Protein Aileleri

Protein ailesi, ortak bir genetik atadan evrimleşmiş proteinler grubudur. Bu proteinlerin üç boyutlu yapılarında ve gerçekleştirdikleri işlevlerde benzerlikler vardır. Bir aile içindeki proteinlere homologlar denir.

Aynı tür içinde evrimleşmiş homolog proteinlere paraloglar, farklı türlerdeki homolog proteinlere ise ortologlar denir. Üst aile, bir protein ailesindekinden daha uzak bir ortak atadan evrimleşmiş iki veya daha fazla aileden oluşur. Bir üst ailedeki proteinlerin yapı ve işlevlerinde büyük varyasyonlar vardır.

Protein aileleri, bilinen bir amino asit dizisine sahip ancak şekli veya işlevi bilinmeyen bir proteinin işlevi hakkında bir hipotez geliştirmemize yardımcı olabilir. Bu bilinmeyen proteinin üç boyutlu yapısını tahmin etmek ve işlevini belirlemek için, ailedeki diğer proteinlerle karşılaştırılabilir. Protein aileleri, genellikle bir organizmadaki genetik mekanizmalar bir genin fazladan bir kopyasını oluşturduğunda, yani gen duplikasyonu yoluyla oluşur.

Gen dizileri, genetik atalarından farklı amino asit dizilerini kodladığından, genin orijinal kopyası ve ikinci kopyası mutasyona uğrayabilir ve işlev bakımından farklılaşabilir. Bir aile içindeki proteinlerin dizi özdeş