Peptid Bağları

Amino asitler, peptit bağları yoluyla birbirlerine kovalent olarak bağlanır. Bir peptit bağı, bir amino asidin karboksil grubunu diğerinin amino grubuna bağlar. Peptitler, iki ila elli monomer arasında değişen küçük amino asit zincirleridir.

Bir peptit bağı, bir su molekülünü serbest bırakan bir yoğunlaşma reaksiyonu yoluyla oluşur. Bir amino grubu ve bir karboksil grubu birbirine bağlandığında, bir amid grubunun oluşumu ile sonuçlanır. Peptit bağı, katı bir düzlemsel yapıya sahiptir ve bir çift bağın bazı özelliklerini gösterir.

Bunun nedeni, karbonil üzerindeki çift bağın, karbon-nitrojen peptit bağı ile bir rezonans yapısı olarak hareket edebilmesidir. Bu rezonans, tekli bağın uzunluğunun azalmasına, çift bağın uzunluğunun artmasına neden olur ve grupların peptit bağı etrafında dönmesini engeller. Peptit bağları cis ve trans biçimlerinde mevcut olabilir.

Cis yapısında, alfa karbonları peptit bağının aynı tarafındadır ve trans konformasyonda bağın zıt taraflarındadır. Peptit bağları, prolinin amino grubunun bağ oluşumuna katkıda bulunduğu durumlar haricinde çoğunlukla dönüşüm yapısında meydana gelir. Peptit bağlarıyla bağlanan amino asitler bir N terminaline ve bir C terminaline sah