$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
HIV-1 antijenik çeşitliliğinin uzun aşı tasarımı için bir engel olmuştur ve bu değişkenliği, özellikle virüs yüzey zarf glikoprotein V3 döngü içinde telaffuz edilir. Biz daha önce V3 döngü taç rağmen, dinamik ve sıra değişken, HIV-1 virüs immünolojik ilgili bir β-saç tokası üçüncül yapısı nüfus boyunca kısıtlı olduğunu önerdi. Önemlisi, farklı V3 döngü taç dizileri binlerce kristalografisi veya NMR ile zor veya imkansız virüslerin çeşitlilik trendleri 3D yapısal karakterizasyonu, HIV-1 virüsleri vardır. Bizim daha önceki başarılı çalışmaları V3 taç 1, 2, katlama, ICM-Pro moleküler modelleme yazılım paketi (Molsoft LLC, La Jolla, CA) erişilebilir ab initio algoritması 3 kullanılan ve önerilen V3 döngü taç , özellikle 10 ila 22 pozisyonları, esneklik ve serbestçe çözüm katlanır kısıtsız bir peptid sanki büyük ölçüde davranmaya, yan gövde uzunluğu yeterince yararlanıyor. + 60,000 herhangi bir bireysel suşu V3 döngü sadece bu bölümü, hızlı ab initio katlama gibi dolaşan HIV-1 suşlarının bilgilendirici olabilir. Burada, R2 suşu V3 döngü eşsiz özellikleri yapısal olarak içgörü kazanmak için katlanmış. R2, hasta serumu ve monoklonal antikorlar, 4, 5 bu zorlanma nötralizasyon için bu hassasiyeti sorumlu olduğu düşünülen nadir bir V3 döngü sırası taşımaktadır. Zorlanma, CD4-bağımsız enfeksiyon aracılık ve nötralize edici antikorlar ortaya çıkarmak için geniş görünür. Biz katlama sonuçlarının değerlendirilmesi katlama gözlenen yapılar R2 gözlenen immünolojik faaliyetleri ile ilişkilendirmek için ne kadar bilgilendirici olabilir göstermektedir.