13.2: Genom Kopyalama Hataları

Genome Copying Errors
JoVE Core
Molecular Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Core Molecular Biology
Genome Copying Errors
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

4,127 Views

02:46 min
April 07, 2021

Overview

DNA replikasyonu, her hücre bölünmesi sırasında milyonlarca baz çiftini yüksek doğrulukla kopyalayan iyi gelişmiş bir süreçtir. Bazen kız iplikçiklere yanlış bir taban veya uzun bir yanlış taban dizisi eklenebilir. Hatalar kontrol edilmezse, hücreler hayatta kalmalarını tehlikeye atabilecek birkaç mutasyon biriktirebilir. Bu nedenle, kopyalama hataları üç düzeyde kontrol edilir ve onarılır.

  1. Düzeltme – DNA polimeraz enzimleri, örneğin, 100.000 baz başına 1 yanlış nükleotid verir. Bu hatalar, DNA polimeraz enzimleri tarafından DNA replikasyonu sırasında tespit edilir ve düzeltilir. Bu enzimler, yavru iplikten yanlış bazı eksize eden ve onu doğru nükleotid ile değiştiren 3’→5′ eksonükleaz aktivitesine sahiptir.
  2. Uyumsuzluk onarımı – DNA onarım enzimleri, replikasyon sonrası, ancak mitozdan önce DNA’daki yanlış bazları veya nokta mutasyonlarını onarır.
  3. DNA hasar onarım yolları – DNA ayrıca mutajenlerin neden olduğu fiziksel veya kimyasal hasara eğilimlidir. DNA hasar onarım mekanizmaları hücre döngüsü boyunca çalışır ve nokta mutasyonlarını ve büyük ölçekli genom yeniden düzenlemelerini onarabilir. DNA hasarı şiddetliyse, onarım yolu hücre döngüsünün ilerlemesini engelleyecek ve apoptozu başlatacaktır.

DNA replikasyonu sırasındaki hatalara ek olarak, mutasyonlara transpozon adı verilen mobil genetik elementler de neden olabilir. DNA zinciri üzerinde bir yerden başka bir yere atlayabilen ve yerleştirildikleri yerdeki gen fonksiyonlarını bozabilen küçük DNA tekrar elementleridir. Ayrıca inversiyonlara, gen duplikasyonuna neden olabilir veya yeni genler oluşturabilirler. Transpozonlar iki ana tiptedir: doğrudan DNA olarak transpoze olan DNA transpozonları ve bir RNA ara ürünü yoluyla transpoze olan RNA veya retrotranspozonlar. Bu transpozonların bazıları, kromozom üzerindeki yeni bölgeye yerleştirilmeleri sırasında hedef bölge duplikasyonuna neden olur. Hedef bölgedeki bu tür duplikasyonlar, hücre fonksiyonuna zarar verebilecek gen duplikasyonuna neden olabilir.

Transcript

Bir insan hücresi her bölündüğünde, DNA polimeraz enzimleri, yavru hücrelere iletilmek üzere 3 milyardan fazla baz çiftini yüksek doğrulukla kopyalar.

Bununla birlikte, kopyalanan çok miktarda bilgi nedeniyle, DNA polimeraz bazen kopyalama sırasında hatalar yapar. Örneğin, yeni sentezlenen ipliğe timin yerine sitozin gibi yanlış bir baz eklenebilir.

Bazı durumlarda, orak şeklinde kırmızı kan hücrelerine neden olan beta-hemoglobin genindeki tek nükleotidin GAG’den GTG’ye değişmesi gibi bu tür değişiklikler zararlı olabilir. Bu, kırmızı kan hücrelerinin oksijen taşıma kapasitesini azaltır ve orak hücreli anemiye neden olur.

Genlere ekstra bazlar da eklenebilir veya çıkarılabilir. Bu tür mutasyonlar topluca indeller olarak adlandırılır. Kistik fibrozda, CFTR genine eklenen veya silinen tek bir baz, okuma çerçevesini, genin kusurlu bir proteini kodlayacağı şekilde kaydırabilir. Bu protein, klorür iyonlarını akciğer epitel hücrelerinden dışarı taşıyamaz, bu da kalın, tutkal benzeri mukus birikmesine neden olur ve bu da akciğer enfeksiyonu riskini artırır.

Neyse ki, bu tür kopyalama hataları düşük frekansta meydana gelir – 100.000 baz başına yaklaşık 1 hata.

Ek olarak, bu hataların çoğu, yavru hücrelere geçirilmeden önce DNA polimeraz enzimlerinin düzeltme aktivitesi ile replikasyon sırasında düzeltilir veya DNA onarım enzimleri tarafından replikasyondan sonra düzeltilir. Bununla birlikte, nadir durumlarda, hatalar onarım sürecinden kaçabilir ve bir sonraki nesle geçebilir.

Bununla birlikte, tüm mutasyonlar organizma için zararlı değildir; çoğu mutasyon nötrdür ve bazıları hayatta kalma avantajları sağlayabilir.

Antibiyotik direnci, mutasyon yoluyla ortaya çıkabilecek faydalı bir özelliktir.

Örneğin, antibiyotik florokinolon, DNA girazı adı verilen bakteriyel bir enzime bağlanır ve bakteri üremesini engeller. Bununla birlikte, DNA giraz enzimini kodlayan genler rastgele baz ikameleri biriktirdiğinde, bu, enzimin mutasyona uğramış bir versiyonuyla sonuçlanır. Antibiyotik artık bu mutasyona uğramış enzime bağlanamaz, bu da antibiyotiklerin varlığında bile bakterilerin hayatta kalmasına ve büyümesine yol açar.

Key Terms and definitions​

Learning Objectives

Questions that this video will help you answer

This video is also useful for