Burada anlatılan protokollerin son raporunda 18 de tarif edildiği gibi, grafik işlemcisinden ifade etme kabiliyetleri bakımından farklılık GFP etiketli HIV-1 virüs ile enfekte olmuş T hücrelerinin algılama ölçer. Bununla birlikte, bu yöntemler, kolayca potansiyel doğuştan gelen algılamayı ayarlayabileceğini diğer viral genleri eksik olan etiketlenmemiş virüsleri gibi virüslerden algılanmasını incelemek için modifiye edilebilir. GFP ifade yoktur kullanılan virüsler, enfekte hedef hücre yüzdesi p24 (kapsid) halinde, hücre içi boyama-kültür co ve sitometrisi veya p24 ELISA ile akış önce başka bir şekilde tespit edilmelidir. Bundan başka, bu protokoller mevcut hücre hatları ve primer çeşitli hücreler de dahil olmak üzere çeşitli hedef T hücreleri, birlikte kullanılabilir.
HIV-1 algılama çalışma için kullanılan ilk yöntemleri ile karşılaştırıldığında, bu metin içinde tarif edilen yöntemler bir dizi avantaj vardır. Birinci ve en önemlisi, bu gruplar bir dizi hücre içermeyen, HIV-1 p tarafından kurulmuşturMakaleleri tip-I IFN 2,13,14 kötü indükleyicileridir. Ayrıca, erken çalışmalarda üretilen tip-I IFN miktarını ölçmek için eski IFNa ELISA tabanlı yöntemler dayanıyordu. Bu algılama tekniğinin bir sınırlama IFNa'nın ve IFNβ diğer tip bakan iken eski IFNa ELISA kitleri çoğu sadece, IFNa'nın bir tür ölçmek olmasıdır. Tarif edilen raportör hücre çizgilerinin kullanımı aynı anda ölçülebilir insan tip I IFN'lerin tüm biyoaktif formları konsantrasyonu olarak, bu sınırlama üstesinden gelmektedir. Tekniği IFN ELISA kitinin yeni nesil daha ve tip-I IFN büyük miktarlarda kolayca tespit edilebilir birçok bağışçılar için daha ucuz, son derece duyarlıdır. Bununla birlikte, bu protokol kolayca ELISA gibi diğer tip I IFN Okuması yöntemlerle kullanım için adapte edilebilir.
Kritik adımlar: Tüm hücresel bileşenleri (hedefler ve etkileyiciler ikisi) kalitesi sıkı kontrol edilmesi önemlidir. Potansiyel kirlenme bile asymptomatic, izlenmesi ve kontrol edilmesi gerekmektedir. Daha önce de belirtildiği gibi, asemptomatik bakteriyel kontaminasyonu antibiyotik kontrol ve mikoplazma gibi potansiyel olarak diğer hücre içi patojenler, HIV-1 enfeksiyonu, tip I IFN yani üretim sonrası görülen benzeyen bağışıklık karşılıklarını üretir. Ayrıca, tüm reaktifler LPS veya diğer olası endotoksinlerin serbest olması gerekir. İnsan örnekler sıklıkla normal algılama etkileyebilir yatan devam eden enfeksiyonlar ile astarlanabilir yana Benzer şekilde, PBMC'ler ve pDC'lerde izlenmesi önemlidir. Her zaman, önerilen negatif kontroller, sözde-enfekte edilmiş hücreler ile bu hedef hücrelerin yokluğu gibi ortak kültürler de dahil olmak üzere önerilir. Enfekte olmuş hücrelerin canlılığı, aynı zamanda, tip-I IFN apoptotik hücrelerin 2,14 sahip ortak-kültür, aşağıdaki üretilmediği yana doğru pDC algılamak için önemlidir.
Tekniğin önemli bir sınırlama, taze izole edilmiş primer hücrelerde ihtiyacıdır. Bu prosedür değildiya da önceden doldurulmuş ya da kültür içinde tutuldu PBMC'ler veya PDC kullanılarak test edilmiştir. PBMC izole emek yoğun bir iştir ve bu hücreler çok sınırlı bir ömrü vardır. Insan kanı ile çalışırken Ayrıca, kan yoluyla bulaşan patojene karşı korumak için, standart protokoller kullanılmalıdır. Taze izole insan hücreleri içeren çalışmaları ile ilgili değişkenlik çeşitli kaynaklar genellikle vardır. Aralarında donör-to-donörden karşılaşılan bu hücreleri izole etmek için uygulanan farklı yöntemler ve kalıtsal değişkenlik vardır. O vericinin arasında değişkenlik kaçınmak mümkün olsa da, bu tür TLR7 ve TLR9 yolların bilinen agonistleri yanıt ölçüm olarak öne pozitif kontroller, kullanımı, bu deneyler için önemli bir iç kontrol sağlayacaktır. Bir yanıt TLR7 yolu HIV-1 3 karşı uygun bir cevap için gerekli olan süre TLR9 yolunun agonistleri için sağlam bir yanıt sağlıklı pDC yanıt ile ilişkili gözlemlenmiştir.
2 dayanarak ss = "jove_content">. Deneysel tasarım gerektiriyorsa hücreler seçim sürecinin ardından antikorun serbest kalması Ancak, negatif seleksiyon (belirli pDC yüzey belirteçlerinin tükenmesi gereken bağlamda örneğin), pozitif seçimi üzerinde tercih edilir. İzole PDC kültürde hızlı bir şekilde apoptoza girerler. Bu hücreleri gerektiren deneyler zaman uzun süre boyunca kültüre olması için, kültür ortamı, IL-3 ile takviye edilebilir. Bu sitokin pDC proliferasyon ve apoptozu 16 inhibe eder. Bu pDC olgunlaşma veya farklılaşmasına yol açabilir Bununla birlikte, IL-3, kullanım sıkı bir şekilde kontrol edilmesi gerekmektedir.
Burada anlatılan yöntem doğuştan algılama sırasında yer alan ilk adımları yeniden amacıyla taze izole edilmiş PBMC'ler veya pDC'lerde hedef HIV-1 ile enfekte hücreleri birleştirir. Bu yöntem, kuşkusuz explor faydalı olacaktırHIV enfeksiyonu ile ilgili e erken doğuştan gelen bağışıklık olaylar. Ilgili protokolleri tip I IFN ölçmeye yönelik olmasına rağmen, bunlar, enfeksiyonlu hücrelerde tanınması üzerine pDC'lerde salınan diğer biyoaktif molekülleri ölçmek için modifiye edilebilir. Bunlar: tip-III IFN (IFN-λ) ve kemokinler CXCL10, CCL4 ve CCL5 17 (örneğin, TNF-a ve IL-6 gibi) pro-enflamatuar sitokinler.