Пространственно разрешённое, интегрированное одноклеточное мультиомное профилирование транскриптома и эпигеномных мишень в замороженных срезах тканей

530 просмотров

09:06 мин.

12 июня 2026 г.

530 просмотров

Ting Zhang¹^,² , Fatemeh S. Farassati¹^,² , Alejandro Stark-Quiroz¹^,² , Yuanhang Liu³ , Nick M. Huynh¹^,² , Yujiro Hayashi¹^,² , Tamas Ordog¹^,² , Jeong-Heon Lee¹^,²^,⁴

¹Enteric Neuroscience Program and Department of Physiology and Biomedical Engineering, Mayo Clinic College of Medicine and Science, ²Gastroenterology Research Unit, Division of Gastroenterology and Hepatology, Department of Medicine, Mayo Clinic College of Medicine and Science, ³Division of Computational Biology, Department of Quantitative Health Sciences, Mayo Clinic College of Medicine and Science, ⁴Division of Experimental Pathology and Laboratory Medicine, Department of Laboratory Medicine and Pathology, Mayo Clinic College of Medicine and Science

В этом исследовании представлен пространственный мультиомный протокол Trekker–CUT&Tag, сочетающий прямое пространственное штрихкодирование срезов ткани с одноклеточным мультиомным анализом. Этот подход позволяет одновременно пространственно разрешать профилирование экспрессии генов на одноклеточном уровне и модификацию гистонов H3K27ac, предоставляя механистические представления о регуляции генов в контексте микроанатомии тканей.