1. Arenavirus Kurtarma Transfeksiyon
Bizim kurtarma sistemi nükleoprotein (NP) ve RNA-bağımlı RNA polimeraz (L), RNA kopyalamasının ve arenavirus genomunun gen ekspresyonu için gerekli olan viral Trans-etkili faktör kodlayan polimeraz II proteini ifade plazmid hem de kullanımı dayalı 7, 19, ve hücresel S RNA polimeraz I (pol I), ve L, antigenome RNA türlerinin 7 ile hücre içi sentez, doğrudan sahip plazmid. Bizim çalışmalarımız sırasında bir promotör ve terminatör sıçangil dizileri (Şekil 2), insan polimeraz kullanan pCAGGs proteini tavuk β-aktin promoteri ve polyadenylanation (PA) sinyal dizileri kullanan ekspresyon plazmidi, ve insan pol I plazmit kullanmak . S ve L RNA segmenti HPOL-I ile transkripsiyonu genomik RNA segmenti üzerine üretimi için izin vermek için bir antigenomik yönde HPOL-I plazmid içine klonlanır. Vahşi-ty kurtarma içinPE rekombinant LCMV (rLCMV) ve içten # 1 (rCandid # 1) pCAGGs NP ve her bir virüs, insan L kendi poli-I S ve L RNA segmenti (Şekil 3) ile birlikte ko-transfekte edilmiştir. Rekombinant trisegmented LCMV (r3LCMV) ve 1. (# 1 r3Candid) Candid nesil benzer bir protokol izledi ama S segment iki farklı pol-I S plazmid, her kodlama farklı bir muhabir gen bölündü: biri, NP açık okuma çerçevesi (ORF) yeşil floresan proteini (GFP) raportör geni (HPOL-I S GFP / GP) ve bir diğerinde ise, viral glikoprotein öncü (GPC) ORF Gaussia lusiferaz (Gluc) raportör geni ile değiştirilir ile değiştirildi (HPOL-I S NP / Gluc). Protokolünün bir şematik gösterimi Şekil 4 'de gösterilmiştir. Aşağıdaki transfeksiyon, enfeksiyon protokolü 6 kuyulu plakalar için kurulmuştur.
- OptiMEM-Lipofectamine 2000 (LPF2000) karışımı: OptiMEM medya 250 ul hazırlayın ve, bağlıüzerinde virüs kurtarma, 10 - transfeksiyon başına LPF2000 12 mg (1 ug / ml) (Tablo 1). DNA mikrogram başına 2.5 mikrogram LPF2000 bir oranı tavsiye edilir. Oda sıcaklığında 10 dakika - 5 inkübe edin. Bununla birlikte, ayrı bir mikrosantrifüj tüpü (adım 1.2) elde edildi ve plazmidin transfeksiyon karışımı hazırlandı.
- Plazmid DNA transfeksiyon karışımı: Her virüs kurtarma için önerilen miktarda (bkz. Tablo 1) kullanarak mikrosantrifüj tüp plazmid transfeksiyon kokteyl hazırlayın. OptiMEM ile 50 ul son hacim getirin.
- OptiMEM-LPF2000 plazmid-DNA karışımı: plazmid DNA transfeksiyon karışımı (adım 1.2) içine OptiMEM-LPF2000 karışımı (adım 1.1) 250 ul ekle. Oda sıcaklığında 30 dak - 20 bu karışım inkübe edin. Bu arada hazırlamak ve transfeksiyon reaksiyon başına 1 x 10 6 Vero hücreleri saymak. Vero hücreleri süspansiyon içinde transfekte edilir.
- Vero hücreleri hazırlanması: Vero CelLs 100 mm çanağı kültürlenmiştir. Başlamadan önce, 37 ° C ile 1x PBS, DMEM,% 10 FBS,% 1 PS medya ve tripsin-EDTA karışımı getirmek
- 1x 5 ml PBS ile iki kez, hücreler yıkayın.
- Tripsin-EDTA 1 ml hücre Trypsinize ve hücreler çıkartılma (yaklaşık 5 dakika) kadar bekleyin. Nazik belki tam olarak yemekler hücreleri ayırmak için gerekli kılavuz çekme.
- Dikkatli bir şekilde, bir 15 ml santrifüj tüpüne DMEM% 10 FBS% 1 PS 10 ml hücre süspansiyon haline getirin.
- Bir santrifüj içinde 1000 rpm'de 5 dakika için hücreler santrifüjleyin.
- DMEM% 10 FBS,% 1 PS 10 ml hücrelerin yeniden süspanse edin ve bir hemasitometre kullanılarak hücre sayımı, 1 x 10 6 hücre / ml konsantrasyonu ayarlanır. 1 x 10 transfeksiyon başına 6 Vero hücreleri en iyi sonuçları vermiştir 0,5 - olduğu gözlenmiştir.
- LPF2000/DNA ve hücrelerin karışımı: 20 ardından - 30 dakika, oda sıcaklığında inkübasyon (adım 1.3), Vero hücreleri, 1 ml (1 x 10 6) (Basamak 1.4) eklemekOda sıcaklığında 5 dakika boyunca OptiMEM-LPF2000 plazmid-DNA karışımı ve inkübe.
- 6 kuyulu tabak içine Tohum LPF2000/DNA-cell karışımı: 6-kuyulu plakanın kuyularına DNA LPF2000-Vero karışımı (adım 1.5) ekleyin. Yavaşça 6-iyi plaka sallamak ve 37 inkübatör transfeksiyon inkübe gecede izin ° C ve% 5 CO 2.
- Transfeksiyon orta değiştirin: Yaklaşık 16-24 saat sonrası transfeksiyon, transfeksiyon ortamı çıkarın enfeksiyon medya 2 ml ekleyin ve ek 48 saat için transfekte hücreleri inkübe.
- Hücre geçiş: enfeksiyon ortamı içinde 48 saat inkübasyondan sonra, doku kültür yüzey (ASR) kaldırmak ve 100 mm tabak içine transfekte hücrelere geçerler. Transfekte edilmiş hücrelerin virüs parçacıkları üretmek için ilave inkübasyon gerekir, çünkü ASR nadiren bulaşıcı bir virüs içerir. Hücre geçişi için:
- 1x 2 ml PBS ile iki kez, hücreler yıkayın.
- Hücreler w Trypsinize ith 0.5 tripsin-EDTA ml ve hücreleri ayırmak kadar bekleyin.
- 1.5 ml mikrosantrifüj tüpü içinde DMEM% 10 FBS% 1 PS 1 ml süspansiyon hücreleri.
- 5000 rpm'de 5 dakika, 4 ° C bir mikrosantrifüj içinde için hücreler santrifüjleyin.
- Dikkatle enfeksiyon ortamı, 1 ml hücreleri tekrar süspansiyon ve 100 mm tabak için hücreleri aktarın. 8 mL, virüs için konsantre hücre kurutma hem de önlenmesi için yeterli bir hacme kadar, bulaşıcı medya ile, plaka toplam hacmi kadar getir.
- Yavaşça 37, 100 mm tabak sallamak ve inkübatör Vero hücreleri ile inkübasyon devam ° C ile 5% 72 saat boyunca CO2.
- TCS toplanması: 72 saat inkübasyondan sonra, 15 ml'lik bir santrifüj tüpüne TCS toplamak. Bir santrifüj içinde 2500 rpm'de 5 dakika boyunca santrifüje edilerek hücre artıkları çıkarın. Bulaşıcı arenavirus TCS bulunan, bu nedenle hücre enkaz pelet kaldırmak ve -80 TCS saklamak ° C
Rekombinant Arenavirus Kurtarma le "> 2. Onay
RLCMV ve rCandid 1. başarılı bir kurtarma tespiti bir odak oluşturan birim (FFU) immünofloresan testi (IFA) ile elde edilir. Vahşi tip virüs kurtarma için biz viral NP için spesifik antikorların kullanımı. R3LCMV ve r3Candid # 1, bu şekilde floresan mikroskobu (GFP) ve / ya da lüminesans (Gluc) ile antikorların gerek kalmadan tespit ve viral titrasyon sağlayan, iki haberci genlerin (GFP ve Gluc) kodlar.
- Yabani tip rekombinan arenavirus kurtarma tekrarlayın: titrasyon bir gün önce, iki kez PBS ile yıkayın trypsinize Vero hücreleri ve 80 ulaşmak için 96 oyuklu plaka hazırlanması -% 90 izdiham sonraki gün (4 x 10 4 hücre / çukur). Yavaşça hücre üniformalı dağılımı elde etmek için elle tabak sallayın. Kültür hücreleri, gecede, 37 ° C inkübatör% 5 CO 2 ile. Enfeksiyon devam etmeden önce, bir tek tabaka onaylamak için mikroskop altında hücrelerin kontrol edin:
- Seri olarak seyreltilmiş (10 kat seyreltme) virüs içeren TCS OptiMEM içinde 100 mm çanağı (adım 1.10) 'de transfekte edilmiş hücreler geri kazanılır.
- Numaralı seribaşı Vero hücrelerinde bulunan ortamı çıkarın 1x PBS 50 ul ile iki kez yıkayın, ve seri seyreltilmiş virüs (adım 2.1) 50 ul hücreleri enfekte. 37 1.5 saat hücreleri enfekte ° C ve% 5 CO2.
- Enfeksiyondan sonra, virüs inokulum kaldırmak 100 enfeksiyon medya ul / iyi ekleyin ve 16 hücreleri inkübe - 18 saat. Viral yeniden enfeksiyon viral titreleri aşırı tahmininde neden olabilecek, 18 saat inkübasyondan sonra oluşabilir.
- 16 - 18 saat sonrası enfeksiyon, her kuyudan TCS çıkarın ve oda sıcaklığında 15 dakika boyunca, 1 x PBS içinde sulandırılmış% 4 formaldehit ile hücreleri gidermek.
- Daha sonra, sabitleme çözeltisi kaldırmak ve hücre geçirgenliği ile% 0.1 Triton X-100, oda sıcaklığında 10 dakika boyunca, 1 x PBS içinde seyreltilmiştir.
- Permeabilization çözüm aspire, daha sonra hücreleri 3 kez wi yıkayıninci 1x PBS.
- Oda sıcaklığında 1 saat boyunca PBS 1x (çözelti engelleme) içinde% 2.5 büyükbaş hayvan serum albümini (BSA) ile hücrelerin bloke edin. Seçenek olarak ise, hücreler, 4 ° C'de gece boyunca bloke edilir ve antikor inkübasyon ertesi gün ile devam edilebilir.
- Bununla birlikte, birincil antikor hazırlanması. Çözümü engelleme LCMV-ve içten # 1 spesifik primer antikorlar seyreltilir ve daha sonra 3,500 rpm'de 15 dakika boyunca / bloke etme çözeltisi antikor santrifüj. BEI Kaynaklar (1:500 seyreltme) ikinci monoklonal anti-NP LCMV antikor klon 1.1.3 (1:30 seyreltme) 16 ve monoklonal anti-NP JUNV antikor SA02-BG12 rLCMV algılama ve rCandid # 1 için kullanılabilir sırasıyla.
- 1 saat inkübasyondan sonra, bloke etme çözeltisi aspire ve hücrelere birincil antikor 50 ul ve 37 ° C'de 1 saat boyunca inkübe ° C
- Bu zamanda, çözelti engelleme ikincil antikor azaltır ve daha sonra 3,500 rpm'de 15 dakika boyunca antikor / bloke etme çözeltisi santrifüj. Poliprimer monoklonal antikorların tespiti için klonal tavşan anti-fare IgG ikincil antikor FITC Şekil 5'te görülen görüntüler elde etmek için kullanılmıştır.
- 1 saat inkübasyondan sonra, birincil antikor aspire 1X PBS ile 3 defa yıkanır ve 37 C'de 30 dakika boyunca, ikincil antikor ekleyin ° C
- 30 dakika inkübasyondan sonra, ikinci antikor ve aspire 1x 3 kez PBS ile yıkayın. Hücreler her iki ml (FFU / ml) başına birim oluşturan odak sayarak viral kurtarma ve titrasyon başarısını belirlemek için floresan mikroskobu kullanarak şimdi dikkat edilmesi hazırız.
- r3LCMV ve 1. r3Candid viral kurtarma: Bu virüsler iki muhabiri gen ifade yana, kendi GFP ifade veya TCS olarak Gluc ifade algılamak için floresan mikroskobu ile izlenebilir kurtarır. Kurtarma da TCS içinde Gluc ifade ile teyit edilebilir. Trisegmented virüs titre etmek için, 2.1.4 adımları 2.1 izleyin, ancak hücreleri, B gerekmezE çünkü GFP ifade başarılı bir viral kurtarma belirlemek için sabit. Virüs titrasyonu FFU / ml sayılması ile tespit edilir. Gluc ifade, TCS gelen Gluc ifade tarafından başarılı viral kurtarma belirlemek için bir Gluc tahlil kiti (Biolux Gaussia Lusiferaz Testi kiti, New England Biolabs) kullanılarak ölçülebilir. Bu amaçla:
- Bir 96-gözenekli beyaz plaka (düz tabanlı mikrotitre plakaları, Fisher Scientific) içine pipet TCS 100 ul.
- Luminometre (Lumicount, Packard Biosciences) ayarlayın.
- Her örnek için 100 ul Gluc Deneyi çözeltisi (imalatçı tarafından tavsiye edilen) ve luminometre ile Gluc raportör gen ölçer - 50 ekleyin. Negatif bir kontrol olarak, vahşi tip virüs enfekte olan hücrelerden TCS Gluc ifade ölçüldü.
3. Doku kültür yüzer geçişi
Viral kurtarma transfeksiyon verimliliği bağlıdır. Vero hücrelerinde gösterilmiştirdiğer hücre hatları 14 daha düşük transfeksiyon verimliliği olması. TCS virüs titreleri düşük ise, virüs amplifiye etmek için 72 saat boyunca 0.01 (LCMV) veya 0.1 (1. İçten) 'lik bir enfeksiyon çokluğu (İB), taze Vero hücreleri enfekte edebilir.