Mikroakışkan enkapsülasyon yöntemleri, hücreleri pikolitre ölçekli sulu, monodispers damlacıklar içinde hapsetmek için önceden kullanılmış olup; yüksek kapasiteli tarama, sitometri ve kütle spektrometrisi uygulamalarında, hücreleri dökme sıvı ortamından izole ederek sınırlama sağlamaktadır. Bu çalışmada, sadece tekil hücreleri enkapsüle etmekle kalmayıp, aynı zamanda kontrol edilen boyutlardaki gruplar halinde hem izolasyonu hem de hücreler arası etkileşimleri incelemek amacıyla belirli sayıda hücreyi (burada tek ve çift hücre enkapsülasyonu gösterilmiştir) tekrar eden şekilde hapsetme yöntemini açıklıyoruz. Damlacık oluşturma tekniklerini hücre ve partikül sıralama ile birleştirerek, verimli ve sürekli enkapsülasyon için hücre boyutundaki partiküllerin kontrollü enkapsülasyonunu gösteriyoruz. Sulu bir partikül süspansiyonu ve karışmayan florokarbon yağı kullanarak, bir akış odaklama nozulu ile yağ içinde sulu damlacıklar oluşturuyoruz. Sulu akış hızı, damlacık oluşturma frekansının tam sayı katı frekanslarda nozula ulaşan partiküllerin sıralanmasını sağlayacak kadar yüksektir ve böylece her damlacıkta kontrollü sayıda hücre enkapsüle edilir. Temsili sonuçlar için, hücre sürrogatları olarak 9,9 μm polistiren partiküller kullanılmıştır. Bu çalışma, tek partikül enkapsülasyon veriminin Pk=1 %83,7 ve çift partikül enkapsülasyon veriminin Pk=2 %79,5 olduğunu; bunların sırasıyla %39,3 ve %33,3 olan ilgili Poisson verimlerine kıyasla daha yüksek olduğunu göstermektedir. Tutarlı hücre ve partikül konsantrasyonunun etkisinin verimli enkapsülasyon için büyük önem taşıdığı gösterilmiş ve damlamadan püskürmeye geçişler de ele alınmıştır.
Giriş
Sürekli ortamdaki sulu hücre süspansiyonları, hücrelerin paralel olarak etkileşime girmesine olanak tanıyan ve ortamdan alınan ölçümlerde belirli hücrelerin etkilerini homojenleştiren ortak bir sıvı ortama sahiptir. Hücrelerin piko litre ölçeğindeki damlacıklara yüksek verimli enkapsülasyonu, örnekleri sınırlandırarak damlacıkları çapraz kontaminasyondan korur, örnekler içindeki hücresel çeşitliliğin ölçülmesini sağlar, reaktiflerin ve eksprese edilen biyobelirteçlerin seyreltilmesini önler ve biyoreaktör ürünlerinden gelen sinyalleri amplifiye eder. Damlacıklar ayrıca, hücreler arası sinyalizasyon çalışmaları için damlacıkların daha büyük sulu örneklere veya diğer damlacıklarla yeniden birleştirilmesi imkanını sağlar.1,2 Seyreltmenin azalması, daha yüksek doğrulukta ölçümler için daha güçlü tespit sinyallerinin yanı sıra, potansiyel olarak maliyetli olan örnek ve reaktif hacimlerinin azaltılabilmesi anlamına gelir.3 Hücrelerin damlacıklarda enkapsülasyonu; protein ekspresyonu,4 antikorlar,5,6 enzimler7 ve metabolik aktivitenin8 yüksek verimli tarama için tespitini iyileştirmek amacıyla kullanılmıştır ve yüksek verimli sitometriyi geliştirmek için kullanılabilir.9 Ek çalışmalar, kütle spektrometrisi10 ve hedefli yüzey hücre kaplamaları11 için hücre içeren damlacıkların biyo-elektrospraying uygulamalarını sunmaktadır. Ancak bazı uygulamalar, damlacıklarda enkapsüle edilen hücre sayısını kontrol etme yeteneğinin eksikliği nedeniyle sınırlı kalmıştır. Burada, tek ve iki hücre için kanıtlanmış enkapsülasyon verimliliklerini artıran ve daha fazla sayıda hücrenin enkapsülasyonu için ekstrapole edilebilecek sıralı enkapsülasyon12 yöntemini sunuyoruz.
Monodisper damlacık üretimi sağlamak için, mikroakışkan "akış odaklama" (flow focusing), akımların birleştiği bir nozul kullanarak bir akışkanın (sulu hücre karışımı) başka bir akışkan (sürekli yağ fazı) içerisinde kontrol edilebilir boyutlarda damlacıklar şeklinde oluşturulmasına olanak tanır.13 Belirli bir nozul geometrisi için, damlacık üretim frekansı f ve damlacık boyutu, yağ ve sulu faz akış hızları Qoil ve Qaq ayarlanarak değiştirilebilir. Akış hızları arttıkça, akışlar damlacık üretiminden, sulu fazın nozuldan kararsız bir jet şeklinde çıkışına geçiş yapabilir.14
Sulu çözelti süspansiyon halindeki partiküller içerdiğinde, partiküller nozulda kapsüllenir ve birbirinden izole olur. Rastgele dağılmış bir sulu hücre süspansiyonu kullanılarak damla üretimi için, k hücre içeren damlaların ortalama fraksiyonu Dk, Poisson istatistikleri tarafından belirlenir; burada Dk = λk exp(-λ)/(k!) şeklindedir ve λ damla başına düşen ortalama hücre sayısıdır. "Doğru" şekilde kapsüllenen damlalarda son bulan hücrelerin fraksiyonu Pk = (k x Dk)/Σ(k' x Dk') formülü kullanılarak hesaplanır. İki metrik arasındaki ince fark şudur: Dk, sulu sıvının kullanımı ve kapsülleme sonrası tamamlanması gereken damla ayıklama miktarı ile ilgiliyken, Pk hücre örneğinin kullanımı ile ilgilidir. Örnek olarak, hücre içeren çoğu damlanın sadece tek bir hücre içereceği damlaları kapsüllemek için seyreltik bir hücre süspansiyonu (düşük λ) kullanılabilir. Verimlilik metriği Pk yüksek olsa da damlaların çoğunluğu boş olacaktır (düşük Dk), bu durum boş damlaları uzaklaştırmak için bir ayıklama mekanizması gerektirerek işlem hacmini de düşürecektir.15
Damla oluşturmanın inertiyel sıralama ile birleştirilmesi, rastgele enkapsülasyona kıyasla damla başına daha öngörülebilir hücre sayılarıyla damlaların enkapsüle edilmesi ve daha yüksek verimlilik sağlama imkanı sunar. İnertiyel odaklama ilk kez Segre ve Silberberg tarafından keşfedilmiş olup16 sonlu boyutlu parçacıkların kanal akışında yan denge konumlarına göç etme eğilimini ifade eder. İnertiyel sıralama ise parçacıkların ve hücrelerin pasif olarak eşit aralıklı, şaşırtmalı ve sabit hızlı diziler halinde organize olma eğilimini ifade eder. Hem odaklama hem de sıralama, yeterince yüksek akış hızları (yüksek Reynolds sayısı) ve parçacık boyutları (yüksek Parçacık Reynolds sayısı) gerektirir.17,18 Burada, Reynolds sayısı Re =uDh/ν ve parçacık Reynolds sayısı Rep =Re(a/Dh)2 olarak tanımlanır; burada u karakteristik akış hızı, Dh [=2wh/(w+h)] hidrolik çap, ν kinematik viskozite, a parçacık çapı, w kanal genişliği ve h kanal yüksekliğidir. Ampirik olarak, tamamen sıralanmış diziler elde etmek için gereken uzunluk, Re ve Rep arttıkça azalır. Yüksek Re ve Rep gereksinimlerinin (bu çalışma için sırasıyla yaklaşık 5 ve 0,5 mertebesinde), damla oluşturma nozulunda jetlenmeyi önlemek amacıyla sulu akış hızlarının düşük tutulması gerekliliğiyle çelişebileceği unutulmamalıdır. Ek olarak, yüksek akış hızları hücreler üzerinde daha yüksek kayma gerilmelerine yol açar ve bu durum bu protokolde ele alınmamıştır. Önceki sıralı enkapsülasyon çalışması, bu çalışmadaki akış koşullarına benzer koşullar altında tekli enkapsüle edilmiş HL60 hücrelerinin %90'ından fazlasının hücre membranı bütünlüğünü koruduğunu göstermiştir.12 Bununla birlikte, farklı hücre tiplerine ve akış parametrelerine ekstrapolasyon yapılırken kayma gerilmelerinin büyüklüğü ve zaman ölçeklerinin etkisi dikkatle değerlendirilmelidir. Hücre sıralama, damla oluşturma ve hücre canlılığına ilişkin sulu akış hızı kısıtlarının örtüşmesi, tekli ve çoklu hücrelerin kontrollü enkapsülasyonu için ideal bir operasyonel rejim sağlar.
Parçacıklar arası tren aralıklarını ele alan çok az çalışma olduğu için,19,20 bu aralığın belirlenmesi en kolay şekilde ampirik olarak yapılır ve kanal geometrisine, akış hızına, parçacık boyutuna ve parçacık konsantrasyonuna bağlıdır. Bununla birlikte, trenler arasındaki eşit yan açıklık, hücrelerin öngörülebilir ve tutarlı zaman aralıklarıyla ulaştığı anlamına gelir. Damlacık oluşumu, sıralı hücrelerin nozula ulaştığı hızla aynı oranda gerçekleştiğinde, hücreler damlacık içine kontrollü bir şekilde enkapsüle edilir. Bu teknik, önceki çalışmalarda rapor edilen 60-160 Hz4,15 civarındaki enkapsülasyon hızlarına kıyasla önemli bir gelişme olan 15 kHz12 mertebesindeki verimlerle tekil hücreleri enkapsüle etmek için kullanılmıştır. Kontrollü enkapsülasyon çalışmasında, damlacıkların %80'inden fazlası yalnızca bir hücre içermiş olup, bu durum ortalama %40'tan daha az verim öngören Poisson (rastgele) istatistiklerine göre anlamlı bir verimlilik artışıdır.12
Önceki kontrollü enkapsülasyon çalışmasında,12 damla başına ortalama partikül sayısı λ, tek hücreli enkapsülasyon sağlamak üzere ayarlanmıştı. Akış hızlarının ayarlanması yoluyla, λ değeri damla başına istenen hücre sayısına eşit veya yakın olduğunda, damla başına herhangi bir sayıda hücrenin verimli bir şekilde enkapsüle edilebileceğini varsayıyoruz. Tek hücreli enkapsülasyon, uyaranlara karşı bireysel hücre yanıtlarının belirlenmesinde değerliyken; çoklu hücre enkapsülasyonu, kontrollü sayı ve türdeki hücrelerin etkileşimiyle ilgili bilgiler sağlar. Burada, pasif bir atalet sıralama kanalı ve damla üretim nozulu kullanarak çoklu hücrelerin kontrollü enkapsülasyonu için bir protokol, polistiren mikroküreler kullanılarak elde edilen temsili sonuçlar ve tartışma sunuyoruz.