Использование ресурсов CyVerse для

10.2K просмотров

Цитируется: 7

10:41 мин.

9 мая 2017 г.

10.3791/55009-v

9 мая 2017 г.

10.2K просмотров

Blake L. Joyce¹^,² , Asher K. Haug-Baltzell³ , Jonathan P. Hulvey⁴ , Fiona McCarthy⁵ , Upendra Kumar Devisetty¹^,⁶ , Eric Lyons¹^,²^,³

¹BIO5 Institute, University of Arizona, ²The School of Plant Sciences, University of Arizona, ³Genetics GIDP, University of Arizona, ⁴Biology Department, University of Massachusetts Amherst, ⁵School of Animal and Comparative Biomedical Sciences, University of Arizona, ⁶CyVerse, University of Arizona

Этот протокол описывает сравнительный рабочий процесс сборки и аннотирования транскриптома de novo для начинающих биоинформатиков. Рабочий процесс доступен бесплатно полностью через CyVerse и подключен к хранилищу данных. Используются командная строка и графические пользовательские интерфейсы, но весь необходимый код доступен для копирования и вставки.