Интегрированная платформа для картирования генома общесистемной Chromatin государств с использованием высокопроизводительный чип последовательности в тканях опухоли

Общая цель данного протокола заключается в непредвзятой идентификации комбинаторных паттернов состояния хроматина в опухолевых тканях и линиях раковых клеток. Этот метод может помочь ответить на ключевые вопросы в области эпигенетики рака, например, как состояние модификации бесплодных гистонов может способствовать генезу опухоли. Основное преимущество этой методики заключается в том, что несколько модификаций гистонов, а также несколько образцов могут быть обработаны как одновременно, так и эффективно.

Сначала вручную диссоциируйте 50 миллиграммов меланомного ткани и два миллилитра сбалансированного солевого раствора Хэнка или HBSS с помощью стерильного бритвенного лезвия. Измельчите ткань на кусочки по три-четыре миллиметра в течение примерно пяти минут в стерильной чашке для культивирования тканей. Переложите тканевый раствор в диссоциаторную трубку и добавьте еще восьмую миллилитров HBSS.