Подход извлечения метаданных для клинических случаев для включения расширенного понимания концепций, биомедицинских

Этот метод может помочь ответить на вопросы о заболеваниях и патологиях, предоставляя структурированный взгляд на симптомы заболевания, диагностические и терапевтические процедуры, а также исходы пациентов из клинических отчетов о случаях заболевания. Основным преимуществом этой методики является то, что она может быть применена к любой когорте пациентов в биомедицинской литературе. Сделать эпидемиологические исследования редких или возникающих состояний более осуществимыми.

Этот метод делает последующие рабочие процессы анализа текста более интуитивно понятными и легкими в реализации. Делая машину текстовых данных читаемой с богатыми метаданными, мы можем создавать клинические отчеты о случаях в качестве обнаружимого, доступного, совместимого и многоразового или справедливого ресурса данных. Центральное место в этом методе является шаблон метаданных, используемый для извлечения всей клинической информации, содержащейся в отдельных клинических отчетах о случаях.

После рабочего процесса, как показано позволит сборка клинического корпуса отчета случаев. Для повышения способности найти, доступность, совместимость и повторное удобство использования медицинского содержания из клинического отчета случае. Включите контекстуальные детали в каждой области, а не предоставляя условия только из контролируемого словаря.

Опустить часто повторяющиеся слова и фразы. В шаблоне аннотации уните конкретные термины, определенные в документе обычно в заголовке в качестве ключевых терминов, разделенных с заоколонном. Обеспечить демографические ценности.

В частности, любые текстовые заявления, описывающие происхождение пациента, включая пол и/или пол, возрастную этническую принадлежность или национальность. Предоставьте географические местоположения, упомянутые в клиническом повествовании, кроме конкретных адресов учреждений. Предоставьте значения образа жизни, включая любые текстовые заявления, описывающие частые действия пациентов или поведение, относящееся к их общему здоровью.

На практике это часто связано с курением или употреблением алкоголя, но может также включать в себя воздействие солнца, диету или частоту конкретных видов физической активности. Предоставьте значения истории болезни, относящиеся к семейной истории, включая любые текстовые заявления, описывающие клинические наблюдения и события, с которыми сталкиваются братья и сестры, родители и другие члены семьи. А также генетические условия и негативные наблюдения.

Предоставьте значения, относящиеся к социальной истории, включая любые текстовые заявления, описывающие фон пациента, не охватываемый в разделах демографии или образа жизни. Заявления могут включать в себя профессиональную историю и социальные привычки. Предоставьте значения, относящиеся к медицинской и хирургической истории пациентов, включая любые текстовые заявления, описывающие медицинские наблюдения, лечение или другие события, которые имели место до начала клинической презентации.

Укажите одну или несколько из следующих 16 категорий системы болезней на основе категорий, используемых в международной статистической классификации заболеваний и связанных с ними проблем со здоровьем, пересмотр 10, как указано в таблице. Предоставьте подробную информацию обо всех признаках и симптомах, включая любые текстовые заявления, описывающие любые медицинские наблюдения признаков или симптомов, начиная с первоначального представления о начале, продолжительности, тяжести или разрешении симптомов, как это предусмотрено. Предоставьте подробную информацию о любых сопутствующих заболеваниях, включая любые термины или фразы, описывающие различные заболевания, присутствующие во время первоначальной клинической презентации.

Предоставьте подробную информацию о всех диагностических методах и процедурах, включая названия медицинских процедур, завершенных для диагностических целей. Такие, как экзамены, тесты и воображая. А также условия, при которых проводились испытания, и соответствующие анатомические локации.

Но без учета каких-либо результатов теста. Предоставьте подробную информацию о диагнозе. Включая любые текстовые заявления, описывающие диагнозы заболевания.

Даже если окончательный диагноз неоднозначный. Предоставьте все лабораторные значения и результаты испытаний. Включая названия диагностических тестов, их значения и условия, при которых проводились тесты.

Использование как численных, так и качественных значений является приемлемым. Предоставьте подробную информацию о патологии. Включая любые текстовые заявления, описывающие все результаты патологических и гистологических исследований.

Такие как грубая патология, иммунология или микроскопия исследований. Некоторые термины могут совпадать с терминами, используемыми в разделе диагностических методов и процедур. Обеспечить все фармакологические методы лечения.

Включая любые текстовые заявления, описывающие медикаментозную терапию, используемую в ходе лечения и когда и как методы лечения были прекращены. Использование общих терминов, таких как антибиотики или конкретные названия лекарств. Обеспечить все интервенционные процедуры.

Включение любых текстовых заявлений, описывающих терапевтические процедуры, используемые в ходе лечения и когда и как процедуры были остановлены, а также любые инвазивные процедуры. Имплантация медицинских приборов или процедур завершена для облегчения других методов лечения. Обеспечить исход пациента.

Включение любых текстовых заявлений, описывающих состояние здоровья пациента по состоянию на конец клинической презентации, описанной в докладе. Включая любые последующие тесты. Затем предоставьте подсчет всех диагностических изображений, цифр, видео или анимации и таблиц.

Включая все подсчеты визуальных средств массовой информации, включенных в доклад в указанном формате. Чтобы различать цифры и изображения, считайте изображения как любые продукты клинической диагностики. Включая фотографии, микро-графики, изображения ритма электрокардиограммы или другие продукты диагностической визуализации.

В то время как цифры должны быть рассмотрены все другие изображения. Как правило, включая участки данных и иллюстрации. В этой таблице приведены примеры двух наборов завершенных аннотирований метаданных клинического отчета.

Первый пример включает макет данных, чтобы проиллюстрировать идеальный формат каждого значения. В то время как второй пример содержит значения, извлеченные из фактического опубликованного клинического отчета о редком состоянии; Акродерматит Энтеропата. Этот метод облегчает как человеческие, так и автоматизированные подходы к аннотации свободных текстовых клинических документов.

Создание структурированного стандартного шаблона метаданных, который гарантирует, что содержащаяся в них информация является доступной и полезной. Метаданные, генерируемые этим методом, поддерживают анализ текста ниже по течению, такой как распознавание имени сущности. Предоставление исследователям возможности извлекать информацию о признаках и симптомах, диагностических методах и процедурах, а также лабораторных ценностях в когорте пациентов, представленной в биомедицинской литературе.