Kromatin Modifikasyonlarının Yayılması

Kromatin modifikasyonları oluşturmak ve kromozom boyunca büyük bir mesafe boyunca bu kromatin değişikliklerini yaymak için, okuyucu enzimler, yazıcı veya silici enzimlerle işbirliği içinde hareket eder. Yazıcı ve silici enzimlerle benzer şekilde işleyen proses, burada örnek olarak okuyucu ve yazıcı kombinasyonu kullanılarak açıklanmaktadır. Proses, bir transkripsiyonel düzenleyici proteinin belirli bir DNA dizisine bağlanmasıyla başlar.

Bağlandıktan sonra, düzenleyici protein, bir kromozom üzerindeki belirli bir bölgede bir yazıcı enzim kullanır. Yazıcı enzim daha sonra çekirdek histonlara işaretler eklemeye başlar. Bir veya daha fazla komşu nükleozoma işaretler eklendiğinde, bu işaretleri tanıyan bir okuyucu enzimi içeren bir multiprotein kompleksi, yeni değiştirilmiş nükleozoma sıkıca bağlanır.

Bağlanma, multiprotein kompleksinin yazıcı enzimini aktive eder ve onu bitişik bir nükleozomun yakınına konumlandırarak yeni bir işaret eklemesine olanak sağlar. Kompleksin okuyucu ve yazıcı enzimleri birlikte çalışarak, bir dizi okuma ve yazma döngüsünü katalize eder. Bu döngüler, kromatin yoğunlaşması gibi bir kromatin modifikasyonunu bir kromozom boyunca yayar.

Farklı yapılara ve işlevlere sahip olan komşu kromatin bölgeleri, ökromatin ve heterokromatin arasındaki sınır;sınır dizileri adı verilen özel DNA dizileri ile işaretlenir. Bu sınır dizileri, farklı sınırlama etkilerine aracılık ederek heterokromatinin ökromatin içine yayılmasını engelleyen, birçok sınır proteini için bağlanma yeri görevi görür. Örneğin, bazı sınır proteinleri, heterokromatinin yayılması için gerekli olan histon işaretlerini silen, histon değiştirici enzimleri kullanır.

Bazı sınır proteinleri, nükleozom grubuna sıkıca bağlanarak onları örter ve böylece örtülü ökromatini kromatin yayılmasına karşı dirençli hale getirir. Yine bir başka sınır proteini, bir kromatin bölgesini çekirdek gözenekleri gibi büyük ve sabit yerlere bağlar ve heterokromatinin yayılmasını durduran bir bariyer oluşturur.