항원은 병원체 표면에 발현되는 단백질로구체적인 서열의 아미노산으로 구성되어 있는데이러한 구성을 항원결정기라고 하며,이 항원결정기는 아미노산의 구조를 결정합니다.교차 반응은뚜렷하게 구분되는 두 가지 항원결정기가동일한 항체에 의해 인지될 만큼 구조적으로 매우 유사할 때 나타납니다.이러한 발생은사람들이 관련있는 알레르겐에 대한 알레르기 면역 반응을 보이는 이유를 설명해줍니다.예를 들면, 호두와 피칸과 같이 말입니다.또한, 교차반응 상호작용은여러가지 종류의 독감 균주를 포함해 관련있는 병원체를 예방함으로써면역력을 증강시킬 수 있습니다.