1. Caenorhabditis elegans Aeromonas ile Kas Nekrozu Testi
NOT: Kontaminasyonu önlemek için bu adımlar laminar akış başlıkta yapılmalıdır.
- L1 solucanların, Escherichia coli OP50 ile yayılmış zenginleştirilmiş nematod büyüme ortamına (ENGM) tohumlandığı gün, dört Aeromonas suşundan ve E. coli OP50'den her birinden tek bir koloni seçilip 37 °C'de 16 saat boyunca 2 mL Luria-Bertani (LB) suyu ile kültürlendirin. NOT: Burada aşağıdaki bakteri suşları kullanılmıştır: E. coli OP50, C. elegans'ın normal besin kaynağı. A. dhakensis AAK1, ilk tam dizilenmiş patojenik klinik A. dhakensis izolatıdır. A. hydrophila A2-066, A. veronii A2-007 ve A. caviae A2-9307121, Ulusal Cheng Kung Üniversitesi Hastanesi'nden temsil klinik izolasyonlardır.
- Bakteri çorbasının OD600 emilimini ölçün ve bakteri suyu LB çorbasıyla OD600 = 2.0 olarak ayarlanın. 30 μL bakteriyel suyu 6 cm nematod büyüme ortamı (NGM) plakalarına yerleştirin ve yayın. Tabakları gece boyunca oda sıcaklığında kültürleyin.
- L1 solucanlarının L4 aşamasına ulaştığı gün, dört Aeromonas suşundan veya E. coli OP50'den her birine sahip her NGM plakasına 50 solucan aktarılır. NGM plakalarını 20 °C'de kuluçka yapın. Solucanları her 24 saatte bir bakteri içeren yeni hazırlanmış NGM plakalarına aktarın.
- Floresan mikroskopu kullanarak kas görüntüleri alın.
- M9 ortamında 2% agaroz jeline rastgele 10 solucan seçin. Solucanları M9 ortamında agaroz üzerinde 2 μL %1 sodyum azid kullanarak 5 dakikadan kısa süre felç etmekten önce görüntü alın.
- Bir kapak kuşağı yerleştirin ve kas görüntülerini yeşil floresan protein (GFP) filtresiyle şarjlı bağlı cihaz kamerası ile floresan mikroskop üzerinde çekin. Kas görüntülerini L4 evresinden 24, 48 ve 72 saat sonra yakalayın.
Görüntü analiz ve figür hazırlama ile görüntü işleme yazılımı ile çalışmak.
NOT: Puanların ve kas hasar seviyelerinin tanımları Şekil 1'de gösterilmiştir ve kriterler şu şekilde listelenmiştir: eksik kas lifleri için 3 puan; Yırtılmış veya kırılmış kas lifleri için 2 puan; 1 puan bükülmüş kas lifleri için; Sağlıklı kas lifleri için 0 puan.