$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
1. İmmünofloresan
Aşağıdaki protokol, transkardiyal perfüze farelerden (20 ml PBS, 0.1 mol/litre, pH 7.4, ardından PBS'de %4 50 ml soğutulmuş paraformaldehit) elde edilen koronal beyin kriyoseksiyonları üzerinde gerçekleştirilir. Perfüzyondan sonra, beyinler dikkatlice çıkarılır ve kriyoproteksiyon için gece boyunca 4 ° C'de PBS'de% 30 sükroza aktarılır. Beyinler daha sonra şişelere kapatılmadan ve kullanıma kadar -70 ° C'de saklanmadan önce 3 dakika boyunca - 45 ° C'de izopentan içine daldırılarak hızla dondurulur. Koronal beyin kriyoseksiyonları (20 μm) seri olarak kesilir ve immünofloresan protokolü 11, 6'ya tabi tutulur.
Kullanmadan önce tüm reaktifleri ve numuneleri oda sıcaklığına getirin. Sunulan çalışma antikor ve serum seyreltmelerinin, en iyi performansı elde etmek için yapılan denemelerden kaynaklandığını lütfen unutmayın. Farklı antikorlar ve serum kullanıldığında, protokolün doğrulanması gerekir.
Hem anti-CD11b hem de anti-CD68 primer antikorları sıçanlarda yapıldığından, sıçan karşıtı Alexa 546'nın çapraz sinyalini önlemek için, yüksek miktarda anti-CD11b seyreltmesi ve ardından TSA kiti (Cy5 Tyramide) ile floresan sinyal amplifikasyonu kullandık. Adım 1.17 dışında açıklanan protokolü uygulayarak ve tablo 1'de bildirildiği gibi en az 7 farklı anti-CD11b seyreltmesi kullanarak anti-CD11b için en uygun çalışma seyreltmesini oluşturduk. Sonuç olarak, 1: 30.000, aşağıdakileri başaran tek seyreltme olarak seçilmiştir: 1) uyarma dalga boyu 646 nm'de Cy5 ile görünür sinyal; 2) 532 nm uyarma dalga boyunda Alexa 546 ile sinyal yok. Bu şekilde, Alexa 546 floresan sinyali seçici olarak CD68 ekspresyonu ile ilişkilendirilir.
Anti-CD11b ve anti-CD68 antikorları için optimal dilüsyonlar, doku tipine bağlı olarak değişebilir ve ortak etiketleme protokolünü başlatmadan önce tanımlanmalıdır.
- Beyin kriyoseksiyonlarını PBS ile iki kez yıkayın.
- % 1 H2O2 içeren PBS'de kriyoseksiyonları 5 dakika inkübe edin (floresan amplifikasyonun yaban turpu peroksidaz, streptavidin-HRP ile inkübasyona ihtiyacı olduğundan adım gereklidir, bkz. adım 1.12).
- Kriyosekeseksiyonları 2x PBS ile yıkayın.
- %10 NGS ve %0.3 Triton içeren PBS'de kriyoseksiyonları 60 dakika inkübe edin.
- Birincil Ab Rat anti-CD11b [1:30.000], %10 NGS ve %0.3 Triton içeren PBS'de kriyoseksiyonları gece boyunca 4 ° C'de inkübe edin.
- Kriyokesitleri 2x (5 dakika) PBS ile yıkayın.
- Biyotinile edilmiş ikincil anti-Rat Ab [1:200] ve% 1 NGS içeren PBS'de kriyoseksiyonları 60 dakika inkübe edin.
- Kriyosekeseksiyonları 2x PBS ile yıkayın.
- Kriyosekesyonları TNT ile yıkayın (Tris-HCl, NaCl, Ara: 0.1 M TRIS-HCl, pH 7.4, 0.15 M NaCl, %0.05 Tween 20).
- Kriyoseksiyonları TNB'de 1,5 saat inkübe edin (Tris-HCl-NaCl-Bloke edici tampon: 0,1 M TRIS-HCl, pH 7,4, 0,15 M NaCl, uygun kitten %0,5 Bloke edici reaktif (reaktifler tablosuna bakınız)).
- Kriyoseksiyonları TNT ile 3 kez yıkayın.
- Streptavidin HRP içeren TNB'de kriyoseksiyonları inkübe edin [1:100].
- Kriyoseksiyonları 3x TNT ile yıkayın.
- Kriyoseksiyonları Siyanin 5 Tyramid [1:300] içeren Amplifikasyon Seyrelticisinde 8 dakika inkübe edin.
- Kriyokesitleri 3x PBS ile yıkayın.
- % 10 NGS ve% 0.1 Triton içeren PBS'de kriyoseksiyonları 60 dakika inkübe edin.
- Kriyoseksiyonları gece boyunca 4 °C'de primer Ab Rat anti-CD68 [1:200], %3 NGS ve %0.3 Triton içeren PBS'de inkübe edin.
- Kriyokesitleri 3x PBS ile yıkayın.
- Florkonjuge ikincil Ab, Alexa 546, anti-Rat [1:500] ve% 1 NGS içeren PBS'de kriyoseksiyonları 60 dakika inkübe edin.
- Kriyokesitleri 3x PBS ile yıkayın.
- Hoechst 1 μg / ml içeren PBS'de kriyoseksiyonları 10 dakika inkübe edin.
- Kriyokesitleri 3x PBS ile yıkayın.
- Kriyoseksiyonları Prolong Gold'a monte edin.
2. Konfokal Mikroskopi ile Üç Boyutlu Görüntülerin Elde Edilmesi
Burada kullanılan mikroskop, 3 lazer çizgisine sahip bir konfokal tarama ünitesi FV500 ile donatılmış bir IX81 mikroskobu idi: Ar-Kr (488nm), He-Ne kırmızı (646nm) ve He-Ne yeşil (532nm) ve bir UV diyotu.
- Uyarılacak floresan boyaların dalga boylarına bağlı olarak uyarma lazerlerini seçin (Cy5, CD11b için He-Ne kırmızısı; Alexa546, CD68 için He-Ne yeşili ve Hoechst, çekirdekler için UV diyotu).
- Işık sinyali toplama için en iyi dikroik ayna kombinasyonunu seçin.
- Görüntü çözünürlüğünü en az 800 x 600 piksel olarak ayarlayın.
- Epi-floresan kullanarak bir ilgi alanı belirleyin ve büyütmeyi kademeli olarak 40X objektife yükseltin.
- Lazer Tarama Mikroskobu (LSM) modalitesine geçin.
- Her kanal için fotoçoğaltıcıyı (PMT) ve kazancı ayarlamak için tekrarlayan taramalar yapın. Kurulumu kolaylaştırmak için lazerler ayrı ayrı açılabilir. İstenmeyen, spesifik olmayan sinyalleri önlemek için kazancı mümkün olduğunca düşük tutun.
- Tekrarlayan tarama çalışırken, z ekseninin alt ve üst uçlarını tanımlamak için odak kontrolünü hareket ettirin (toplam z ekseni uzunluğu = 10 μm).
- Tekrarlayan taramayı durdurun.
- Adım boyutunu tanımlayın. Z ekseni üzerinde standart bir 0.225:1 boyut oranı elde etmek için piksel boyutuna (1 μm) mümkün olduğunca yakın olmalıdır.
- Kalman filtresini en az 2 kez etkinleştirin.
- Taşma efektlerini önlemek için sıralı tarama modunu etkinleştirin.
- Z ekseni boyunca yarıya kadar gidin ve bir xy sıralı tarama çalıştırın. PMT ve kazanç kurulumunu kontrol edin (iyi sinyal/gürültü oranı). Tatmin edici değilse, adım 2.6'yı tekrarlayın.
- xyz alımını çalıştırın.
- Verileri multitiff dosyası olarak dışa aktarın. Her multitiff dosyası tipik olarak 3 renk kanalı (mavi, yeşil ve kırmızı) ve 44 odak düzlemi içerir.
3. Konfokal Edinimlerin Üç Boyutlu Görünümü ve Üç Boyutlu İşleme
Multitiff dosyalarını Imaris yazılımına yükleyin ve aşağıdaki gibi işleyin:
- Yazılımı açın.
- Aşma görünümünü seçin.
- Multitiff dosyasını yükleyin.
- Her kanal için istediğiniz rengi seçin.
- Ekran ayar panelindeki minimum değeri artırarak arka plandaki gürültüyü kaldırın. Her kanalı ayrı ayrı ayarlayın.
- Bölüm görünümüne gidin. Birlikte yerelleştirmeyi (sarı pikseller) aramak için z ekseni boyunca hareket edin.
- Z ekseni boyunca kolokalizasyonun mevcut olup olmadığını (yani katı bir nesneye ait olup olmadığını) görmek için sarı bir alana tıklayın. Z ekseni çıkıntıları şeklin sağ ve alt kısmında görülebilir.
- Anlık görüntü alın.
- Geçiş görünümüne geri dönün.
- Bir hücreyi veya hücre kümesini izole etmek için 3B'yi kırpın.
- Ekran ayar panelinde bir kanal seçin.
- Aşma/yüzeyler algoritması oluşturucusunu seçin. Algoritma adımları:
- Kanal seçin.
- Eşiği tanımlayın (ekran ayarlama panelinde aynı minimum değeri kullanın).
- Yeniden boyutlandırmayı tanımlayın.
- Düzgünleştirmeyi tanımlayın (en iyi = 0,200).
- Renk görünümünü tanımlayın.
- Algoritmayı sonlandırın.
- Her kanal için 3.12 adımını tekrarlayın.
- Ekran ayar panelinde floresan kanallarının seçimini kaldırın ve üç yüzeyi de seçin.
- En iyi görünümü bulmak için sesi hareket ettirin.
- Anlık görüntü alın.