Nöronal popülasyonları in vitro olarak fotostimül etmek için optogenetik bir yaklaşım kullanarak ön beyin devrelerinin fonksiyonel topografyasını ve sinaptik özelliklerini karakterize etmek için bir yöntem açıklıyoruz.
Yöntem makalesi
Nöronal popülasyonları in vitro olarak fotostimül etmek için optogenetik bir yaklaşım kullanarak ön beyin devrelerinin fonksiyonel topografyasını ve sinaptik özelliklerini karakterize etmek için bir yöntem açıklıyoruz.
Duyusal ön beyin, işlevsel özellikleri henüz tam olarak aydınlatılamamış, karmaşık bir şekilde bağlantılı hücre tiplerinden oluşur. Bu ön beyin devrelerinin etkileşimlerinin anlaşılması, son zamanlarda nöronal aktivitenin ışık aracılı modülasyonu için optogenetik yöntemlerin geliştirilmesiyle desteklenmiştir. Burada, viral aracılı transfeksiyon yoluyla optogenetik olarak eksprese edilen channelrhodopsinin lazer taramalı fotostimülasyonunu kullanarak in vitro olarak ön beyin devrelerinin fonksiyonel organizasyonunu incelemek için bir protokol açıklıyoruz. Bu yaklaşım aynı zamanda transgenik farelerde spesifik nöronal hücre tiplerinde ekspresyonu hedeflemek için cre-lox rekombinasyonunun faydasından da yararlanır. Transfeksiyonu takiben, nöronlar, channelrhodopsin eksprese eden liflerin lazer taramalı fotostimülasyonuna uyarılmış tepkilerini ölçmek için tüm hücre yama kelepçesi kullanılarak dilim preparatlarında fizyolojik olarak kaydedilir. Bu yaklaşım, fonksiyonel topografya ve sinaptik özelliklerin değerlendirilmesini sağlar. Morfolojik korelasyonlar, canlı dilimin veya sonradan sabitlenmiş dokunun konfokal mikroskobu kullanılarak channelrhodopsin eksprese eden liflerin nöroanatomik ekspresyonunun görüntülenmesiyle elde edilebilir. Bu yöntemler, daha geleneksel yaklaşımlara dayanan ön beyin devrelerinin fonksiyonel araştırmalarını mümkün kılar.
Memeli ön beyninin ayrıntılı devresi, iç içe geçmiş bileşenlerinin işlevsel rollerini incelemek için deneysel bir zorluk teşkil ediyor. Bu ilişkilerin çözülmesi, son zamanlarda nöronal popülasyonları ve bunların projeksiyonlarını özellikle heyecanlandırmak ve inhibe etmek için optogenetik yöntemlerin geliştirilmesiyle desteklenmiştir1-3. Bu yaklaşımlar, ışığa duyarlı membran kanallarının genetik olarak kontrol edilen ekspresyonunu kullanır4-6. Özellikle, ışık kapılı bir iyon kanalı olan channelrhodopsin, optik stimülasyonu takiben nöronal zarları depolarize eder ve eksprese eden nöronun ve projeksiyonlarının uyarılmasına yol açar4,7. Tersine, ışık kapılı bir klorür pompası olan halorhodopin, zarı hiperpolarize eder, böylece hedeflenen projeksiyonu6,8,9 inhibe eder. Bu opsinlerin çeşitli varyantları tasarlanmış, ilgilenilen nöronal popülasyonlarda transfeksiyon ve ekspresyon için çoklu vektörler üretilmiş ve bu opsinleri yapısal olarak eksprese eden veya ekspresyonlarının cre-lox aracılı kontrolünü sağlayan transgenik fare hatları tasarlanmıştır1,2,10,11.
Bu optogenetik yöntemlerin ve materyallerin faydası, modern deneysel sinirbilimde devrim yaratmış ve organizmanın fizyolojisi ve davranışındaki belirli nöral devrelerin rolünün incelenmesini sağlamıştır12-15. Özellikle, bu yöntemler in vitro dilim preparatları16-20 kullanılarak beyin devrelerinin fonksiyonel diseksiyonuna güçlü bir şekilde uygulanabilir. Bu bağlamda, bu yöntemin temel avantajlarından biri, serebral kortikal hemisferler arasındaki kommissural bağlantılar gibi, kalın bir dilimde korunması imkansız olmasa da zor olan uzun menzilli projeksiyonların fizyolojisini karakterize etme yeteneğidir16. Ayrıca, bu teknoloji, halorhodopsin6,8,9 kullanılarak ince zamansal hassasiyetle projeksiyonların seçici olarak engellenmesi gibi diğer yöntemlerle mümkün olmayan manipülasyonları mümkün kılar. Ayrıca, bu opsinlerin hücre tipine özgü ekspresyonu, bir nöral devredeki izole bileşenlerin seçici olarak uyarılmasına veya inhibe edilmesine izin verir1,2,11,15,21. Bu nedenle, bu yeni optogenetik araçlar, fizyoloji ve davranışa nöronal katkıların benzeri görülmemiş bir analizini mümkün kılar.
Burada, adeno-ilişkili viral (AAV) vektörler1,2 kullanarak fare beyninde channelrhodopsin eksprese etmek için bir protokol açıklıyoruz. Hedeflenen nöronal popülasyonların spesifik transfeksiyonu, hedeflenen nöronlarda Cre-rekombinaz eksprese eden uygun promotör yapıları veya transgenik fareler seçimi ve 'floklanmış' bir viral yapı1,11,15,21 ile bu protokol kullanılarak gerçekleştirilebilir (Şekil 1). Burada örnek olarak, birincil görsel korteks (V1) ve ikincil görsel korteks (V2) arasındaki kortikotortik projeksiyonları inceliyoruz ve ayrıca primer somatorsensoriyel korteksten (S1) ventroposterior medial çekirdeğe (VPm) katman 6 kortikotalamik projeksiyonu araştırıyoruz. Sinaptik fizyolojiyi ve fonksiyonel topografyayı değerlendirmek için bu spesifik ekspresyonu in vitro lazer taramalı fotostimülasyon ile birleştiriyoruz. Burada sunulan kurulum, fotostimülasyon lokuslarının hassas uzamsal konumlandırılmasını ve kontrolünü sağlar. Son olarak, konfokal mikroskopi kullanarak ifade kalıplarının görselleştirilmesini açıklıyoruz.
1. Cerrahi ve Enjeksiyonlar
2. Dilim Hazırlama
3. Fizyolojik Kayıt
4. Lazer taramalı Fotostimülasyon
5. Sabit Dilim Görüntüleme
Faredeki birincil görme alanı (V1) ile ikincil görsel alan (V2) arasındaki projeksiyonların lazer taramalı fotostimülasyonu, pAAV-CaMKIIa-hChR2(H134R)-EYFP'nin bir Balb/C faresinin V1'ine enjeksiyonlarının ardından gerçekleştirildi (Şekil 3). Bu viral yapıdaki CaMKIIa promotörü, uyarıcı glutamaterjik nöronlarda(1,15) channelrhodopsin-EYFP'nin spesifik ekspresyonunu yönlendirir. Fizyolojik kayıt için dilimlerin hazırlanmasından sonra, channelrhodopsin-EYFP liflerinin ekspresyonu, yani konjuge EYFP'nin epifloresansı, V1'den V2'ye geçerken gözlendi (Şekil 3A). Ek olarak, lateral genikülat çekirdekte (LGN) kortikotalamik lifler de gözlenmiştir (Şekil 3A). V2'deki bir nörondan alınan tüm hücre yama klemp kayıtları, V2'nin alt katmanlarındaki channelrhodopsin-EYFP eksprese eden liflerin lazer taramalı fotostimülasyonunu takiben ortaya çıkan EPSC'leri ortaya çıkardı (Şekil 3B).
Başka bir örnekte, primer somatosensoriyel korteksin (S1) 6. katmanından ventroposterior çekirdeğe (VP) kortikotalamik projeksiyonların lazer taramalı fotostimülasyonu bu protokol kullanılarak gerçekleştirildi. Burada, katman 6 nöronlarında ve ilgilenilen kortikotalamik projeksiyonlarda özellikle channelrhodopsin ekspresyonunu hedeflemek için bir Cre-Lox yaklaşımı kullandık. Açıkça, pAAV-Ef1a-DIO-hChR2 (H134R) -EYFP-WPRE-pA'yı B6'nın S1'ine enjekte ettik. Cg-Tg(Ntsr1-cre)GN220Gsat/Mmcd fareler (Şekil 1 ve 4). Bu transgenik fare suşu, özellikle katman 6 kortikotalamik nöronlarda21 Cre-rekombinazı eksprese eder ve bu nedenle sadece 'floksal' AAV yapısı tarafından transfeksiyonu takiben bu nöronlarda ChR-YFP ekspresyonu ile sonuçlanır. Dilimler hazırlandıktan sonra, tabaka 6 nöronlarında channelrhodopsin-EYFP lifleri ve tabaka 4 ve VP'ye çıkıntı yapan lifler gözlendi (Şekil 4A ve 4B). Tam hücre yama klempi kullanılarak bir VPm nöronundan alınan fizyolojik kayıt, kaydedilen nöronun yakınında lazer taramalı fotostimülasyonun ardından EPSC'lerin ortaya çıkabileceğini ortaya koydu (Şekil 4C ve 4D).
Etiketli liflerin morfolojisi, fizyolojik kayıtların ardından daha kolay değerlendirildi. Burada, 6. tabaka kortikotalamik nöronlarda channelrhodopsin-EYFP ekspresyonu ile (50 μm) kesit preparatları rezeke edildi (Şekil 5). Bu, katman 6'dan katman 4'e geçen, yoğun bir şekilde sonlandırıldıkları ve ağaçlandırıldıkları ince bir etiketli lif modelini ortaya çıkardı (Şekil 5A). Ek olarak, kortikotalamik liflerin beyaz cevhere girdiği ve talamusa doğru geçtiği gözlenmiştir (Şekil 5A ve 5B).

Şekil 1. Cre-Lox yaklaşımı ile channelrhodopsin'in hedeflenen ifadesinin şematik gösterimi. İlgilenilen nöronal popülasyonlarda Cre-rekombinaz eksprese eden transgenik farelere, YFP gibi bir floresan proteine kaynaşmış channelrhodopsin kodlayan 'floxed' bir virüs enjekte edilir. Transfeksiyonu takiben, sadece Cre-rekombinazlı nöronlar channelrhodopsin-EYFP'yi eksprese edecektir. Resmi daha büyük görmek için buraya tıklayın.

Şekil 2. Fotostimülasyon kurulumunun şematik gösterimi. (A) Lazer taramalı fotostimülasyon kurulumunun şeması. Lazer ışını, bir açık ışın sistemi aracılığıyla art arda bir deklanşöre ve bir nötr yoğunluk (ND) filtresine yönlendirilir. Bir lamel ışının bir kısmını lazer gücü ölçümleri için bir amplifikatöre bağlı bir fotodiyota yansıtır. Ayna galvanometreleri, lazer ışınını, ışını mikroskobun üst kısmındaki bir yan porttan geçiren bir tarama merceğinden geçirmek için kullanılır. Işın daha sonra dikroik bir ayna kullanılarak objektif mercekten dilim hazırlığına yansıtılır. Daha fazla ayrıntı için Lam ve Sherman23 ve Shepherd29'a bakınız. (B) Şekil 3'te gösterilen temsili deney için fotostimülasyon ızgara modeli örneği. 16 x 16 stimülasyon ızgarası, dilim hazırlığının bir fotomikrografı üzerine yerleştirilmiştir. Kırmızı bir yıldız, tüm hücre yama kelepçesi kullanılarak kaydedilen bir nöronun yerini gösterir. Lazer ışını konumu, ayna galvanometrelerinin bilgisayarlı konumlandırılmasıyla stimülasyon ızgarasındaki 256 konumun her birine yönlendirilir. 1. 5 stimülasyon bölgesinin lazer pozisyonları şekilde gösterilmiştir. Kaydedilen nörondan her bir bölgede fotostimülasyona verilen yanıtlar Şekil 3'te gösterilmektedir. Resmi daha büyük görmek için buraya tıklayın.

Şekil 3. Farede birincil görsel korteksten (V1) ikincil görsel kortekse (V2) kortikokortik projeksiyonların lazerle taranarak fotostimülasyonu. (A) V1'den V2'ye kadar ve lateral genikülat çekirdekte (LGN) channelrhodopsin-EYFP liflerini gösteren dilim preparatının epifloresan görüntüsü. Uyarıcı glutamaterjik nöronlarda channelrhodopsin-EYFP'nin spesifik ekspresyonu, CaMKIIa promotörü içeren viral bir yapı tarafından yönlendirilir. (B) Lazer taramalı fotostimülasyonu takiben V2'deki bir nörondan ortaya çıkan uyarıcı postsinaptik akımlar (EPSC'ler). Kırmızı yıldız, kayıt yerini gösterir. Ölçek çubukları: (A) 500 μm, (B) 200 pA, 100 msn. Resmi daha büyük görmek için buraya tıklayın.

Şekil 4. Farede primer somatosensoriyel korteksten (S1) ventroposterior çekirdeğe (VP) kortikotalamik projeksiyonların lazerle taranarak fotostimülasyonu. (A) S1'de channelrhodopsin-EYFP liflerini gösteren dilim hazırlığının epifloresan görüntüsü. (B) VP'deki etiketli liflerin epifloresan görüntüsü. (C) Lazer taramalı fotostimülasyonu takiben bir VP nöronundan ortaya çıkan uyarıcı postsinaptik akımlar (EPSC'ler). (D) Ortalama EPSC'lerin grafiği. Kırmızı yıldız, kayıt yerini gösterir. (C) içindeki kutulu izler, (D) içindeki kutulu değerlere karşılık gelir. Ölçek çubukları: (A) 250 μm, (B) 250 μm, (C) 100 pA, 100 msn. Resmi büyütmek için buraya tıklayın.

Şekil 5. Farenin primer somatosensoriyel korteksinde (S1) channelrhodopsin-EYFP eksprese eden katman 6 nöronlarının görüntülenmesi. (A-B) Katman 6'daki etiketli nöronlar ve katman 4'e ve beyaz maddeye çıkıntı yapan lifler. Ölçek çubukları: (A) 250 μm, (B) 250 μm. Resmi büyütmek için buraya tıklayın.
Açıklanan protokol, ön beyin devrelerinin, yani talamus ve korteks devrelerinin araştırılmasıyla sınırlı olmayan, nöronal devrelerin fonksiyonel topografyası ve fizyolojisinin in vitro değerlendirmesi için bir yaklaşımı detaylandırmaktadır. Optogenetik transfeksiyon için çeşitli viral yapılar bilim camiasının kullanımına sunulmuştur ve UNC Vektör Çekirdeğinden kolayca elde edilebilir. Kolayca bulunabilen viral yapıların bir açıklaması için, Stanford Üniversitesi32'deki Deisseroth Laboratuvarı'ndaki optogenetik kaynak sayfası olan UNC Vector Core 31'e ve MIT33'teki Boyden sentetik nörobiyoloji laboratuvarına bakın. Bu opsinlerin varyantları bu laboratuvarlar tarafından geliştirilmiştir ve nöronal uyarılabilirliği kontrol etmek için geniş kapsamlı modlar sağlar1,2. Bu vektörlerin UNC Vektör Çekirdeğinden elde edilmesi, kaynak laboratuvarlardan bir Malzeme Transfer Anlaşması gerektirir. Bu protokolde, polibren ilavesinin transfeksiyon etkinliğini arttırdığını not ediyoruz. Ek olarak, ifadeyi etkileyen bir diğer değişken de ameliyat sonrası iyileşme dönemidir ve farelerin ön beyin yollarında sağlam bir ifade elde etmek için en az 14 günlük bir sürenin yeterli olduğunu not ediyoruz.
Spesifik nöronal grupların hedeflenen transfeksiyonu için, geliştirilmiş11 'flokslu' ters çevrilmiş açık okuma çerçevesi viral yapıları ile kombinasyon halinde kullanılabilen birkaç Cre-transgenik fare hattı geliştirilmiştir. Sinirbilim araştırmalarıyla ilgili çeşitli suşlar, Mutant Fare Bölgesel Kaynak Merkezleri34 aracılığıyla edinilebilir. Bu transgenik hatlardaki Cre-rekombinaz ekspresyon paternlerinin atlasları, GENSAT veritabanı35 aracılığıyla sunulmaktadır. Ek olarak, Jackson Labs, belirli nöronal gruplarda opsinleri yapısal olarak eksprese eden diğerlerinin yanı sıra birkaç Cre-transgenik suş sunar. Bu fare hatlarını kullanmanın kritik bir adımı, bir üreme kolonisi elde etmek ve kurmak için gereken süreyi hesaba katmaktır ve bu, ilgilenilen türe göre değişebilir.
Fotostimülasyon için, Northwestern Üniversitesi'ndeki Shepherd Lab tarafından geliştirilen ve yakın tarihli bir protokol29'da açıklanan kurulumu kullandık ve uyarladık. Glutamat kafesinin açılması için optimize edilmiş olmasına rağmen, bu kurulum, modifikasyon yapılmadan channelrodopsin'in fotostimülasyonu için de uygundur. Bu kurulum, kaydedilen nöronların channelrodopsin innervasyonunun fonksiyonel topografyasının değerlendirilmesini sağlayan fotostimülasyon lokuslarının hassas uzamsal kontrolünü ve konumlandırılmasını sağlar. Uzamsal kontrol, bu fotostimülasyon yöntemiyle geliştirilmiş olsa da, LED tabanlı alan aydınlatması20 kullanan yöntemlerden daha uygun maliyetlidir. Ek olarak, beyin dokusunun tekdüze olmaması, optogenetiğin veya ışığın manipülasyonunu içeren herhangi bir tekniğin bir sınırlamasıdır. Ancak pratikte, sonuçlar çoğunlukla niteliksel bir şekilde yorumlandığı için nadiren bir faktördür. Beyin bölgeleri arasında daha niceliksel karşılaştırmaya ihtiyaç duyulması durumunda, "doymuş" tepkiler elde etmek için her zaman maksimum ışık yoğunluğu kullanılabilir.
Ek olarak, lazer taramalı fotostimülasyonu kontrol etmek ve veri toplamak için Matlab'da yazılmış hem Tidelwave hem de Ephus yazılım programlarını kullandık25,26. Bununla birlikte, benzer bir sistem kuranların, Janelia Farms geliştirme sitesi30 aracılığıyla sağlanan desteğe sahip daha yeni Ephus yazılımı26'yı kullanmaları önerilir. Önemli bir adım, donanım gereksinimleri biraz farklı olduğundan, bu yazılım paketlerinden hangisinin kullanılacağını seçmektir. Ek olarak, harita analiz programları ilgili veri toplama programlarına göre uyarlanmıştır.
Bu adımların birçoğu, uygulayıcının özel kurulumuna uyacak şekilde değiştirilebilir. Viral solüsyonların enjeksiyonları, bir şırınganın yanı sıra dağıtım mekanizmalarıyla da gerçekleştirilebilir, örneğin ~40 μm'lik uç çaplarına çekilen kılcal cam pipetler de iyi çalışır. Ameliyatlar için, enjeksiyonları yönlendirmek için bu tür koordinatlar gerekli değilse, stereotaksik olmayan bir başlık ikame edilebilir. Ek olarak, ACSF ve hücre içi çözelti bileşimleri, belirli deneysel gereksinimlere bağlı olarak değiştirilebilir, örneğin inhibitör akımları izole etmek için bir sezyum veya yüksek klorürlü hücre içi çözeltinin ikame edilmesi. Ayrıca, sabit dilimlerdeki ekspresyon paternlerinin görüntülenmesine bir alternatif, banyo perfüzyon sistemine sahip uygun bir görüntüleme teçhizatında canlı dilimde de yapılabilir.
Özetle, bu protokol, uygulayıcının, standart yöntemler kullanılarak mümkün olmayabilecek in vitro projeksiyonların fonksiyonel topografyasını ve sinaptik fizyolojisini karakterize etmesini sağlayacaktır, örn. bir dilimde korunamayan uzun menzilli projeksiyonları karakterize etmek. Açıklanan transfeksiyon protokolü, dağıtım mekanizması aynı olduğu için in vivo optogenetik deneyler1-3,12,14'e uygulanabilir. Son olarak, bu protokol farelerin transfeksiyonunu tanımlasa da, mevcut viral vektörlerin çoğu, bu opsinleri çok çeşitli memeli türlerinde teorik olarak transfekte etmek ve eksprese etmek için kullanılabilir, böylece sayısız karşılaştırmalı ve türe özgü çalışma1-3'e olanak tanır.
Yazarlar, rekabet eden çıkarları olmadığını beyan ederler. Yazar (CCL), bu protokolün bu filme alınmasında kullanılan bir enstrümanı üreten Leica Microsystems'den bir yayın hibesi aldı.
Bu çalışma, NIH/NIDCD hibesi R03 DC 011361, SVM CORP hibe LAV3202, NSF-LA EPSCoR hibe PFUND86 ve Leica Microsystems'den (CCL) bir yayın hibesi ve NIH/NIDCD hibesi R01 DC 008794 (SMS) tarafından desteklenmiştir.
| Ad | Şirket | Katalog numarası | Yorumlar |
|---|---|---|---|
| Polybrene | Santa Cruz Biotech | SC134220 | |
| Paraformaldehit %32 çözelti | EMS | 15714 | |
| VECTASHIELD | Vektör Laboratuvarları | H-1400 | |
| AAV viral yapıları | UNC Vektör Çekirdeği | NA | |
| Fare stereotaktik kafa tutucu | Stoelting | 51730 | |
| Nanocool enjektör | Harvard Aparat | 703040 | |
| UV lazer: 355 nm, Nd:YVO4; 1 W; | DPSS Lasers, Inc | 3500 | |
| Galvonometreler | Cambridge Tarama | 6210 | |
| aynalar | Cambridge Tarama | 6m2003S-A | |
| montaj | Cambridge Tarama | 6102103L | |
| kablo | Cambridge Tarama | 6010-19-120 | |
| sürücü/denetleyici | Cambridge Tarama | 67121-1 | |
| Deklanşör - ZM kaplamalı (UV uyumlu) | Uniblitz | L23-ZM2 | |
| Deklanşör Kontrol Cihazı | Uniblitz | VMM-D1 | |
| Akım Amplifikatörü | Stanford Araştırma Sistemleri | SR570 | |
| 6713 kartı | Ulusal Aletler | 777741-01 | |
| 2110 koparma kutusu | Ulusal Aletler | 777643-01 | |
| PCI-MIO-16E-4 | Ulusal Aletler | 777383-01 | |
| BNC-2090 | Ulusal Aletler | 777270-01 | |
| Kablolar | Ulusal Aletler | 184749-01 | |
| MATLAB | Mathworks | ||
| TCS SP2 | Leica Microsystems |
Bu JoVE makalesinin metnini veya şekillerini yeniden kullanmak için izin iste
İzin iste