Обнаружение и выделение Campylobacter spp. из сырого мяса
23 февраля 2024 г.
Кампилобактер является основной причиной бактериального гастроэнтерита пищевого происхождения во всем мире. Несмотря на то, что предприятия принимают меры по снижению распространенности инфекции на своих предприятиях, зараженная продукция постоянно попадает к потребителям. Методика, разработанная за последние двенадцать лет, направлена на устранение ограничений существующих методов выделения и обнаружения Campylobacter spp. из сырого мяса.
Это исследование обеспечивает быстрый и надежный протокол выделения Campylobacter из пищевых продуктов. Он преодолевает ряд недостатков существующих методов и предлагает преимущества для последующего обнаружения и определения характеристик изолята. Ополаскиватели в полевых условиях часто в 10 000 раз больше, чем образцы, используемые для определения безопасности пищевых продуктов, таких как ПЦР.
Необходимо уменьшить погрешность подвыборки, чтобы обеспечить репрезентативность результатов для интересующей совокупности. Этот протокол был использован для выделения более 50 штаммов Campylobacter, которые впоследствии были использованы в геномных исследованиях. Наши данные и анализ способствовали пониманию молекулярных механизмов агентов-хозяев Campylobacter и горизонтального переноса генов.
Такой размер будет способствовать разработке новых терапевтических стратегий для лечения кампилобактериоза. Этот протокол дает возможность сократить количество дополнительных проб в 13 раз, а также сократить время, необходимое для выделения Campylobacter из сырого мяса, на 24 часа или в течение восьмичасового рабочего дня. В будущих исследованиях эта методология может быть применена для выделения Campylobacter не только из пищевых продуктов, но и из образцов окружающей среды.
Это может помочь исключить ложноотрицательные результаты и обеспечить более точную количественную оценку количества загрязненных образцов.
Обзор
Данное исследование посвящено решению проблемы выделения Campylobacter из пищевых продуктов, что имеет критическое значение для предотвращения пищевых гастроэнтеритов. Разработанный протокол значительно повышает эффективность и точность обнаружения данного патогена в сыром мясе.
Основные компоненты исследования
Область исследования
- Безопасность пищевых продуктов
- Обнаружение микроорганизмов
- Изоляция Campylobacter
Теоретическая база
- Campylobacter является одной из основных причин заболеваний, передающихся с пищей, во всем мире.
- Современные методы обнаружения имеют значительные ограничения.
- Улучшенные протоколы позволяют усилить меры по обеспечению безопасности пищевых продуктов.
Используемые методы
- Протокол выделения Campylobacter из пищевых проб.
- Использование курицы в качестве модельного организма.
- Применение ПЦР и селективных сред для детекции.
Основные результаты
- Данный протокол позволяет сократить ошибки при отборе проб и уменьшить время изоляции на 24 часа.
- Для геномных исследований было успешно выделено более 50 штаммов Campylobacter.
- Повышена точность количественного определения загрязненных образцов.
Выводы
- В данном исследовании представлен практический метод повышения эффективности обнаружения Campylobacter в пищевых продуктах.
- Этот подход имеет важное значение для исследований в области общественного здравоохранения и безопасности пищевых продуктов.
Часто задаваемые вопросы
Значимость для промышленности
Эффективное обнаружение и выделение видов Campylobacter из сырого мяса имеет решающее значение для надзора за безопасностью пищевых продуктов и трансляционных исследований пищевых патогенов. Данный протокол повышает прогностическую достоверность оценки загрязнения и обеспечивает надежное выделение штаммов для последующей молекулярной характеристики. Его совместимость с нормативными и геномными рабочими процессами делает его ценным инструментом для биофармацевтических исследований и разработок, а также для программ в области общественного здравоохранения.
Стратегическое применение в исследованиях и разработках биофармацевтики
Первичный поиск и валидация мишени
- Позволяет изолировать различные штаммы Campylobacter для изучения молекулярных механизмов.
- Обеспечивает функциональную валидацию взаимодействий между патогеном и хозяином, имеющих значение для терапевтических исследований.
- Способствует снижению биологических рисков за счет уменьшения ошибки выборочного анализа и количества ложноотрицательных результатов.
- Повышает прогностическую достоверность при определении источника загрязнения.
Скрининг и разработка анализа
- Позволяет подготавливать высококачественные изоляты для мультиплексного qPCR и полногеномного секвенирования.
- Стандартизирует этапы обогащения и фильтрации для воспроизводимого обнаружения патогенов.
- Обеспечивает получение количественных данных для сравнительной оценки загрязнения образцов.
- Обеспечивает возможность масштабируемого скрининга пищевых и экологических образцов для эпидемиологического надзора за патогенами.
Трансляционные и доклинические исследования
- Соответствует задачам поиска трансляционных биомаркеров, обеспечивая возможность геномного анализа изолятов.
- Обеспечивает непрерывность процесса от отбора проб в полевых условиях до проведения лабораторных механизмистических исследований.
- Предоставляет данные с учетом рисков для совершенствования мер по обеспечению безопасности пищевых продуктов.
- Способствует снижению рисков при изучении механизмов действия предлагаемых стратегий вмешательства.
Интеграция конвейеров и рабочих процессов
Данный протокол объединяет этапы от первичного поиска до скрининга и трансляционных исследований, поддерживая рабочие процессы от отбора проб в полевых условиях до молекулярного анализа и геномной характеристики.
- Открывающая биология: Снижает погрешность выборки и обеспечивает надежную проверку гипотез о распространенности патогенов.
- Скрининг: Стандартизирует подготовку проб для высокопроизводительного молекулярного анализа.
- Аналитика: Предоставляет количественные данные о выходе продукта и идентификацию на уровне видов с помощью mqPCR.
- Трансляционные исследования: Обеспечивает геномную и фенотипическую непрерывность для доклинических исследований.
- Корпоративное повторное использование: Предлагает валидированный, соответствующий нормативным требованиям протокол, адаптируемый для различных типов проб и исследований.
Операционное и корпоративное воздействие
- Научная ценность: Повышает прогностическую достоверность и снижает механистическую неопределенность при обнаружении патогенов.
- Операционная ценность: Обеспечивает стандартизированные, воспроизводимые и масштабируемые рабочие процессы выделения и обнаружения.
- Стратегическая ценность: Позволяет быстрее принимать решения о целесообразности дальнейших действий и снижает биологические риски на поздних этапах НИОКР в области безопасности пищевых продуктов.
- Влияние на портфель: Поддерживает приоритизацию стратегий вмешательства и мониторинга с учетом рисков.
Особенности реализации
- Требуется опыт работы с микробиологическими образцами и постановки молекулярных анализов.
- Необходим доступ к центрифугированию, селективным средам и оборудованию для ПЦР в реальном времени.
- Требуется межлабораторная стандартизация процессов обработки образцов и интерпретации данных.
- Метод применим как к пищевым, так и к environmental-матрицам при соответствующей корректировке протокола.
- Эффективность зависит от строгого контроля контаминации и использования валидированных условий обогащения.
Часто задаваемые вопросы по биофармацевтике
Chapters in this video
0:00
Introduction
1:48
Isolating Campylobacter spp. and Selective Enrichment of Campylobacter from Raw Meat
3:14
Isolation and Purification of Campylobacter jejuni and Campylobacter coli from Raw Chicken
4:45
Identification of Campylobacter jejuni and Campylobacter coli Species Isolated from Raw Chicken
