Комплексное пространственное профилирование видонезависимых транскриптомов с помощью стереосеквенирования

1.5K просмотров

10:22 мин.

31 октября 2025 г.

1.5K просмотров

Anna K. Casasent^*¹ , Danielle L. Stolley^*¹ , Basant T. Gamal^*² , Arnold Dahay² , Samuel Mok² , Lidia Rocha³ , Vincent Li³ , Arizona T. Nguyen³ , Boyu Zhang⁴ , Clay T. Brasuell⁴ , Erika J. Thompson⁴ , Thomas Huynh³ , Jared K. Burks¹ , Sammy Ferri-Borgogno²

¹Department of Hematopoietic Biology and Malignancies, The University of Texas MD Anderson Cancer Center, ²Department of Gynecologic Oncology and Reproductive Medicine, The University of Texas MD Anderson Cancer Center, ³Department of Veterinary Medicine & Surgery, University of Texas MD Anderson Cancer Center, ⁴Department of Genetics, The University of Texas MD Anderson Cancer Center

^* These authors contributed equally

В данной статье представлен протокол для выполнения комплексного пространственного транскриптомного профилирования РНК хозяина, вируса, гриба и микробиома из фиксированных формалином парафинных срезов тканей с использованием Stereo-seq, что позволяет картировать различные транскриптомы с высоким разрешением при сохранении архитектуры тканей.