Bu içeriği görüntülemek için JoVE aboneliğiniz gereklidir. Giriş yapın veya ücretsiz denemenizi bugün başlatın.

Yöntem makalesi

RNA In Situ Hibridizasyonda Prob Hibridizasyonu ve Sinyal Amplifikasyonu: Doku Kesitlerinde Spesifik RNA Dizilerini Tespit Etmek İçin Bir Teknik

3.2K görüntülenme

30 Nisan 2023

Bu makalede

Özet

Kaynak: Outh-Gauer, S. et al. HPV ile İlişkili Baş ve Boyun Kanseri Teşhisi için Bir Araç Olarak Kromojenik İn Situ Hibridizasyon. J. Vis. Uzm. (2019)

Bu videoda, mRNA problarının belirli hedef mRNA'ya hibritleştirilmesini içeren sıralı bir hibridizasyon stratejisi açıklanmaktadır. Prob hibridizasyonunu takiben, histolojik numunelerin RNA-CISH sırasında sinyal-gürültü oranının azaltılması yoluyla çözünürlüğü artırmak için sinyal amplifikasyonu gerçekleştirilir.

Protokol

İnsan katılımcıları içeren tüm prosedürler, insan refahı için kurumsal, ulusal ve uluslararası yönergelere uygun olarak gerçekleştirilmiş ve yerel kurumsal inceleme kurulu tarafından gözden geçirilmiştir.

1. Testi Çalıştırma

NOT: İnkübasyon adımları arasında bölümlerin kurumasına izin vermeyin.

  1. HPV probunun hibridizasyonu
    NOT: Kullanmadan önce herhangi bir yağışı çözmek için probların önceden ısıtıldığından emin olun. Bu adım için, HPV probu yerine, pozitif kontrol için peptidil-prolil izomeraz B (PPIB) veya negatif kontrol için dihidrodipikolinat redüktaz (DAPB) da kullanılabilir (Malzeme Tablosuna bakınız).
    1. Fazla sıvıyı çıkarmak için kızaklara dokunun ve/veya hafifçe vurun ve bunları sürgü rafına yerleştirin. Her bölümü tamamen kaplayacak şekilde ~ 4 damla HPV probu ekleyin.
    2. Tepsiyi bir kapakla kapatın ve 40 °C'de 2 saat fırına koyun.
      NOT: Buharlaşmayı önlemek için, çevirme düğmesinin tamamen kilit konumuna çevrildiğinden emin olun.
    3. Tepsiyi fırından çıkarın ve sürgülü rafı çıkarın.
    4. Her seferinde bir slayt, fazla sıvıyı hızlı bir şekilde çıkarın ve slaytı 1x yıkama tamponu ile doldurulmuş bir boyama kabına batırılmış bir sürgülü rafa yerleştirin.
    5. Slaytları 1x yıkama tamponunda oda sıcaklığında 2 dakika boyunca sürekli çalkalayarak yıkayın. Bunu taze 1x yıkama tamponu ile tekrarlayın.
  2. AMP1, AMP2, AMP3 ve AMP4
    'nin hibridizasyonu. NOT: Bu adımlar, hibridizasyon fırınında hibridizasyonun yanı sıra satın alınan kitten AMP1–AMP4'ü içerir (Malzeme Tablosuna bakın).
    1. Slaytlardaki fazla sıvıyı çıkarmak ve bunları sürgülü rafa yerleştirmek için dokunun ve/veya hafifçe vurun. Her bölümü tamamen kaplamak için ~ 4 damla AMP1 ekleyin.
    2. Tepsiyi bir kapakla kapatın ve 40 °C'de 30 dakika fırına koyun.
    3. Tepsiyi fırından çıkarın ve sürgülü rafı çıkarın.
    4. Her seferinde bir slayt, fazla sıvıyı hızlı bir şekilde çıkarın ve slaytı 1x yıkama tamponu ile doldurulmuş bir boyama kabına batırılmış bir sürgülü rafa yerleştirin.
    5. Slaytları 1x yıkama tamponunda oda sıcaklığında 2 dakika boyunca sürekli çalkalayarak yıkayın. Bunu taze 1x yıkama tamponu ile tekrarlayın.
    6. 1.2.1–1.2.5 adımlarını tekrarlayın, ancak AMP1 yerine ~4 damla AMP2 kullanın ve 40 °C'de 15 dakika inkübe edin. Slaytları 2 kez 2 dakika, her iki seferde de taze yıkama tamponunda yıkayın.
    7. 1.2.1–1.2.5 adımlarını tekrarlayın, ancak AMP1 yerine ~4 damla AMP3 kullanın ve 40 °C'de 30 dakika inkübe edin. Slaytları 2 kez 2 dakika, her iki seferde de taze yıkama tamponunda yıkayın.
    8. 1.2.1–1.2.5 adımlarını tekrarlayın, ancak AMP1 yerine ~4 damla AMP4 kullanın ve 40 °C'de 15 dakika inkübe edin. Slaytları 2 kez 2 dakika, her iki seferde de taze yıkama tamponunda yıkayın.
  3. AMP5 ve AMP6
    'nin hibridizasyonu. NOT: Bu adımlara fırında hibridizasyon değil, oda sıcaklığında hibridizasyon dahildir. AMP5 ve AMP6, satın alınan kitten gelir (Malzeme Tablosuna bakın).
    1. Fazla sıvıyı çıkarmak için kızaklara dokunun ve/veya hafifçe vurun ve bunları sürgü rafına yerleştirin. Her bölümü tamamen kaplamak için ~ 4 damla AMP5 ekleyin.
    2. Tepsiyi bir kapakla kapatın ve oda sıcaklığında 30 dakika inkübe edin.
    3. Her seferinde bir slayt, fazla sıvıyı hızlı bir şekilde çıkarın ve 1x yıkama tamponu ile doldurulmuş bir boyama kabına batırılmış bir sürgülü rafa yerleştirin.
    4. Slaytları 1x yıkama tamponunda oda sıcaklığında 2 dakika boyunca sürekli çalkalayarak yıkayın. Bunu taze 1x yıkama tamponu ile tekrarlayın.
    5. 1.3.1–1.3.4 adımlarını tekrarlayın, ancak AMP5 yerine ~4 damla AMP6 kullanın ve oda sıcaklığında 15 dakika inkübe edin. Slaytları 2 kez 2 dakika, her iki seferde de taze yıkama tamponunda yıkayın.

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Açıklamalar

Herhangi bir çıkar çatışması beyan edilmedi.

Malzemeler

Bu makalede kullanılan malzemelerin listesi
AdŞirketKatalog numarasıYorumlar
HybEZ Fırın (110v) Gelişmiş Hücre Teşhisi A.Ş. 321710
HybEZ sürgülü raf Gelişmiş Hücre Teşhisi A.Ş. 300104
RNAscope 2.5 HD Tespit Reaktifleri-KAHVERENGİGelişmiş Hücre Teşhisi A.Ş.322310Bu kit, amplifikasyon reaktifleri AMP1, AMP2, AMP3, AMP4, AMP5 ve AMP6 ve tespit reaktifleri DAB-A ve DAB-B'yi içerir
RNAscope 3-Plex Negatif Kontrol Probu Gelişmiş Hücre Teşhisi A.Ş.320871DAPB (DAPB)
RNAscope 3-Plex Pozitif Kontrol Probu Gelişmiş Hücre Teşhisi A.Ş.320861PPIB (ÜİB
RNAscope Probu- HPV16/18 Gelişmiş Hücre Teşhisi A.Ş.311121
RNAscope Yıkama Tamponu ReaktifleriGelişmiş Hücre Teşhisi A.Ş.310091Yıkama Tamponu 50X x4
)

Etiketler

Z ekilli RNA Problarn amplifikasyon Sol syonuAmplifikasyon Reajen Kar mHibridizasyon TamponuY kama Sol syonuDoku Kesiti AnaliziHPV Prob Tespiti