Örnek toplama ile ilgili tüm prosedürler enstitünün IRB yönergelerine uygun olarak gerçekleştirilmiştir.
1. Krallıklar arası biyofilmlerin yetiştirilmesi
- Streptococcus mutans (S. mutans) DSM 20523 ve Candida albicans (C. albicans) NCPF 3179 kan agar plakalarında aerobik koşullarda 37 °C sıcaklıkta yetiştirilebilir.
- Her organizmadan tek koloni 5 mL beyin kalp infüzyonu (BHI) ile doldurulmuş test tüplerine aktarın. Aerobik koşullarda 37 °C'de 18 saat boyunca yetiştirin.
- Gece kültürlerini 1.200 x g ile 5 dakika boyunca santrifüjleyin. Üst yüzeyi atın, hücreleri fizyolojik tuzlu suyla tekrar askıya alın ve C. albicans (~107 hücre/mL) ve S. mutans (~108 hücre/mL) için OD550 nm 0.5'e ayarlayın. S. mutans süspansiyonunu steril fizyolojik salinle 1:10 oranında seyreltin (~107 hücre/mL).
- 50 μL steril tükürük çözeltisi mikroskopi için optik alt 96 kuyu plakasının kuyularına pipet yapın. 37 °C'de 30 dakika kuluçka yapın. Kuyular 100 μL steril fizyolojik tuzlu suyla 3 kez yıkayın. Kuyular boşaltın.
- Her kuyuya 100 μL C. albicans süspansiyonu ekleyin. 37 °C'de 90 dakika kuluçka yapın. Steril fizyolojik salin ile 3 kez yıkayın.
NOT: Yıkama sırasında kuyuları tamamen boşaltmayın. Aşırı kesme kuvvetlerinden kaçınmak için 20 μL rezervuar bırakın. - Her kuyuya 100 μL ısıyla inaktive edilmiş fetal sığır serumu (56 °C'de 30 dakika boyunca inaktive edilmiş) ekleyin. 37 °C'de 2 saat kuluçka yapın. Steril fizyolojik salin ile 3 kez yıkayın. Kuyular boşaldı, geriye 20 μL bir rezervuar bırakıldı.
- Her kuyuya 100 μL S. mutans süspansiyonu (1.3. adımda hazırlanmış) ekleyin. %5 sakaroz içeren 150 μL BHI ekleyin. 37 °C'de 24 saat veya daha uzun süre kuluçka yapın. Eski biyofilmler yetiştirirken, ortamı günlük olarak taze BHI ile değiştirin. Krallıklar arası biyofilm büyüme aşamasının sonunda, steril fizyolojik tuzlu suyla 5 kez yıkayın.