Высокопроизводительный анализ транскриптома для исследования взаимодействий хозяина и патогена

4K просмотров

Цитируется: 2

14:58 мин.

5 марта 2022 г.

10.3791/62324-v

5 марта 2022 г.

4K просмотров

André Nicolau Aquime Gonçalves¹^,² , Vanessa Escolano Maso³ , Ícaro Maia Santos de Castro²^,³ , Amanda Pereira Vasconcelos³ , Rodrigo Luiz Tomio Ogava²^,³ , Helder I Nakaya²^,³^,⁴

¹Laboratory of Pathology of Infectious Diseases, Department of Pathology, Medical School, University of São Paulo, ²Scientific Platform Pasteur USP, ³Department of Clinical and Toxicological Analyses, School of Pharmaceutical Sciences, University of São Paulo, ⁴Hospital Israelita Albert Einstein

Протокол, представленный здесь, описывает полный конвейер для анализа данных транскриптома РНК-секвенирования от необработанных считываний до функционального анализа, включая контроль качества и этапы предварительной обработки для передовых статистических аналитических подходов.