RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
tr_TR
Menu
Menu
Menu
Menu
Research Article
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Bu yöntem, bakterilerin fagositozunu ve oksidatif patlamayı aynı anda ölçerek granülosit fonksiyonunu değerlendirmek için bir teknik gösterir. Görüntü tabanlı akış sitometrisi, hepsi göreceli fonksiyonel kapasitelerinde farklılık gösteren üç farklı aktive granülosit alt kümesinin tanımlanmasına izin verdi.
Granülositler, vücudun bakteriyel ve viral enfeksiyonlara karşı doğuştan gelen bağışıklık tepkisinde anahtar bir rol oynar. Granülosit fonksiyonunu ölçmek için yöntemler mevcut olsa da, genel olarak bunlar sağlayabilecekleri bilgi açısından sınırlıdır. Örneğin, mevcut tahlillerin çoğu, tek, sabit uzunlukta bir inkübasyonun ardından kaç tanenin aktive edildiğinin bir yüzdesini sağlar. Meseleleri karmaşık hale getiren çoğu tahlil, algılama teknolojisindeki sınırlamalar nedeniyle işlevin yalnızca bir yönüne odaklanır. Bu rapor, bakterilerin granülosit fagositozunun ve oksidatif patlamanın eşzamanlı ölçümü için bir tekniği göstermektedir. Bu fonksiyonların her ikisini de aynı anda ölçerek, aktive edilmiş granülositlerin üç benzersiz fenotipi tanımlandı: 1) Düşük Aktivasyon (minimal fagositoz, oksidatif patlama yok), 2) Orta Aktivasyon (orta derecede fagositoz, bazı oksidatif patlama, ancak iki fonksiyonel olayın birlikte lokalizasyonu yok) ve 3) Yüksek Aktivasyon (yüksek fagositoz, yüksek oksidatif patlama, fagositozun birlikte lokalizasyonu ve oksidatif patlama). İnaktive edilmiş granülositlerden oluşan dördüncü bir popülasyon da tanımlanmıştır. 10, 20 ve 40 dakikalık tahlil inkübasyonları kullanılarak, tahlil inkübasyon süresinin aktive edilmiş granülosit fenotiplerinin yeniden dağılımı üzerindeki etkisi değerlendirildi. Dördüncü bir inkübasyon, kontrol olarak buz üzerinde tamamlandı. Seri zaman inkübasyonlarını kullanarak, test, bir tedavinin granülosit fonksiyonunu mekansal olarak nasıl etkilediğini tespit edebilir. Tüm örnekler, kantitatif görüntüleme (QI) seçeneği, otomatik örnekleyici ve çoklu lazerler (488, 642 ve 785 nm) ile donatılmış görüntü tabanlı bir akış sitometresi kullanılarak ölçüldü.
Granülositler işgalci antijenlere karşı ilk savunma hattını sağlar vücudun doğal bağışıklık sisteminin bir bileşeni temsil eder. Granülosit fonksiyonu değerlendirmede Önceki yöntemler granülositler 1-4 değişti nasıl zor topluca tespit yapma, ayrı yöntem kullanılarak fagositoz kapasitesi veya oksidatif patlama üzerinde duruldu. Akış alanındaki gelişmeler, sitometrisi veren yüksek işleme kapasiteli bir şekilde 5 hücrelerin yüksek çözünürlüklü, renkli görüntüleme kapasitesine sahip tezgah üstü aletleri üretimi ile sonuçlanmıştır. Geleneksel akışı ile görüntüleme birleştirmek için yeteneği sitometri yöntemleri sitometri mevcut akış içinde yenilik ve bağışıklık sistemi ile ilgili yeni bilgiler elde etmek gerekli teknolojik bir platform sağlayan bir gelişmeyi temsil etmektedir.
Son on yılda, diğerleri arasında, bizim laboratuar, hevesle çeşitli beslenme ve egzersiz tedavileri patte etkisi üzerinde durulmuşturDoğuştan gelen bağışıklık fonksiyonu 6-9 RNS. Bu yazıda gösterdiği yöntem, klinik immünoloji alanındaki pratik etkileri vardır. Bu yöntem aynı zamanda bakteriyel parçacıklar ve oksidatif patlama fagositozunu ölçmek için görüntü tabanlı akış sitometri gücünü güçlendirir. Bu yaklaşımı kullanarak, bir analiz görüntü tabanlı bölümü tarafından sağlanan değişkenleri kullanarak aktive granülositleri ayırmak mümkün değildir. Bu alt kümeler bireysel granülositlere hücresel görüntüleri değerlendirirken sonra sadece tanımlanabilir vardı. Daha fazla tahlil inkübasyon süresi üç aktivasyon alt grupları 10 arasında geçişi etkilemiştir. Böylece, birden fazla inkübasyon sürelerinde kullanımı yöntemi, belirli bir deneysel tedavi aşağıdaki granülosit fonksiyonu değişikliği test etmek için izin verebilir olması akla yakındır. Bu yazının amacı, aynı anda oksidatif işlem ile fagositoz ölçmek için görüntü tabanlı akış sitometrik kullanarak değerlendiren granülosit fonksiyonu bir yöntem göstermektiive patladı.
NOT: Bu yöntemde açıklanan tüm kan toplama işlemleri Helsinki Bildirgesi çerçevesinde yapılan ve insan denekler için UNT kurumsal inceleme kurulu (KİK) tarafından onaylanmıştır. Tüm denekler, kan normal vücut ağırlığının, görünüşte sağlıklı olmasını sağlamak için, mevcut yöntemde kullanılan toplama, ve hastalık ücretsiz yazılı izin verdi.
1. Reaktif Kaynak & Hazırlık
2. Kan Numune Toplama
3. fagositoz Analiz tekniği

Şekil 1. Toplama Yöntemi ve Şablon. Örnekler (A) sitometrede bir görüntü tabanlı akış elde edildi. Iktisap sırasında, CD66b-APC vs Parlak Alan Aspect Ratio dot araziler istimal çivili kalibrasyon boncuk ayrılmış granülositlere üretildig INSPIRE v. 100.2.292.0 yazılım (B). Kırmızı, (640 nm; 100 nW), SSC (785 nm; 8.5 mW) lazerler; 5.000 granülosit az mavi bir otomatikörnekleyici'den (60 mW 488 nm) kullanarak her numuneler için elde edildi. Histogramlar bir dizi lazer ayarları ve diğer veri toplamak yönlerini izlemek için satın alma sırasında mevcut olduğunu unutmayınız. Bu histogram tüm isteğe bağlı ve laboratuar standart işletim prosedürleri kalite kontrolü gibi onları gerektiriyorsa, sadece ihtiyaç vardır. Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.
4. Numune Toplama ve Analiz

Şekil 2. Analiz Şablon. Bu rakam, odaklama (A) 'da olduğu hücreleri tanımlamak için oluşturulan parsellerin dizi, tek hücreler (B), granülositler (° C). Ek araziler aktive granülositler vs inaktif granülosit üç alt kümelerini belirlemek için kullanılmıştır. Elde edilen görüntü dosyalarının tüm analiz FİKİRLER v.6 yazılımı kullanılarak tamamlanmıştır. Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.
Görüntü tabanlı akış sitometrik kullanarak bize üç farklı aktivasyon alt grupları (Şekil 3) içine aktif granülosit homojen bir nüfusa ayırmak için izin verdi. Bu yöntemde, en etkili yolu, üç aktivasyon alt kümelerini oksidatif patlama vs (S. aureus) (DHE'nin) (Şekil 4 Şekil 3) fagositoz için parlak detay yoğunluğu çizerek olduğunu çözmek için. Ayrıca, FİKİRLER yazılım co-lokalizasyon sihirbazın kullanımı son derece aktif granülosit damgasını işaretidir eşzamanlı fagositoz ve oksidatif patlama varlığı, ölçümü için izin verecektir.

Aktif Granulosit Alt Grupları Şekil 3. Tanımlama. Hücre-yüzey belirteçleri (CD45 + / 66b +) kullanarak granülosit tanımlanmasından sonra, bir kızı arsa parlak detay niyet etme ile oluşturulmuşturoksidatif patlama için parlak detay yoğunluğu vs fagositoz için versitesi. Bu yaklaşım, etkin (mor), düşük aktif maddenin yüzdesi (kırmızı, A) orta aktif kullanarak (mavi, B) ve yüksek aktif (sarı, C), granülositler belirlenmiştir. Bu geçit tekniği de çeşitli aktif granülosit alt-görece bolluğu ile deney kuluçkalama süresi etkisini değerlendirmek için kullanıldı. "yüksek-aktif" granülosit yüzdesi en yüksek 40 dakika inkübasyon aşağıdaki mevcuttu. Elde edilen görüntü dosyalarının tüm analiz FİKİRLER v.6 yazılımı kullanılarak tamamlanmıştır. Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.
Aktif granülosit üç farklı alt-gruplar varlığını gösteren ek olarak, bu deney, kuluçkalama süresi, her aktif granülosit alt-görece bolluğu etkilediği gösterilmiştir. Spesifik olarak, 40 dakika Inc.ubation "yüksek-aktif" granülosit büyük yüzdesi ile sonuçlanmıştır. En az üç tahlil inkübasyon süreleri dahil ederek verilen bir klinik tedavi granülosit zamansal aktivasyon durumunu nasıl değiştirdiğini belirlemek mümkün olabilir. Bu fagositoz ve oksidatif patlama, aynı anda ölçümlerin bir fonksiyonu olarak farklı aktif granülosit alt kümelerini tanımlamak için görüntü bazlı akış sitometrik kullanarak ilk yayınlanmış bir yöntemdir.

Hücresel Markerlerinin Şekil 4. Temsilcisi Görüntüler. Yüksek aktif (A) olarak sınıflandırılan hücrelerin bir resim galerisi, orta-aktif (B), ve düşük-aktif (C) Bu şekilde sunulmaktadır. S.aureus bioparticles Ch03 vardır oksidatif patlama CD66b olduğunu, yan dağılım Ch06 olduğunu, çekirdeğin için 7AAD Ch05 olduğunu, Ch04 içindeCH11 ve CD45 CH12 bulunmaktadır. Ayrıca, oksidatif patlama vs fagositoz (Ch03) (Ch04) eş-lokalize birleştirme görüntü gösterilir. Birleştirme görüntünün sarı Alanları bu fagositoz ve oksidatif patlama aynı anda aynı anatomik alanda yaşanıyor göstermek. Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.
Yazarların açıklayacak hiçbir şeyi yoktur.
Bu yöntem, bakterilerin fagositozunu ve oksidatif patlamayı aynı anda ölçerek granülosit fonksiyonunu değerlendirmek için bir teknik gösterir. Görüntü tabanlı akış sitometrisi, hepsi göreceli fonksiyonel kapasitelerinde farklılık gösteren üç farklı aktive granülosit alt kümesinin tanımlanmasına izin verdi.
Bu çalışma kısmen Kuzey Teksas Üniversitesi'nden Dr. McFarlin'e verilen bir Araştırma Başlatma Hibesi (RIG) tarafından finanse edilmiştir. Yazarlar bu çalışmanın tamamlanması için doğrudan fon almamış ve herhangi bir çıkar çatışması bildirmemişlerdir.
| Kan alımı için kullanılan | Vacutainers | BD Yaşam Bilimleri | |
| WBC Fiksatif / RBC Lizis çözeltisi | eBioscience | 00-5333-57 | |
| CD66b-APC | eBioscience | klonu G10F5 | |
| CD45-APCeFluor780 | eBioscience | klonu 2D1 | |
| S. aureus biyopartiküller | Yaşam Teknolojileri | A10010 | |
| dihidroetidyum | Sigma-Aldrich | D7008 | |
| N-etilmalemid | Sigma-Aldrich | 4259 | |
| 7AAD | EMD Millipor | ||
| Hematoloji Analiz Cihazı | Mindray | BC-3200 | |
| 96 kanallı pipet | Integra Biosciences | ViaFlo | |
| Boncuk Banyosu İnkübatörü | LabArmour | BeadBath | |
| Görüntüleme Akış Sitometresi | EMD Millipore | Amnis FlowSight | |
| INSPIRE Yazılımı | EMD Millipore | Amnis INSPIRE | |
| IDEAS Yazılımı | EMD Millipore | Amnis IDEAS | |
| X-Pierce Piercable Plaka Mühürleyen | Excel Scientific, Inc. | X-Pierce | |
| Dell Precision İş İstasyonu | IDEAS analizi için Kullanılan | Çeşitli Dell Bilgisayarlar |