$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Corti'nin memeli organı, iki tip mekanosensoriyel tüy hücresinin yanı sıra en az dört tip duyusal olmayan destekleyici hücre de dahil olmak üzere özel hücre tiplerinin bir mozaiğinden oluşur ve bu da onu proliferasyon, kader spesifikasyonu, farklılaşma ve modelleme gibi normal hücresel süreçleri incelemek için ideal bir model sistem haline getirir. Ek olarak, bu farklı hücre tiplerinin normal gelişimi, normal işitme fonksiyonu için çok önemlidir. Bu nedenle, gelişimlerini düzenleyen hem moleküler hem de hücresel faktörleri anlamak çok önemlidir. Bununla birlikte, fare kokleasının küçük boyutu ve erişilemezliği, gen ekspresyonu çalışmaları için özel bir zorluk teşkil etmektedir. Ayrıca, hücre kaderi spesifikasyonu ve modelleme olaylarının çoğu embriyonik zaman dilimlerinde meydana gelir ve çoğunlukla doğumdan önce tamamlanır. Bu nedenle, embriyonik zaman periyotlarında sinyalleşme olaylarının tanımlanması ve karakterizasyonu, koklear morfogenezin moleküler temeli hakkında bilgi edinmek için gereklidir.
Burada, embriyonik fare iç kulaklarından in vitro olarak sağlam koklea kültürü için bir yöntem gösteriyoruz. Bu tekniğin kullanılmasının ardındaki mantık, kültürlenmiş kokleaların moleküler ve morfolojik özelliklerini korumaları ve böylece potansiyel aday genlerin araştırılması ve koklear morfogenezde yer alan mekanizmaların araştırılması için değerli bir model sağlamasıdır. Transgenik fareler gen ekspresyonu çalışmaları için kullanılabilse de, spesifik gen fonksiyonlarını izlemek için genellikle bir in vitro sisteme ihtiyaç vardır. Ayrıca, transgenik fare embriyolarından koklear kültürler oluşturulabilir, böylece in vitro gelişimleri ve çeşitli çözünür faktörlere ve antagonistlere yanıtları incelenebilir. Bu protokolde 13. gündeki embriyolar (E13) kullanılsa da, E12 veya E14'ten erken postnatal iç kulaklara kadar olan kültürler benzer sonuçlar verebilir.
Kare dalga elektroporasyonu kullanılarak kültürlenmiş embriyonik koklear eksplantlarda da bir gen transfer tekniği sunuyoruz. Koklear eksplantların izolasyonunu takiben, koklear kanal içindeki tek tek hücrelerde ilgilenilen gen(ler)in DNA plazmitlerini eksprese etmek için elektroporasyon kullanılabilir. Bu teknik, hücresel fenotipin altında yatan moleküler yollar hakkında bilgi edinmek için transgenik fareleri kullanan çalışmalara tamamlayıcı bir yaklaşım olarak hizmet eder. Bu gen transferi yöntemi kullanılarak, embriyonik koklea içindeki çeşitli epitel hücre tipleri transfekte edilir, böylece tek hücre düzeyinde fonksiyon kaybı ve kazancı analizleri mümkün olur. Ayrıca koklear eksplant kültürlerinde elektrofizyolojik çalışmalar da yapılabilmektedir8. Bu in vitro elektroporasyon yöntemi nispeten basit ve anlaşılırdır, dokuya minimum hasar ile birleştiğinde, bu tekniğin hızlı bir şekilde genişlemesine neden olmuştur.