Method Article

Visual Analitik Teknikleri ile İmmünolojik Veri Analizi kolaylaştırılması

DOI:

10.3791/2397

January 2nd, 2011

In This Article

Summary

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Visual analitik (VA), etkileşimli veri analiz yeni bir yaklaşım. Bu video, yüksek verimli biyolojik deneyler tarafından getirilen veri aşırı sorunu tartışmak ve bu soruna bir çözüm olarak VA teklif. Içinde ve immünolojik veri setleri arasındaki Tableau denilen bir VA aracını kullanarak video analizi göstermektedir.

Abstract

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Visual analitik (VA), interaktif görsel ekran üzerinden büyük veri analiz etmek için yeni bir yol olarak ortaya çıkmıştır. Biz programı ve biyolojik veri setlerinin analizi VA yaklaşımın esnekliği göstermiştir. Immünoloji, bu veri setlerinin Örnekler flow sitometri, LUMINEX veri ve genotipleme (örneğin, tek nükleotid polimorfizmi) verileri içerir. Geleneksel bilgi görselleştirme yaklaşımının aksine, VA, analist, gerçek zamanlı veri arama sürecinde yapmaya izin vererek analistin elinde analiz gücünü tekrar geri kazandırır. Biz, çeşitli VA araçları değerlendirdikten sonra Tableau adlı VA yazılım seçti. İki tür veri setleri içinde ve arasında analiz analiz görevleri eşleştirilmiş analizi olarak adlandırılan bir yaklaşım kullanarak video sunumu gösterildi. VA olarak tanımlanan Eşleştirilmiş analizi, bir VA aracı uzmanı analizi sırasında bir etki alanı uzmanı ile yan yana çalıştığı bir analiz yaklaşımı. Etki alanı uzman verilerin önemini anlıyor ve toplanan verilerin ele sorular sorar. Aracı uzman daha sonra, bu sorulara cevap olabilecek veri desenleri bulmanıza yardımcı olmak için görselleştirme oluşturur. Hipotez üretme ve verilerin hızlı bir görsel ekran arasında kısa bir gecikme süresi VA yaklaşımın en önemli avantajlarından biridir.

Protocol

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

1. Keşif-tabanlı Tableau Analizi

  1. Bir veri kümesi varsa ve içinde veri sütunları arasında çeşitli ilişkiler keşfetmek istiyorsanız.
    1. (Şekil 1) 'verilere bağlanma' tıklayarak veri kümesi alma. Veri kaynağı türünü seçin ve veri kümesi almak için yönergeleri izleyin.
    2. (Şekil 1) önlemler raf dataset sayısal sütunları içerir boyutları raf kategorik sütun içerdiğini emin olun. Bazen teselsül ise konu tanımlayıcı olarak bir boyut sütun tedbir olarak listelenmiş olabilir. Üzerine sağ tıklayarak boyutları değiştirin ve 'Boyuta Dönüştür' seçeneğini belirleyin. Şekil 1, uyaran konsantrasyon seviyesi ve konu tanımlayıcıları olarak dataset kategorik süt....

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Discussion

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Modern biyomedikal araştırma yüksek verimlilik teknolojisinin gelişiyle araştırma verileri daha verimli bir şekilde analiz gerektiren bir patlamaya yol açtı. Visual analitik (VA), analitik akıl interaktif görsel arayüzleri (1) kolaylaştırdı bilim dalıdır. VA yaklaşım bilgisayar tarafından kalıplarını tespit etmek için geleneksel yaklaşımın aksine, insan analisti elinde analitik güç, geri yükler. Visual analitik savunma araştırma (1) ve kasırga eğilimleri (2) gibi çeşitli alanları, araştırma uygulanmıştır. Şimdiye kadar,.......

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Disclosures

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
Çıkar çatışması ilan etti.

Acknowledgements

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Biz proje için bir yorum ve öneriler sunmak için Visual Analytics (VIVA) Vancouver Enstitüsü üyelerine teşekkür etmek istiyorum. Özellikle, biz, John Dereotu, Brian Fisher ve David Darvill teşekkür etmek istiyorum. Ayrıca, verdikleri destek ve yararlı tartışmalar için Kollmann laboratuar üyelerine teşekkür etmek istiyorum. Bu çalışma, Ulusal Alerji Enstitüsü ve Bulaşıcı Hastalıklar, Ulusal Sağlık Hibe N01 AI50023 Enstitüsü tarafından desteklenen; allerjen NCE Hibeler 07-A1A ve 07-B2B ve Michael Smith Sağlık Araştırma Vakfı. TRK Hasta Çocuk Vakfı, Çocuk ve Aile Araştırma Enstitüsü ile işbirliği içinde, Sağlık Araştırma Eğitim Kanada Çocuk Sağlığı Klinisyen Scientist P....

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

References

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
  1. Thomas, J., Cook, K. Illuminating the Path: The Research and Development Agenda for Visual Analytics. , IEEE CS Press. (2005).
  2. Steed, C., Swan, J., Jankun-Kelly, T., Fitzpatrick, P. Guided Analysis of Hurricane Trends Using Statistical Processes Integrated with Interactive Parallel Coordinates. IEEE Symposium on Visual Analytics Science and Technology. , IEEE. Atlantic City. 19-26 (2009).
  3. Saraiya, P., North, C., Lam, V., Duca, K.

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Reprints and Permissions

Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article

Request Permission

Tags

Visual AnalyticsFlow CytometryLuminex DataGenotyping DataPaired AnalysisTableau SoftwareData VisualizationHypothesis GenerationIntegrated Data SetsCytokine Response

Related Articles