29 марта 2017 г.
Липиды, как известно, играют важную роль в клеточных функций. Здесь мы опишем метод для определения липидного состава нейтрофилов, с акцентом на уровень холестерина, как с помощью высокоэффективной жидкостной хроматографии и ВЭТСХ, чтобы получить лучшее понимание основных механизмов формирования нейтрофильных внеклеточных ловушек.
Общая цель данного метода заключается в исследовании изменений липидного состава нейтрофилов при высвобождении внеклеточных ловушек нейтрофилов с помощью тонкослойной хроматографии и ВЭЖХ. Этот метод может быть использован для получения более подробной информации о механизмах, которые участвуют в образовании нейтрофильных внеклеточных ловушек, или сокращенно названном образованием НВЛ. Основное преимущество этой процедуры заключается в том, что она предоставляет информацию о роли липидов в общей функции нейтрофилов с использованием простого для понимания протокола.
Выделение клеток, полученных из человеческой крови, будет продемонстрирована бывшей аспиранткой нашей лаборатории Арианой Нейман. А помогать ей будет Фридерика Ройнер. Подготовку клеток к анализу липидов продемонстрируют Грэм Брогден, постдок в моей лаборатории, и Диаб Хусейн, студент магистратуры по программе биохимии.
Для выделения нейтрофилов, полученных из крови человека, нанесите слой примерно 20 мл крови на 20 мл раствора диатризоата/декстрана натрия вблизи пламени, не смешивая. Центрифуга в течение 30 минут при 470 перегрузках g без торможения. Крайне важно не смешивать кровяную фазу с плотностью в растворе.
После этапа центрифугирования плюс мононуклеарные клетки нужно аккуратно удалять, чтобы избежать загрязнения или неспецифической активации клеток. Удалите мононуклеары и желтоватый слой плазмы. Перенесите полиморфноядерную клетку, или фазу PMN, в новую пробирку объемом 50 мл и заполните ее до 50 мл 1X фосфатным буфером.
Центрифугировать образец в течение 10 минут при 470-кратном g с торможением. Затем удалите надосадочную жидкость и повторно суспендируйте гранулу в 5 мл стерильной воды на пять секунд для лизирования эритроцитов. Немедленно заполните пробирку до 50 мл 1X PBS и центрифугируйте образец.
После удаления надосадочной жидкости гранула должна стать белой. Если он по-прежнему красный, повторите эти действия. Затем повторно суспендируйте гранулу в 1000 микролитрах Roswell Park Memorial Institute, или среде RPMI.
Посчитайте количество клеток с помощью окрашивания Trypan Blue и гемоцитометра под световым микроскопом. Приготовьте клеточную суспензию в RPMI в концентрации два миллиона клеток/мл. Примерно 25 миллионов нейтрофилов могут быть собраны из 20 мл крови.
Для фармакологической обработки нейтрофилов для липидного анализа используют 15 миллионов подготовленных клеток. Инкубируйте образцы в реакционных пробирках в течение двух часов при температуре 37 градусов Цельсия и 5% углекислого газа. После центрифугирования из образцов удаляют надосадочную жидкость и повторно суспендируют клеточную гранулу в 300 микролитрах HBSS.
После повторного центрифугирования образца с теми же параметрами повторно суспендируйте клеточную гранулу в 1 мл раствора хлороформ:метанол в соотношении 1:1. Затем гомогенизируйте повторно суспендированную гранулу с помощью канюли 26 калибра, проталкивая образец внутрь и из шприца объемом 1 мл 10 раз. Чтобы выделить липиды из нейтрофилов периферической крови человека, возьмите подготовленные нейтрофилы и поместите их на лед.
Наведите нейтрофилы пипеткой в стеклянную пробирку объемом 15 мл с завинчивающейся крышкой и уплотнением из ПТФЭ и гомогенизируйте их, встряхивая в течение одной минуты. Затем добавьте 2 мл метанола, а через минуту — 1 мл хлороформа. Встряхнув еще одну минуту, вращайте стеклянные трубки при комнатной температуре и 50 об/мин в течение 30 минут.
Далее гранулируют белковую фракцию, центрифугируя раствор при температуре 7 градусов Цельсия и 1,952 раза г в течение 10 минут. Осторожно сцедите надосадочную жидкость в новую стеклянную пробирку с завинчивающейся крышкой объемом 15 мл, оставив гранулу, содержащую белок. Храните гранулы при температуре 20 градусов Цельсия для будущего количественного анализа.
Добавьте 1 мл хлороформа и подождите одну минуту. Затем добавьте 1 мл дважды дистиллированной воды и переверните стеклянную пробирку с завинчивающейся крышкой с образцом на 30 секунд. После центрифугирования образца, как и раньше, удалите и отбракуйте верхнюю фазу вплоть до мутного слоя, но не включая его.
Высушите образцы в вакуумном концентраторе при температуре 60 градусов Цельсия и храните их при температуре 20 градусов Цельсия до тех пор, пока не потребуется. Для начала залейте до 5 мл каждого раствора в соответствующую стеклянную камеру. Добавьте любой вид фильтровальной бумаги, чтобы увеличить скорость работы в каждой камере.
Предварительно инкубируйте стеклянную пластину 20x10 см HPTLC из силикагеля 60 в первом рабочем растворе. Как только проточный раствор достигнет верхней части пластины, высушите его в течение 10 минут при температуре 110 градусов Цельсия. Растворите липидную гранулу, ранее полученную после сушки вакуумным концентратором, в нужном объеме 1:1 раствор хлороформ:метанол, и выдержите в течение 15 минут при температуре 37 градусов Цельсия до растворения.
Далее с помощью линейки и мягкого карандаша отметьте места загрузки для желаемого количества образцов плюс хотя бы один эталон. Отметьте дистанцию бега примерно на 4 см для первого решения для бега и примерно на 6 см для второго решения для бега. Чтобы загрузить образцы, трижды промойте шприц объемом 10 микролитров в соотношении хлороформ:метанол 1:1 перед загрузкой каждого нового образца.
Загружайте по 10 микролитров каждого образца по каплям, стараясь сконцентрировать образец на как можно меньшей площади. Поместите пластину вертикально в первую камеру с рабочим раствором. Убедитесь, что пластина параллельна стенке стеклянной камеры для достижения равномерной скорости миграции.
Следите за тем, чтобы пластины располагались параллельно задней стенке стеклянных камер и чтобы фронты растворителей не проходили слишком далеко, чтобы обеспечить эффективное разделение липидов. Как только линия растворителя достигнет первой отметки, снимите пластину, высушите ее и поместите во второй раствор. Повторите аналогичные действия для второго и третьего запущенных решений.
Оставьте пластину в растворе до тех пор, пока фронт растворителя не достигнет верхней части пластины. Затем снимите тарелку, и просушите ее при комнатной температуре в течение одной минуты. Поместите пластину в раствор медного купороса на семь секунд.
После тщательной просушки тарелки выпекаем ее в духовке в течение семи минут при температуре 170 градусов Цельсия. Достаньте тарелку из духовки и дайте ей остыть. Чтобы выполнить ВЭЖХ, прикрепите колонку к защитному картриджу на инструменте, и нагрейте его до 32 градусов Цельсия.
Используйте метанол в качестве подвижной фазы при расходе 1 мл в минуту и давлении 65 бар. Установите УФ-детектор на 202 нанометра, чтобы количественно определить количество холестерина в каждом образце. Тщательно промойте аппарат ВЭЖХ перед анализом образцов и установите стандартную кривую холестерина, как описано в текстовом протоколе.
Наконец, повторно суспендируйте образцы в 500 микролитрах хлороформа:метанола 1:1 в стеклянных бутылках янтарного цвета объемом 1,5 мл с завинчивающимися крышками из красного ПТФЭ / белого силикона перед загрузкой их на прибор для ВЭЖХ. Здесь показан липидный профиль нейтрофилов на планшете HPTLC. Липиды можно идентифицировать путем сравнения расстояний миграции с нормой.
Также показана хроматограмма ВЭЖХ, показывающая два больших пика. Первый пик незадолго до двух минут – хлороформ. Второй большой пик через пять минут – холестерин.
Здесь показаны стандартные кривые холестерина, определенные с помощью ВЭЖХ и ВЭЖХ. Стандартная кривая, полученная с помощью ВЭЖХ, является линейной в более широком диапазоне концентраций по сравнению со стандартной кривой ВЭЖХ. После просмотра этого видео у вас должно сложиться хорошее представление о том, как выделять нейтрофилы, полученные из крови человека, и впоследствии анализировать их липидный состав.
При проведении этой процедуры важно не забывать надевать нитриловые перчатки для защиты рук от опасного воздействия хлороформа:метанола, а также работать под вытяжным шкафом. Будущие эксперименты предоставят дополнительную информацию о механизмах образования НВЛ и общих функциях нейтрофилов, которые до сих пор не до конца изучены. Не забывайте, что работа с первичными клетками, полученными из крови человека, требует этического разрешения, а также соответствующих мер предосторожности, таких как работа в соответствующей лаборатории биобезопасности, чтобы избежать риска заражения человеческими патогенами.
Наконец, целью нашего исследования является поиск новых терапевтических мишеней против инфекции на основе врожденной иммунной системы, и особенно липидный состав очень интересен для нас, поскольку он поможет нам понять, почему нейтрофил действует антимикробно против инфекции.
Просмотрите полный транскрипт и получите доступ к тысячам научных видео
В данной статье представлен метод анализа липидного состава нейтрофилов с акцентом на определение уровня холестерина. В работе используются методы ВТcS (высокоэффективной тонкослойной хроматографии) и ВЭЖХ (высокоэффективной жидкостной хроматографии) для более глубокого понимания механизмов образования нейтрофильных внеклеточных ловушек (NET).
Количественное профилирование липидов в нейтрофилах с помощью ВЭТСХ и ВЭЖХ позволяет снизить механистические риски при изучении врожденных иммунных ответов, связанных с инфекцией и воспалением. Данный рабочий процесс повышает прогностическую достоверность при валидации мишеней для путей, включающих образование нейтрофильных внеклеточных ловушек (NET). Интеграция липидомного анализа на этапе поиска предоставляет данные для принятия решений по портфелю иммуномодулирующих мишеней и механизмов взаимодействия хозяина с патогеном.
Данный метод анализа липидов интегрирован в непрерывный цикл исследований — от поиска мишеней до доклинических испытаний — для программ по иммунологии и инфекционным заболеваниям.