Ökaryotik Transkripsiyon Aktivatörleri

Transkripsiyon aktivatörleri, RNA polimerazın transkripsiyon başlatmasına imkan vermekten sorumlu proteinlerdir. İki temel bölgeleri vardır;biri DNA'ya bağlanır, diğeri transkripsiyonu aktive eder. DNA bağlanma bölgeleri;sarmal-dönüş-sarmal, çinko-parmak ve lösin-fermuar yapıları gibi yaygın motifler de dahil olmak üzere çeşitli karakteristik yapısal motiflerden birini içerir.

Sarmal-dönüş-sarmal bölgesi, dönüşü temsil eden bir amino asit zinciri ile birleştirilmiş iki alfa-sarmalından oluşur. Sarmallardan biri, DNA dizisini tanımaktan sorumludur ve ana oluğa uyar. Bu proteinler DNA'ya dimerler olarak bağlanır.

Çinko-parmak, bir çinko atomu tarafından bir arada tutulan bir alfa-sarmalı ve iki zincirli bir beta yaprağı içerir. Sarmal, iki histidin ve amino asit zinciri yardımıyla ana oluğa bağlanır. Bir lösin-fermuar, iki monomerden oluşur;bu monomerlerin birbirleriyle etkileşime girerek oluşturdukları Y şekli, DNA'ya bağlanır.

Monomerler, C terminali ucundaki her yedinci pozisyonda lösin içerir;bu lözin, karşı monomer üzerindeki lösin ile etkileşime girer. Temel motiflerden oluşan monomerin N ucu, DNA'ya bağlanır. Aktivatördeki diğer temel bölge olan transkripsiyon aktive edici bölge,