстракции, а гранула будет получена после подкисления и центрифугирования экстрагированного пенополистирола. Если экстрагированные ЭПС являются структурными ЭПС и обладают способностью образовывать гидрогели с ионами кальция, то при капании экстрагированного ЭПС в раствор кальция образуются гелевые шарики. Если экстрагировать ЭПС, не обладающие этой студнеобразующей способностью, раствор ЭПС будет диспергироваться в растворе кальция.
После просмотра этого видео вы сможете выполнять экстракцию конструкционного пенополистирола из аэробного гранулированного осадка. Также вы должны иметь возможность проверить гелеобразующую способность полученного EPS с ионами кальция. Мы решили показать эту методологию экстракции, чтобы проиллюстрировать влияние метода экстракции на полученный пенополистирол из аэробного гранулированного осадка.
Кроме того, мы хотели показать, что ни один метод экстракции пенополистирола не является универсально применимым.
Этот протокол описывает методологию для извлечения альгинатподобных внеклеточных полимеров (ALE) из аэробных гранулированных осадков. Процесс извлечения разработан для повышения понимания состава и свойств внеклеточных полимерных веществ (EPS).
Extraction and characterization of structural extracellular polymeric substances (EPS) from aerobic granular sludge enables precise interrogation of biofilm matrix components relevant to bioprocessing and environmental biotechnology. The ability to isolate gel-forming alginate-like polymers (ALE) supports mechanistic de-risking in workflows where EPS composition impacts process stability and material properties. This methodology informs early-stage target validation and standardization for downstream assay development in biopharma and industrial biotech pipelines.
This extraction protocol positions EPS isolation at the interface of early discovery and assay development, supporting workflows from hypothesis testing to preclinical model validation.