嗅覚受容体活性化パターンは、臭気の同一性をコードするが、哺乳類の嗅覚受容体に対する臭気物質リガンドを同定公表されたデータの欠如は臭気符号化の総合的なモデルの開発を妨げる。このプロトコルは、嗅覚受容体リガンドおよび受容体活性化の定量化のハイスループット同定を容易にする方法が記載されている。
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嗅覚受容体活性化パターンは、臭気の同一性をコードするが、哺乳類の嗅覚受容体に対する臭気物質リガンドを同定公表されたデータの欠如は臭気符号化の総合的なモデルの開発を妨げる。このプロトコルは、嗅覚受容体リガンドおよび受容体活性化の定量化のハイスループット同定を容易にする方法が記載されている。
匂い物質は、約千マウスおよび400人の受容体ファミリーは、匂い物質の数千人を認識できるように、嗅覚受容体活性化のユニークで重複パターンを作成します。臭気物質リガンドは、ヒト受容体1から11未満の6%について公表されています。データの欠如は、機能的に異種系でこれらの受容体を発現する困難さに起因する。ここでは、ルシフェラーゼレポーターアッセイを使用して、嗅覚受容体活性化のハイスループット評価に続いHana3A細胞における嗅覚受容体ファミリーの大部分を発現させる方法を記載している。このアッセイは、嗅覚受容体のパネルに対する臭気物質の(1)スクリーンパネルに使用することができ; (2)用量反応曲線を経由して匂い物質/受容体相互作用を確認。および(3)受容体変異体のうち、受容体活性化のレベルを比較する。サンプル·データでは、328嗅覚受容体は、臭気物質26に対してスクリーニングした。様々な応答スコアが匂い物質/受容体ペアは選択範囲だったテッドと用量反応でテスト。これらのデータは、画面が用量反応実験に合格する匂い物質/受容体ペアを濃縮するための効果的な方法、匂い物質に対する善意の応答を持っているすなわち受容体であることを示している。したがって、このハイスループットルシフェラーゼアッセイは、哺乳類の嗅覚系における臭気符号化のモデルへ嗅覚受容体に必須な工程を特徴付けるための効果的な方法である。
哺乳類の嗅覚系は、匂い物質の何千もの検出および識別を可能にし、臭気刺激の膨大な数に応答する能力を持っています。嗅覚受容体(ORS)は、嗅上皮12内の嗅細胞によって発現される分子センサーである。哺乳類の匂い認識は匂い物質によるORの差動活性化を介して発生し、または遺伝子ファミリーは、およそ千マウスおよび400ヒト受容体12月16日に、広範囲に及ぶ。嗅覚ニューロンにおける異種細胞でのORの前の機能解析は、さまざまな匂い物質がユニークで認識されていることを示しますが、論理和10,17-20のアンサンブルを重ねてきた。論理和にリガンドを一致させることは嗅覚コードと嗅覚の生のモデルを構築するための不可欠なを理解するために重要です。により、異種システムでの論理和だけでなく、匂い物質と論理和の両方の多数を表現する難しさに、このデータは、Fからのほとんど存在しているield;確かに、人間の論理和未満の6%は、公表リガンド1月11日を持っている。このプロトコルは、付臭剤/ ORの相互作用を特徴づけるルシフェラーゼアッセイの使用が記載されている。このアッセイは、ORのハイスループット特性評価、匂い物質/ ORの相互作用を理解するだけでなく、臭い符号化のモデルを開発するために不可欠であるタスクを可能にします。
ORのハイスループット研究は、三つの主要な課題に直面している。まず、オッズ比は、ERに保持され、その....
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1。Hana3A細胞の培養に
2。トランスフェクションのために細胞をプレーティング
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一次スクリーニングでは、100μMの濃度で26悪臭に対して328 ORをテストしました。この臭気濃度を効果的に既知のリガンド10との論理和の大部分を活性化することが実証されている。まず、正規化されたルシフェラーゼ活性はウミシイタケルシフェラーゼ読み取りによってホタルルシフェラーゼ読み取りを割ることによって計算した。次に、ベースライン値は、各ウェル( 図1)の正規化されたルシフェラーゼの読み取り値から無臭気制御のための正規化されたルシフェラーゼの読み取り値を差し引くことによって計算した。用量応答曲線は48臭剤に対して行わ/ OR対がランダムにベースライン値の範囲にわたって分布した、 図1の有色の棒で示すように論理和が1 mMの1nMのスパニング臭剤の7つの濃度で処理し、得られた応答は、適合させた非線形回帰を使用して、S字曲線に。それは3つの基準を満たした場合に、付臭剤/ ORは、アゴニストと考えられた。(1)標準エラーのlogEC 50未満の1対数単位であった; (2)曲線の上部および下部のパラメーターの95%.......
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同一性は、付臭剤の嗅覚受容体活性化パターンによって符号化されるが、受容体は活性化され、どの程度にしているなどの受容体の活性化パターンは、ヒト嗅覚受容体1-11未満の6%のために知られている。嗅覚受容体を特徴づけるための努力は、嗅覚受容体ファミリー17,23,24,33,34のサブセットだけに彼らの労働集約的な方法や適用性によって制限されています。 Hana3A異種発現系は、試験された嗅覚受容体の大多数の強い発現を支持し、嗅覚受容体活性化19,26,27を監視するためのcAMP応答性ルシフェラーゼレポーターシステムと組み合わせて使用することができる。 96ウェルフォーマットにおけるこのアッセイの性能は、相互作用を確認するために、臭気物質/嗅覚受容体対および用量反応曲線のための有望な候補を決定し、受容体活性化レベルは、AFであるかを評価するための画面を含むハイスループット実験計画の数をサポート内および種間変動によってフェクト。画面内のより高い活性値を有する臭気物質/受容体対は、有意な用量応答を実証する可能性が高い。これらのデータは、このスクリーニング方法、それにより臭気物質リ.......
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著者らは、開示することは何もありません。
この作品はR01 DC013339、R03 DC011373、ルースL.キルシュシュタイン国立研究サービス賞T32 DC000014によってサポートされていました。作品の一部は、NIH-NIDCDコアグラントをP30 DC011735からの資金によって部分的にサポートされていモネル化学感覚受容体シグナルコアを用いて行った。著者は、データ収集のヘルプのために-80 Sezilleに感謝します。
....アクセスが制限されています。このコンテンツを表示するにはログインするか、トライアルを開始してください。
| 名前 | 会社 | カタログ番号 | コメント |
|---|---|---|---|
| Hana3A細胞 | 松波研究室よりご希望 | ||
| RTP1S-pCI | ご要望に応じて | ||
| M3-R-pCI | に応じて | ||
| pCRE-luc | Agilent | 219076 | LUC |
| >pSV40-RL | Promega | E2231 | RL |
| >Minimum Essential Media, Eagle | Sigma Aldrich | M4655 | MEM |
| FBS | Life Technologies | 16000-044 | FBS |
| PBS (Ca2+ および Mg2+) | Cellgro | 21-040-CV | a href="http://cellgro.com/products/balanced-salt-solutions/phosphate-buffered-saline/phosphate-buffered-saline-1x-2.html">PBS |
| Trypsin (0.05% Trypsin EDTA) | Life Technologies | 25300 | トリプシン |
| >CD293 | Life Technologies | 11913-019 | CD293 |
| 96-well PDL ホワイト/クリアプレート | BD BioCoat | 356693 | plates |
| Lipid transfection reagent: Lipofectamine 2000 | Life Technologies | 11668-019 | リポフェクタミン |
| ホタルルシフェラーゼ基質、ホタルルシフェラーゼクエンチャー/Renillaルシフェラーゼ基質:Dual-Glo | Promega | E2980 | dual glo |
| Synergy S2 | BioTek | SLAD | BioTek S2 |
| >マイクロプレート リーダー ソフトウェア: Gen5 データ分析ソフトウェア | BioTek | Gen5 | Gen5 |
| BIOSTACK BioTek | BIOSTACK2WR | BioStack | |
| MultiFlo | BioTek | MFP | MultiFlo |
| 300 μl GripTips | インテグラ | 4433 | GripTips |
| 12.5 μl GripTips | インテグラ | 4414 | GripTips |
| 300 μl GripTips ViaFlo96 | Integra | 6433< | a href="http://www.integra-biosciences.com/sites/us/pipette_tips_griptips_XYZ_4_e.html">XYZ tips |
| >12.5 μl GripTips 384 XYZ | Integra | 6403 | XYZ tips |
| 384ViaFlo | Integra | 6030 | 384ViaFlo |
| >TE buffer | Macherey Nagel | 740797.1 | |
| DMSO | シグマ アルドリッチ | D2650-100ML | DMSO |
| >Forskolin | Enzo Life Sciences | BML-CN100-0010 | FOR |
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