Journal of Visualized Experiments (JoVE) dergisinin Nisan sayısı, University of Miami of Ohio'dan bir laboratuvarın Antarktika'da kalıcı olarak buzla kaplı tuzlu bir göl olan Bonney Gölü'ne yaptığı yolculuğu konu alan bir makale içermektedir. Işığın, sıcaklığın ve karbon kaynaklarının çok kısıtlı olduğu buz altındaki zorlu koşullarda çok az organizma hayatta kalabilir. Protistler adı verilen tek hücreli mikroorganizmalar, Bonney Gölü'nün altında yaşayan temel mikrop sınıfını oluşturur ve fotosentez yoluyla karbonu yaşam döngüsüne dahil etme yeteneğine sahiptirler.
Uygun örnekleme sahası belirlendikten sonra yazarlarımız, gölün kimyasal olarak tabakalı su sütunundaki çeşitli derinliklerden örnekler toplayabilmek için buzu delerler ve eritirler. Toplanan örnekler, filtrasyon ve stabilizasyon işlemleri için bir saha laboratuvarına götürülür. İşlemden sonra, su örneğinde bulunan mikroplar ileri deneyler için kültüre edilir. Örneğin yazarlarımız, zenginleştirme kültürlerinin fotosentetik aktiviteyi koruduğunu göstermektedir ve gelecekteki deneylerin, protist fizyolojisinin yanı sıra bu tür organizmaların küresel jeokimyasal döngüyü nasıl etkileyebileceğinin daha iyi anlaşılmasına yardımcı olması beklenmektedir.
Klinik ve Translasyonel Tıp alanında JoVE, jinekolojik tümörlerin tedavisi için stereotaktik vücut radyoterapisine (SBRT) odaklanıyor. SBRT, tümörleri biyolojik olarak inaktive etmek için robotik bir kola monte edilmiş bir lineer hızlandırıcı tarafından iletilen radyasyona dayanan, minimal invaziv bir kanser tedavisi yöntemidir.
Case Medical Center'dan yazarlarımız, bilgisayarlı tomografi görüntülemesine dayanarak altın yumuşak doku fidusyal markerlarının kanser hedefinin etrafına çeşitli derinliklere nasıl yerleştirildiğini açıklıyorlar. Bir tedavi planlama seansı sırasında CT ve PET görüntüleri alınır ve ardından ortak kaydedilir (co-registration). Bu görüntülerle yönlendirilen radyasyon ve jinekolojik onkologlar, terapi sırasında hedeflenecek kanser hacimlerini belirler ve zarar görmemesi gereken çevre normal yapıların konturlarını çıkarırlar. Tedavinin başlangıcında, bir hedef lokalizasyon sistemi, düzlem dışı radyografik görüntüleme yoluyla fidusyal markerları tespit eder ve marker konumu daha önce elde edilmiş görüntüleme verileriyle karşılaştırılır.
Tedavi sırasında, radyasyonun doğru şekilde iletilebilmesi için hastanın solunum paternini fidüsyal işaretçilerin konumuyla ilişkilendirmek amacıyla ışık yayan diyotlar hastanın hareketlerini takip eder. Hasta immobilizasyonu ile ilişkili komplikasyonların üstesinden gelen yazarlar, stereotaktik vücut radyoterapisi prosedürlerinin, çevre yapılara verilen dozu sınırlarken hedef hacme radyasyonu hassas bir şekilde iletebildiğini göstermektedir.
Biyomühendislik bölümümüzde JoVE, ipekböceği kozalarından biyouyumlu altlıkların hazırlanmasını konu alan bir makale sunuyor. İlk olarak, kozalar kontaminasyon açısından taranır ve ipek ekstraktı üretilecek şekilde işlenir. Ekstrakt, yüzeyinde kuruyan ipek filmde bir desen oluşturmak üzere tasarlanmış bir PDMS kalıbının üzerine yerleştirilir. Kuruduktan sonra ipek film, filmi şeffaf hale getirerek mikroskopi için mükemmel kılan ve su tavlaması (water annealing) olarak adlandırılan bir işleme tabi tutulur. Filmler üzerine hücre ekimini takiben yazarlarımız, mikro desenli ipek altlık üzerindeki hücre migrasyonunu takip etmenin, daha geleneksel doku kültürü yüzeylerindeki kadar kolay olduğunu göstermektedir. İpek filmlerin biyouyumluluğu ve kimyasal ile yapısal olarak modifiye edilme potansiyeli, onları tıbbi cihaz tasarımı gibi in vivo uygulamalar için cazip aday malzemeler haline getirmektedir.
Şaşırtıcı bir şekilde, primer nöronal kültür İmmünoloji ve Enfeksiyon bölümümüzde yer alıyor; çünkü bu Nisan ayında JoVE, herpes simplex virüs latansı ve aktivasyonunu incelemek için kullanılan yenilikçi bir primer sempatik nöron kültür sistemini belgeliyor.
Periferik nöronlar, reaktivasyon olaylarının kaynağı olan herpes virüsü için rezervuarlar gibi işlev görürler. Periferik nöron kültürü oluşturmak için, embriyonik farelerden superior servikal ganglionlar izole edilir ve sindirim ile disosyasyon işlemlerinin ardından 96 kuyucuklu plakalara ekilir. In vitro sürecinin yaklaşık 6. gününde, viral-GFP füzyon proteini kodlayan herpes virüsleri, litik replikasyonun bir inhibitörü ile birlikte hücrelere eklenir. İnhibitör geri çekildiğinde, latent virüs reaktive olacak ve GFP ekspresyonu floresan mikroskopi ile gözlemlenebilecektir. GFP floresansı sergileyen kuyucukların sayısı sayılırak, küçük moleküllerin veya gen susturucu oligonükleotidlerin viral reaktivasyonu baskılama veya tetikleme yetenekleri test edilebilir; bu da söz konusu testi, HSV-1 enfeksiyonunun yönetimine yardımcı olacak yeni terapötiklerin keşfi için potansiyel bir araç haline getirir.
Bu kısa özet, JoVE'nin Nisan ayında yayınlayacağı elli makaleden yalnızca dördünü betimlemektedir. Diğer dikkat çekici yayınlar arasında röntgen bilgisayarlı tomografi kullanılarak sıçanlarda obeziteyi nicelleştirme, zebra balığı kalbinde miyokard enfarktüsü oluşturma ve eksize edilmiş omuriliğin retrograd etiketleme yöntemleri yer almaktadır. Takipte kalın.