Платформа виртуальных машин для специалистов, не являющихся компьютерами, для использования глубокого обучения для классификации биологических последовательностей метагеномных данных

Различные задачи классификации биологических последовательностей, такие как классификация видов, классификация функций генов и классификация проволочных хозяев, являются ожидаемыми процессами во многих анализах метагеномных данных. Поскольку метагеномные данные содержат большое количество видов и генов Novo, во многих исследованиях необходимы высокоэффективные классификационные организмы. Биологи часто сталкиваются с проблемами в поиске подходящих инструментов классификации последовательностей и нотации для конкретной задачи и часто не могут самостоятельно построить соответствующий организм из-за отсутствия необходимых математических и вычислительных знаний.

Методы глубокого обучения в последнее время стали популярной темой и показывают сильное преимущество во многих задачах классификации. На сегодняшний день разработано много высоко упакованных пакетов глубокого обучения, которые позволяют биологам строить структуры глубокого обучения в соответствии с их собственными потребностями без глубокого знания деталей организма. В этом учебнике мы предоставляем руководство по созданию простой в использовании платформы глубокого обучения для классификации последовательностей без необходимости достаточных математических знаний или навыков программирования.