$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Çözelti içinde serbest proteinler ve metal içeren substrat kullanmadan çözelti ya da toz biçiminde serbest ligandlar da dahil olmak üzere, ana bileşenler için kontrol Raman Toplama, yorumlama amaçlı olarak uygun bir karşılaştırma yapabilmek için çok önemlidir. Şekil 5A, tipik bir Raman sunulur nanoyapılı yüzeylerde olmadan cam slayt DI su içinde serbest protein A spektrum. En yüksek Raman yoğunluğu ile iki bant, 2931 cm bant -1 ve 1,091 cm -1, sırasıyla, CH ve CS bağları içeren titreşimlere karşılık gelmektedir. 563 cm-1, 1450 cm-1, 1653 cm-1 ve 2426 cm-1 gibi bir düşük değerli Raman yoğunluğu olan diğer gruplar, titreşim modları 18,32,33,34 bir üstüste atfedilebilir. Üç farklı konsantrasyonda, 0.3, 0.9 ve 1.3 mM tampon çözelti içinde ligand serbest GPB Kontrol Raman spektrumları, Şekil 5B'de gösterilmektedir. T O 2.935 cm bant ise, çözücü 35 geniş bant etrafında 3,400 cm -1 karşılık, anlamaya -1 32,33. Şekil 5C D-glikoz yüksek dalga boyu Raman spektrumunu göstermektedir protein CH bağları içeren titreşimleri temsil 1, 6, 100, 200 ve 400 mM: Farklı konsantrasyonları için tampon çözeltisi. Glukoz konsantrasyonu artar, CH bağlarının titreşim bantları 2890 cm-1 ve 2960 cm-1 ortaya çıkmaktadır. Her ikisi de 532 nm ve 780 nm eksitasyon dalga boyu ile elde edilen kristal halinde dopamin kontrol Raman spektrası Şekil 5D'de gösterilmiştir. Raman spektrumunun Çok bükme ve molekülün 19,36 CH bağı uzanıyor benzen halkası geliyor. 3.000 cm -1 bantların bazıları yalnızca 532 nm gözlenen ancak 780 nm uyarma dalga boyu vardır.
pload / 52.712 / 52712fig5.jpg "/>
DI su içinde protein A'nın Şekil 5. Kontrol Raman tayfı 532 nm eksitasyon dalga boyu 18 (A) elde edilmiştir; Tampon çözelti içinde ligand içermeyen glikoz bağlayıcı proteinin Raman spektrası 532 nm eksitasyon dalga boyu (B) 'de elde edilen; Tampon çözelti içinde D-glükoz Raman spektrası 532 nm eksitasyon dalga boyu (C) elde edilen; ve dopamin tozu spektrumları 532 nm ve 780 nm dalga boylarında uyarım 19 (D) elde edilmiştir. Tüm spektrumlar, düzenli çözeltiler Raman spektrası nano yapılı alt tabakalar olmaksızın, cam sürgüler üzerindeki (a, b, c) ve toz (D) 'dir. (D), çeşitli moleküler titreşimler Raman vardiya rejimlerin atama başka 19 ayrıntılı olarak Genel Atom ve Molekül Elektronik Yapı Sistemi (GAMESS) 30 ve MacMolPlt 31 yazılımı kullanılarak yapıldı. 18 Americ izni ile yayımlanmaktadır paneli (a)Bir Vakum Derneği. Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.
Adım 1-3 de tarif edildiği gibi yüzey-hareketsizleştirilmiş biyomoleküllerin için SERS spektrumunu elde etmek için, erimiş silis destek üzerinde metalik oluşturulan nano içeren alt-tabakalar imal edilmiştir. Fabrikasyon yüzeylerde kalitesi taramalı elektron mikroskobu (SEM) kullanılarak izlenir. Standart SEM prosedürler başka 16,17,18, 19 tarif ve mevcut protokol dahil değildir. 6 temsilci SEM Au ve Ag nano-nokta ve yapılar (paneller reklamın) gibi nano-altıgen görüntüleri, yanı sıra sigara gibi göstermektedir -structured Au, Ag pedleri (sırasıyla Panel E ve F). Bir sonraki adımlar, biyolojik Tablo 1'de listelenen üç tasarımlar kullanılarak nano-yapılı yüzeylerde malzeme ve onların SERS spektrumları edinimi immobilizasyonunu içerir. O da Raman görüntüleme sırasında, sulu bir ortam sağlamak için, order, her bir numune karşılık gelen bir çözeltiye yerleştirilmiş olan Şekil 7'de gösterildiği gibi, ince bir cam kapak ile kapatıldı ve kapalı (Tablo 1 e bakınız).

Şekil 6. Tarama elektron mikroskobu (SEM) SERS substrat olarak kullanılan 10 nm kalınlığında Au ve Ag yüzey nanoyapılarda görüntüleri: (A, B) nanodots dizileri; (C, D), nano-altıgenler dizileri; (E, F) yapılandırılmamış yastıkları. Ag yapıları (sağda) ile yüzeylerde FS üzerinde 10 nm kalınlığında Ni kaplama kullanmak ise Au yapıları ile Yüzeyleri (solda), FS destekleri kullanır. başka yerde 16,17,18 açıklandığı gibi görüntüler elde edilmiştir.pg "target =" _ blank "> bu rakamın daha büyük bir versiyonunu görmek için burayı tıklayınız.

Şekil çözeltisi içinde biyo-Fonksiyonlu örneklerin Raman görüntüleme için su geçirmez odanın 7. Şema.
Tasarım 1 'de, bir araya getiren protein bir DI su 18 11-mercaptodecanoic asit (MUA) bir kendi kendine bir araya tek tabaka ile işlevselleştirilmiş alt tabakalar üzerinde immobilize edilir. Bu tasarımda alt tabakalar 50 mil zift ve kaynaşık silika üzerinde değişen arası nokta mesafeleri (Şekiller 6A ve 8) ile birlikte, Au nokta üç dizileri ihtiva eder. Protein hareketsizleştirme işlem alt tabakalar üzerinde, bir SAM oluşumu başlar. SAM ve protein arasındaki bağlanma kovalent elde edilmesi için, SAM ve karboksilik asit grupları, N içeren bir karışım ile muamele ile amin reaktif NHS-ester dönüştürülmüştür em>-etil-N '- (3- (dimetilamino) propil) karbodiimid (EDC) çözeltisi ve DI suyla, N-hidroksisukinimid (NHS) çözeltisi eklenmiştir. Protein A immobilizasyonu proteininin 37 lizin kalıntıları NHS grubunun yer değiştirmesi ile meydana gelir. Au nanoyapılarda üzerinde hareketsiz hale getirilmiş protein A Design 1 görüntüleme örneklerinin bir örneği, Şekil 9'da gösterilmiştir. (Bakınız Şekil 9A, farklı arası nokta boşluklar biyo-işlevselleştirilmiş Au nanodots üç dizileri ihtiva örnekleri, bir optik mikroskop görüntüsünü sunar Ayrıca 3AA ve 8) Şekil ve Şekil 9B bu diziler üzerinde Raman spektral haritalama gösterir. En yüksek Raman şiddetleri Array alt yoğunlukları geniş arası nokta boşluklar Array III elde edilir ise arası nokta boşluklar, dar I bulundu olduğu görülebilir. Bu, daha yüksek elektrik bes tarafından üretilen güçlü bir plazmon bağlama etkisiyle açıklanabilirnoktalar arasındaki dar alanlarda LDS 18. Şekil 9C Diziler I ve II için elde edilen güçlü SERS spektrumları gösterir. spektrumları Şekil 5A'da görüldüğü çözelti içinde serbest protein A Raman modları yakınında çeşitli bantlar (1630 cm-1, 1964 cm-1, 2280 cm-1, 2577 cm-1 ve 2916 cm-1) bulunmaktadır. Proteinlerde bulunan çeşitli bağların titreşimleri Atfedilen, bu bantlar hem hareketsiz protein benzer yerlerde ve çözüm görünür, ya da hareketsiz hafifçe biraz daha yüksek dalgasayıları kaymıştır ya. Buna karşılık, protein olmadan MUA SAM tarafından işlevselleştirilen benzer nanoyapılı yüzeylerin SERS spektrumları o Şekil 9 teyit tamamen farklı bir desen 18 göstermek yüzey hareketsiz protein A SERS haritalama temsil eden bir görüntülemek için buraya tıklayınız Bu rakamın büyük versiyonu.

Şekil Tasarımı 1 18 kullanılan FS substrat Au nanodots üç dizilerin 8. SEM görüntüleri. Diziler aynı 50 nm sahayı ve inter-nokta boşluklar farklı genişlikte sonuçlanan biraz farklı nokta yarıçapı. Bu üç diziler için PMMA maskeleri üretmek için farklı EBL maruziyet dozu uygulanarak elde edilir (Tablo 1). Yüksek pozlama dozları metal kaplamaya ve Fırlatmaya sonra büyük Au nokta boyutları için izin PMMA maskeleri daha geniş delikler açar. 18 Amerikan Vakum Derneği izni ile yayımlanmaktadır. Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.
les / ftp_upload / 52.712 / 52712fig9.jpg "/>
Tasarım 1 18 alt tabaka hareketsiz protein A Şekil 9. SERS görüntüleme. Bir erimiş silika substrat üzerinde 50 nm perde ve farklı arası nokta boşluklar Au nanodots üç dizileri içeren (A) numunenin optik mikroskop görüntüsü, (ayrıca bkz Şekil 6), biyo-işlevselleştirilmiş Şekil 3A'da gösterildiği gibi. (B), örnek Raman haritalandırılması. Nokta Array I ve II (C) SERS spektrumları. Panelin (B), dikey eksen alt tabaka arasında mesafe, yatay eksen kayması Raman temsil eder, ve efsane çubuğu Raman yoğunlukları gösterir. Dikey panelinde panellerde hatları (B) ve (C) çözeltisi ve serbest protein A'nın karşılaştırmalı Raman bandı gösterir (*) kesik (C) Dizi I Raman spektrumları SERS bantları gösteren 532 nm uyarma elde edilmiştirdalga boyu. 18 Amerikan Vakum Derneği izni ile yayımlanmaktadır. Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.
Tasarım 2'de, yeniden birleştirici glukoz bağlama proteini (TRY) 21 D-glikoz (ligand) ile kompleks hale getirilmiş potasyum fosfat tampon çözeltisi içinde uygun alt-tabakaların üzerine immobilize edilir. Hareketsizleştirilmiş ligand içermeyen GBP numuneler de karşılaştırma için hazırlanır. Bu tasarımda, glukoz-bağlama proteini soy metaller 6 iyi Ni ancak bağlanan bir histidin etiketi vasıtası ile yüzey bağlanır. Yüzeyler Ni kaplamalı FS Ag dizileri nano-nokta, nano-altıgenler ve yapılandırılmamış Ag pedleri ihtiva beri (Şekil 6B, 6D ve 6F, sırasıyla), bir immobilize protein moleküllerinin çoğu arasında boşluklar bulunan bekleyebilirsiniz Ni kaplama av olduğu Ag nanoyapılardaailable. Raman spektrumları elde edilen hareketsizleştirilmiş glükoz ve glükoz bağlı TRY sırasıyla Şekil 10A ve 10B, gösterilmiştir. Tüm bu spektrumları sergi tampon çözeltisine 35 tekabül geniş bant yaklaşık 3.300 cm -1. Bir yapılandırılmamış Ag ped ile elde edilen spektrumları sadece bu tek bant içerir ve beklendiği gibi immobilize protein Ag yüzeyinde bulunan olmadığını teyit herhangi bir protein titreşim modları görünmüyor. Buna karşılık, spektrumları analit 32,33 temsil 1.550 cm -1 ve 2.900 cm -1 civarında Ag nano-nokta ve nano-altıgen sergi bantlar dizileri, elde edilen. Özellikle, geniş bant etrafında 1.550 cm -1, amid II bant olarak bilinen, proteinler 33,34 tahvil titreşimleri peptid bağlanabilir. Bu vakada, bu grup Ag özelliği arasındaki Ni yüzeyi üzerinde hareketsiz GBP titreşim modlarının bir üstüste binişini göstermektedirNano-nokta ya da nano-altıgen ihtiva eden alt-tabakalar kullanıldığında ler ve asil metal nano yakın Bu modların SERS geliştirme göstergesidir. Bu bant bağlama proteini için Ni yüzeysiz Ag ped üzerinde mevcut SERS geliştirilmesinde uygulanmıştır (Şekil 5B) ve yokluğunda çözeltide proteini için çok zayıf olan, ancak, protein için erişilebilir bir miktar Ni yüzeyi ile nano yapılı alt tabakalar için telaffuz edilir bağlamak. Ancak, hatta daha önemli bu çalışma için diğer dar bantlar çapında yaklaşık 2.900 cm -1 32,33 wibrations CH bağı isnat edilebilir bulunmaktadır. glikoz içermeyen GBP spektrumu 2933 cm -1 nano-altıgen alt tabaka (Şekil 10A) ile benzer bir dalga boyunda nano-noktalar substrat ve zayıf ama fark edilebilir bant ile en belirgin bant gösterir. Glikoz serbest protein durumunda farklı, glikoz bağlı GBP SERS spektrumları figu gösterilen 10B sergileyin 2,850 cm -1 ve 2.910 cm -1 de, tahvil titreşimleri rejimleri CH gelen iki bant yeniden. şeritler de nano altıgenler alt-tabaka üzerinde glukoz bağlı GBP spektrumunda belirgindir, ve ayrıca nano nokta alt-tabaka üzerinde GBP spektrumunda görülebilir. 2850 cm bant -1 diğer grup ise (2.910 cm, 2890 cm oldukça yakın -1 tek bir çözelti içinde, D-glikozdan, kontrol Raman spektrumunda olan ve bu nedenle, proteine bağlı glukoz atfedilebilir -1) protein ve glikoz hem de CH bağı titreşimleri bağlanabilir. Bir glikoz serbest ve glikoz-bağlı Substratla hareketsizleştirilmiş GBP SERS imzaların bu fark sonucuna bu bölgede gözlemlenebilir ve proteine bağlı glikoz CH bağ titreşimleri tarif edilen bir tasarım kullanılarak tespit edilebilir.
10.jpg "/>
Ligand-ücretsiz (A) ve Tasarım 2 üç farklı yüzeylerde immobilize. Spektrumları 780 nm dalgaboyu ile elde edilmiştir ligand bağlı (B) glukoz-bağlayıcı protein. Şekil 10. SERS spektrumları daha büyük bir versiyonunu görmek için buraya tıklayınız Bu rakamın.
Design 3 de, tiol sonlandırma 23, özel dopamin bağlama aptamer (dba) tris alt-tabaka (hidroksimetil) aminometan (TRIS), etilendiamintetraasetik asit (EDTA) tampon çözeltisi üzerinde immobilize edilir ve dopamin sonra hareketsiz kılınmış aptamer 19 bağlıdır. Bu tasarım için yüzeyler FS (Şekil 6C) Au nano-altıgen diziler içerir. Yapılandırılmamış Au yastıkları (Şekil 6E) de kontrol amaçlı kullanılır. DNA, doğal olarak floresan olduğu 38, 780 nm eksitasyon waveleng th Bu faktörü azaltmak için Tasarım 3 kullanılır. Dopamin, bu bölgede önemli bir Raman aktivitesi gösterirken, bu tasarımda, tanıma elemanı (aptamer), Şekil 11 'de ele Raman kaymaların bölgesinde aktif Raman değildir. Hareketsiz aptamer olmadan sadece dopamin maruz kalan numunelerin sinyal yok sonuçtaki dopamin bantları 19 gösterir görüldüğünden, SERS bantları Şekil 11. Aptamer bağlı dopamin kaynaklandığı tahmin öncesi ve ilavesinden sonra altın nanoyapılarda üzerinde hareketsiz aptamer SERS spektrumları karşılaştırır edilir Dopamin. Beklendiği gibi, hareketsiz dopamin Aptamer Raman bandı göstermez. Buna karşılık, telaffuz Raman bantları bir dizi dopamin bağlı immobilize aptamer gözlenmektedir. Şekil 11 en gruplarından pozisyonları amplitüdlerinde farklılıklar ile de olsa, kristal dopamin olanlara yakındır.
igure 11 "src =" / files / ftp_upload / 52.712 / 52712fig11.jpg "/>
Ligand-serbest (mor çizgi) ve ligand bağlı (mavi çizgi) dopamin-bağlama Tasarım Au nano-altıgen yüzeyler üzerinde hareketsiz aptameri 3 19. Kırmızı çizgi dopamin toz kontrol SERS spektrumunu göstermektedir. Şekil 11. SERS spektrumları Lütfen Bu rakamın büyük halini görmek için buraya tıklayın.