RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
tr_TR
Menu
Menu
Menu
Menu
A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Research Article
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Biz, hipokampusun CA1 bölgesinde ve dilimin tetanized alan nükleer zenginleştirilmiş kısımların daha sonraki izolasyon Uzun süreli potansiyasyon indüksiyonu için ayrıntılı bir protokol sağlar. Bu yaklaşım, önemli aktivitesini öğrenme ve hafıza ile hücresel modellerinde bağımlı nükleer protein alma belirlemek için kullanılabilir.
Öğrenim aktivitesine bağlı protein ekspresyonu, hücre-altı yer değiştirmesi, ya da fosforilasyon sinaptik plastisite altında yatan hücresel mekanizmaların anlaşılması önemlidir. Uzun vadeli potansiyelleri (LTP) ve akut hipokampal dilim bağlı uzun süreli depresyon (LTD) yaygın öğrenme ve hafızanın hücresel modelleri olarak kabul edilir. Etkinlik bağımlı protein dinamikleri görselleştirmek için canlı hücre görüntüleme veya immünohistokimya yaklaşımları kullanmak birçok çalışma bulunmaktadır. Bununla birlikte, bu yöntemler tek nöronlarda floresan-etiketli proteinlerin immünolojik hücre ya da aşırı dışavurumu için antikorların uygunluğu dayanır. Proteinlerin İmmünoblotting bulguların bağımsız onay veren bir alternatif yöntemdir. Bireysel tetanized hipokampal dilimlerde sub-hücresel fraksiyonları hazırlanmasında ilk sınırlayıcı faktör, malzemenin düşük miktarıdır. İkinci olarak, işleme yöntemi çok önemlidir l, hatta çok kısa bir küçük ve manipülasyon içindilimleri Iving belirli sinyal silsileleri uyarmamaktadır olabilir. Burada fare beyninden akut hippokampüs kesitlerinin CA1 bölgesinde yeterli saflıkta nükleer bakımından zengin kısım için yeterli malzeme elde etmek için bir optimum iş akışını açıklar. Temsili bir örnek olarak, synapto-nükleer protein haberci ERK1 / 2 fosforlu şekli Jacob aktif LTP indüksiyonu üzerine çekirdeğe doğru yer değiştirir ve CA1 nöronlarının bir nükleer bakımından zengin kısım tespit edilebileceğini göstermektedir.
Sinaptik N-metil-D-aspartat-reseptörler (NMDARs) sinaptik plastisite ve hücre hayatta kalma ve nörodejenerasyonunun hücre ölümünü nasıl tetikleyebildiği extrasynaptic NMDARs aktivasyonu ise sinyal çok önemli bir rol oynar. Bu değişiklikler sıkı kontrol / düzenlenmiş bir faaliyet bağımlı gen ifadesine bağlı ve böylece aktif sinaps veya dendritler ve nükleus 7 arasında sürekli iletişim gerektirir. MAP ERK1 / 2 sinyalizasyon sinaptik NMDARs alt baş gerçekleştirmekle ve extrasynaptic NMDAR yoluyla sinyalleme yapan hiç ya da ERK1 / 2 aktivitesi 8,11 üzerinde inhibe edici bir etkiye sahiptir, oysa, NMDAR-aktivasyonu ile uyarılan gen sentezlenmesine katılan edilir kinaz.
Distal dendrit ve çekirdeği arasındaki transfer gösterilmiştir proteinler vardır. Bu proteinlerin çoğu bir nükleer lokalizasyon sinyali içerir ve aktif olarak çekirdeğe bir 6,9 ve dinein importin bağımlı bir şekilde, mikrotübülün boyunca taşınmaktadır. InterestinglY, belirli bir sinaptik uyarıcıya tepki olarak çekirdeğe Bu taşıyıcı maddelerin bazıları için yalnızca bir geçiş. Örneğin, siklik AMP tepki elemanı bağlayıcı protein 2 (CREB2) retrograd nakil aracı kimyasal LTD, fakat LTp 12 tarafından indüklenir. Lokalize NMDAR-bağımlı uyarma sinaptik uzun vadeli plastisite hipokampal 4 katılır çekirdeği, bir translokasyon süreç içine CREB düzenlenmiş kopyalayıcı ortak aktifleştirici (CRTC1) tahrik eder. Son zamanlarda protein haberci Jacob hem sonra nükleus, sinaptik ve extrasynaptic NMDAR aktivasyonu için translocates ve CREB'ye bağımlı gen transkripsiyonunu 5 düzenler olduğu gösterilmiştir. Sinyalinin sinaptik veya extrasynaptic kökenli Jacob bir sonrası modifikasyon kodlanmıştır. Sinaptik aktivitesi primer hipokampal kültürdeki çekirdeğe translokasyonu açısından daha sonra gerekli bir konumda olan 180 (pJacobS 180) açısından çok önemli bir serin bir Yakup'un ERK1 / 2 bağımlı fosforilasyonunu uyanr. Ayrıca, in CA1 Schaffer kollateral LTP sonra çekirdeğe akut hipokampal dilimlerin pJacobS 180 translocates nöronlar değil 1,10 LTD. pS180 Jacob plastisite ilişkili genlerin ifadesindeki artışa neden olur ve bu gen ekspresyon sinaptik fonksiyon geri beslenir. Extrasynaptic NMDARs aktivasyon Ser180 fosforilatlanır değildir ve neden çekirdekte farklı bir protein kompleksi ile ilişkili olabilir sonra çekirdeğe translocates tezat, Jacob 'CREB'ye kapatmak' ve sinaptik bağlantıları 10 bir geri çekilme.
Synapto-nükleer protein haberci nükleer ithalatına En yayınlanan çalışmalar, ayrışmış nöronal primer kültürlerinde yapılmıştır. Nöronal bağlantı ve fonksiyon çok daha iyi korunmuş olduğu, bu nedenle bu bulgular hipokampal dilimleri kullanarak fizyolojik daha uygun koşullar çoğaltılamaz görmek ilginç olacaktır. Burada LTP-de değerlendirmek için optimize edilmiş bir protokol mevcutimünoblotlama protein haberciler nükleer translokasyonunu pendent. Bu yöntem aynı zamanda bu basit bir nükleer fraksiyonda proteinin aktivitesine bağlı fosforilasyonunun analizi için uygundur. Özel olarak, mevcut protokolü akut, CA1, hipokampüse ait kesitler indüksiyonu ve LTP kayıt hazırlanmasını da kapsar. Sonraki CA1 bölgesi mikroskobik uyarılmış bölgeyi izole etmek için disseke edilir. Biz kombine ve Zhao ve arkadaşları 17 tarafından tanıtılan değişiklikler ile CellLytic nükleer Ekstraksiyon Kiti tarafından sağlanan nükleer izolasyonu için protokol değiştirilmiş. Optimize edilmiş prosedür, hücre şişmesi ve çekirdekler salımını sağlayan, hipotonik tampon maddesi içinde kesildi CA1 bölgelerin lızız ışlemını içermektedir. Hücre lizizi, ve çekirdekler morfolojisi mikroskopik inceleme ile tespit edilebilir. Nükleer zenginleştirme kısa bir santrifüjleme adımı ile elde edilir. Neun ve NSE2, nükleer veya sitosolik fraksiyonlar özel markörler, karşı antikorlar ile immunoblotting analizi bu yaklaşım hızlı bir şekilde kullanılabileceğini göstermektedirve tekrarlanabilir protokolü bu hücrealtı kesirler izole etmek ve protein fosforilasyonu gibi çok kararsız öteleme sonrası modifikasyonları çalışma. Buna ek olarak, bu yöntem, hipokampal dilimler kesilmiştir CA1 bölgelerinden kaynaklanan küçük bir doku numuneleri için avantajlıdır ve hipokampal dilimler immünohistokimya ile kombinasyon halinde de kullanılabilir.
Yetişkin sıçan beyninde gelen Akut Hipokampal Dilimleri hazırlanması 1.
2. Elektrotların Konumlandırma, Temel Kayıt ve LTP indüksiyonu
LTP ve Yapış Donma İndüksiyonunun sonra Dilimleri 3. Koleksiyonu
Hippocampus CA1 Bölgesi'nden Nükleer Zenginleştirilmiş Kesirler 4. İzolasyonu
Synapto nükleer proteinlerin yarı kantitatif 5. Bağışıklık
6. Veri Analizi
| Tamponun Adı | Reaktif | Konsantrasyon (mM) | Tutar | Yorumlar / Açıklama |
| Gey çözeltisi (pH: ~ 7.4 7.3) | NaCl | 130 | 7.6 gr | steril filtrasyon |
| 1000 mi | KCl | 4.9 | 0.37 gr | |
| CaCl2 · 2H 2 O | 1.5 | 0.22 gr | ||
| MgSO 4 · 2H 2 O | 0.3 | 0.0739 g | ||
| MgCI2 · 6H 2 O | 11 | 2.24 g | ||
| KH 2 PO 4 | 0.23 | 0.0313 g | ||
| Na 2 HPO 4 · 7H 2 O | 0.8 | 0,2145 g | ||
| Glukoz · H2O | 5 | 0,9909 g | ||
| Hepes | 25 | 5.96 gr | ||
| NaHCO3 | 22 | 1.85 g | ||
| ACSF (pH: ~ 7.4 7.3) | NaCl | 110 | 6.428 g | steril filtrasyon |
| 1000 mi | KCl | 2.5 | 0,1865 g | |
| CaCl2 · 2H 2 O | 2.5 | 0.368 g | ||
| MgSO 4 · 2H 2 O | 1.5 | 0.370 g | ||
| KH 2 PO 4 | 1.24 | 0.169 gr | ||
| Glukoz · H2O | 10 | 1,9817 g | ||
| NaHCO3 | 27.4 | 2,3 g | ||
| 1x Hipotonik tamponu (pH: 7.9) | Hepes | 10 | 0.23 g | |
| 100 mi | MgCI2 · 6H 2 O | 1.5 | 0.0304 g | |
| KCl | 10 | 0,07455 g |
Tablo 1. Tamponlar.
Daha önce synapto-nükleer protein haberci Jacob LTP indüksiyonu değil, LTD 1 Aşağıdaki çekirdekte birikmektedir göstermiştir. Ayrıca, sinaptik stimülasyonu sonrası Yakup'un translokasyon Ser180 (Şekil 1) MAPK ERK1 / 2 aktivasyonunu ve Yakup'un fosforilasyonu gerektirir. Fosforile edilmiş Jacob bir importin bağımlı bir şekilde çekirdeğe doğru yer değiştirir ve fosforile durum 15 αinternexin ara filaman ile birlikte (Şekil 1) uzun süreler boyunca muhafaza edilebilir. Jacob, fosfo-durum aktivite bağımlı gen ve hücre canlılığının ifadesi için önemlidir. İlginç bir şekilde, extrasynaptic NMDARs aktivasyonu da çekirdeğin içine Jacob sürücüler ancak bu durumda Jacob Ser180 Fosforile değildir ve nükleer birikimi CREB indükleyen 5,10 'kapatma'. Yukarıda açıklanan sonuçlar elde edilmiştir ProtocoBizim son çalışmada kurulan ls (bakınız Karpova ve ark. 10 modelinin ayrıntılı bilgi için).
Jacob LTP indüksiyonu sonrasında çekirdek içine kanıtlamak için, (Şekil 2 ve 3). Kaynaklı akut ve hipokampal dilimlerde Schaffer kollateral fEPSP potensiyasyonun uyarılmasını ölçülür ve daha sonra CA1 nöronlarının nöronal çekirdek izole Bu yüksek frekanslı uyarım uygulama (2 dakika ve 30 dakika sonra), iki farklı zaman noktasına göre ve daha sonra nükleer izolasyon ve Batı lekeleme için işlenmiştir her kesiti için, LTP * nin yüklenmesini kaydedildi (Şekil 2 ve 3). Sitosolik işaretleyici nörona özgü enolase2 (NSE) lize c santrifüj işlemi sonrasında elde edilen yüzer tabaka fraksiyonunda daha çok mevcut ise nöronal nükleer belirteç Neun zenginleştirilmesi, kesilmiş CA1 bölgesinde hazırlanan nükleer bakımından zengin kısım görülebilirarşın (Şekil 4A). (Bilgilerini Karpova ve arkadaşları için bkz. 10) pS180 Jacob antikorun özelliği, daha önce karakterize edilmiştir. pS180 Jacob düzeyleri total CA1 protein homojenatlarda ve tetanization (Şekil 4B) sonra nükleer zenginleştirilmiş fraksiyon 2 dakika içinde değişmeden kaldı, ama biz Jacob teyit, 30 dakika LTP (Şekil 4C) indüksiyon sonrası pJacobS 180 imünoreaktiviteye önemli bir artış bulundu Bu hücresel plastisite modelinde çekirdek translokasyonunu Ser180 fosforilatlandığında.

Jacob S180 fosforile Şekil 1. NMDARs sinyallerinin sinaptik kaynağını kodlar. Hipokamp Schaffer kollateral elyaflar sonuç Tetanik uyarılması sinaptik NMDARs ve MAPK'nın sonraki aktivasyonu aktivasyonundaERK1 / 2 kaskad sinyalizasyon. Aktif ERK1 / 2 bağlanan ve serin 180 Jacob fosforilleyen ve Jacob-ERK1 / 2 kompleksi çekirdeğe doğru yer değiştirir ve bu geliştirilmiş CREB aktivite ve plastikliği ilgili gen ifadesi aktivasyonu ile ilişkilidir.

Şekil 2. aletler ve LTP indüksiyonu için kullanılan ve hipokampal gelen CA1 bölgeyi diseksiyon. 3 - mikromanipulatöre perfüzyon sistemi, 4 - Yeniden Kodlama elektrot, 5 - uyarılması elektrot, 6 - Su objektif lens - Vibratome) B1-2) Elektrofizyoloji ve görüntüleme kurulumu (2 - Mikroskop A), akut Vibratome hipokampal dilimler (1 'in hazırlanması için kullanılan , 7 - hipokampal dilim dilim tutucu) C) hipokampal dilimlerde CA1 bölgesinde diseksiyonu için kullanılan ekipmanlar (8. Stereomicroscope; 9 - iğnelerle İnsülin şırınga; 10 - Küçük cerrahi makas; 11 - Neşter; 12 - Plastik Pasteur pipeti; 13 - İnce spatula; dilimleri diseksiyonu için kullanılan buz-su ile dolu 14-100 mm plastik kültür çanak ve 40 mm plastik kültür çanak.

Şekil 3. Karikatür deneysel prosedürünü gösteren. Numaraları protokolde adımlarını gösterir. 2,1-2,8) Schaffer kollateral-CA1 sinapslar potansiyasyonu için stratum radiatum yerleştirilen cam elektrodlar ile batık odasında bir akut hipokampal dilim. Içerlek yatay çubuk 5 msn'den gösterir ve dikey çubuk 0.5 mV gösterir, örnek fEPSP analog izlerini temsil eder. 3.3) • Dilimler sonra 1.5 ml tüpler içinde toplandıLTP kayıt ve donduruldu. 4.3) yetişkin sıçan hipokampal dilimlerde CA1 bölgesinde diseksiyonu. 4.4-4.5) CA1 bölgeleri hücreleri ve çekirdekleri serbest ozmotik şişmesine neden olur hipotonik lizis tamponu, içinde homojenize. 1 dakika boyunca 11,000 rpm'de lizatlarının 4.8) Santrifüj. Bağışıklık boyama için sitoplazmik ve nükleer zengin fraksiyonların 4.10) toplanması. SDS-PAGE ve daha sonra standart Batı-lekeleme ile sitoplazmik ve nükleer zengin fraksiyonlar, 5.3) Yükleme.

CA1 LTP indüksiyonu Şekil 4. çekirdekte pJacS180 birikimine yol açar. Indu sonra sitosolik, nükleer işaretleri b.) Homojenat, 2 dakika içinde pJac-S180 seviyesinin bağışıklık beneklenme analizi, ve 30 dakika süre ile problanmış homojenatı, sitosolik ve CA1 lizatının nükleer zenginleştirilmiş fraksiyon için A), bağışıklık beneklenmetetanization. C'nin ölü m) tetanization sonra nükleer zenginleştirilmiş fraksiyon, 2 dakika ile dk pJacS180 seviyesinin bağışıklık beneklenme analizi. Bu sonuçlar, 10 Karpova et al yayınlanan ölçüm grafiğinin bir parçasıdır. Bu temsili bağışıklık lekeleriyle daha özgün yayını dahil değildir.
Yazarların açıklayacak hiçbir şeyi yoktur.
Biz, hipokampusun CA1 bölgesinde ve dilimin tetanized alan nükleer zenginleştirilmiş kısımların daha sonraki izolasyon Uzun süreli potansiyasyon indüksiyonu için ayrıntılı bir protokol sağlar. Bu yaklaşım, önemli aktivitesini öğrenme ve hafıza ile hücresel modellerinde bağımlı nükleer protein alma belirlemek için kullanılabilir.
Bu çalışma DFG (SFB 779 TPB8, Kr1879/3-1 MRK), DIP hibesi (MRK), AB FP7 MC-ITN NPlast (MRK), Davranışsal Beyin Bilimleri Merkezi (CBBS, Şahsen-Anhalt), (AK ve SB) tarafından finanse edilmiştir, MM, Avrupa Moleküler Biyoloji Organizasyonu (EMBO) Uzun Süreli Bursu (EMBO ALTF 884-2011) ve Marie-Curie IEF sahibidir.
| Equipment | |||
| CED 1401 AD/DA dönüştürücü | Cambridge Electronics Design, İngiltere | <||
| a href="http://www.iciba.com/stereomicroscope">Stereomikroskop | Leica S4E, Almanya | ||
| Vibrotom | Leica VT1000S, Almanya | ||
| İzole nabız stimülatörü | A-M Sistemler, ABD | Model 2100 | |
| Santrifüj | Thermo Scientific | ||
| SDS-PAGE sistemi | Biorad | ||
| Soğutucu | Julabo | ||
| Parlak alan Mikroskobu | Nikon Eclipse TS100 | ||
| Hücre kültürü inkübatörü | Thermo Electron Corporation | Mikromanipülatör||
| Luigs & Neumann, SM-5, Almanya | |||
| Kurutma odası ve elektrik enerjisi tedarikçisi | Hoefer Scientific Instruments, San Francisco, CA | ||
| Batık tip kayıt odası | özel yapım | ||
| U-şekilli ve batık tip inkübatör | ısmarlama | ||
| Küçük cerrahi makas | |||
| Neşter | |||
| İnce spatula | |||
| Plastik Pastör pipeti | |||
| Plastik kültür kabı | |||
| Bunsen beher | |||
| Şırınga | |||
| Reagents | |||
| NaCl | Roth | Art.-Nr.3957.1 | ≥ %99,5, pa, ACS, ISO |
| KCl | Roth Art | .-Nr.6781.1 | ≥ % 99,5, pa, ACS, ISO |
| CaCl < alt > 2 < / alt > ve orta nokta; 2H < alt > 2 < / alt >O | Merck | 1.02382.0500 | pro analizi |
| MgSO | Merck | 5886.05 | pro analizi |
| MgCl2· 6H2O | AppliChem | CAS-NO: 7791-18-6; EC-NO: | Moleküler biyoloji için |
| 2320946 KH2< / sub>PO < sub>4< / sub> | Merck | 12034.025 | moleküler biyoloji için |
| Na2< / sub>HPO4< / sub> ve orta nokta; 2H2O | Merck | 1.06574.1000 | ekstra saf |
| Glikoz ve orta nokta; H2O | Roth | Art.-Nr.6887.1 | moleküler biyoloji için |
| HEPES | Roth | Art.-Nr.9105.4 | PUFFERAN, ≥ %99,5, yıllık |
| NaHCO3 | Merck | 1.06329.1000 | pro analizi |
| Proteaz inhibitörü kokteyli | Roche | ||
| Fosfostop | Roche | ||
| Bicuculline | Tocris Bioscience | ||
| Isofluran | Baxter | ||
| Antikorlar | |||
| Birincil antikorlar | Şirket | Katalog | Numarası Tür |
| pJac-s180 Biogenes | tavşan (1:100 seyreltilmiş) | ||
| NeuN | Milipore | MAB377 | fare (1:1.000 seyreltilmiş) |
| NSE | Hücre Sinyali | D20H2 | tavşan (1:1.000 seyreltilmiş) |
| Beta-aktin | Sigma | A-5441 | fare (1:5.000 seyreltilmiş) |
| İkincil antikorlar | Şirket | Katalog Numarası | Tür: |
| IgG HRP konjuge | DAKO | keçi anti-fare (1:5,000) | |
| IgG HRP konjuge | NEB | keçi anti-tavşan (1:5,000) | |