De metabole profiel is een van de belangrijkste kenmerken van cellen en veranderde Bioenergetica zijn nu beschouwd als één van de kenmerken van de kanker1,2,3. Bovendien, wijzigingen in de metabole setup kunnen worden gebruikt in de behandeling van kanker door zich te richten signaaltransductie trajecten of enzymatische machines van kanker cellen,4,,5,6. Kennen van de metabole aanleg van kankercellen is dus een voordeel en kan helpen bij het verbeteren van de huidige therapie.
Er zijn een overvloed van reeds gevestigde methoden die van de metabole activiteit van cellen in cultuur beoordelen kunnen. Met betrekking tot de glycolyse, glucose-opname kan worden gemeten door de radioactieve labeling, met 2-NBDG (2-(N-(7-Nitrobenz-2-oxa-1,3-diazol-4-yl)Amino)-2-Deoxyglucose) of extracellulaire lactaat niveaus gemeten enzymatisch7,8. Vetzuur oxidatie tarief is een andere metabole parameter gemeten door ionenpaar gelabelde palmitaat9,10. Zuurstof verbruik tarief is een methode die veel gebruikte voor het bepalen van de mitochondriale activiteit in cellen11,12, samen met de mitochondriale membraan potentiële evaluatie13,14, ATP/ADP (adenosine 5 '-trifosfaat/5 '-adenosinedifosfaat) ratio meting15 of totaal intracellulaire ATP meting16. Signalering van trajecten bekend te reguleren metabole processen kan worden bepaald door eiwitten ondermeer en kan verbetering van het inzicht van metabole metingen17,18,19.
Echter, al deze methoden meten slechts één of, in het beste geval, een paar metabole parameters in een proeven gelijktijdig. Nog belangrijker is, kan gelijktijdige meting van de zuurstof verbruik tarief (OCR) en de extracellulaire verzuring tarief (ECAR) worden bereikt door de extracellulaire flux-analyse door, bijvoorbeeld, Seahorse XFp Analyzer. OCR is een indicator van de mitochondriale ademhaling en ECAR is vooral het gevolg van glycolyse (we niet voorbijgaan aan CO2 productie mogelijk verheffen ECAR van cellen met hoge oxidatieve fosforylatie activiteit)20. Tot nu toe zijn verschillende celtypes bestudeerd met behulp van deze analysers21,22,23.
Hier beschrijven we het protocol voor de analyse van de extracellulaire flux van primaire ontploffingen (leukemie-cellen afgeleid van de onrijpe hematopoietische fase) van leukemie-patiënten. Tot de beste van onze kennis nog een specifiek protocol voor primaire ontploffing niet beschikbaar.