1. Nöronal Kültür
Not: pluripotent kök hücreleri yeniden programlama Fibroblast geç kortikal atalarıdır dorsal telencephalon soy, türetme, büyütme ve bankacılık bağlılık (LCP) Boissart ark 4 tarif edildi. LCP benzeri hücrelerin nöronal farklılaşma, aynı zamanda hafif değişiklikler Boissart et al 4'e göre gerçekleştirilmiştir. Diğer prosedürler nöronlar içine farklılaşma ardından uyarılmış pluripotent kök hücrelerin içine doğrudan fibroblastların yeniden programlama için geliştirilmiştir. O piramidal Glutamaterjik nöronların seçici üretimine izin verir, çünkü bu protokol muhafaza edildi.
- Poli-ornitin (DPBS 1/6 seyreltildi, stok konsantrasyonu% 0.01) DPBS içinde üç kez yıkanması izler O / N, cam lamelleri ile 6 oyuklu kültür plakaları tedavi edin. Daha sonra bir akış hunisi altına, en az 10 saat süre ile laminin (1 mg / ml, DPBS içinde 500 defa seyreltilmiş stok konsantrasyonu) ekleyin .
- Plaka ve düşük yoğunlukta NSC sevk N2 ekinin (50.000 hücre / cm2), cam DMEM / F12 oluşan kültür ortamının 3 ml lamelleri (500 mi), 2 şişeler 6 oyuklu kültür plakaları içinde (her biri 5 mi), B27 ekinin 2 şişeler (10 mL) ekstrakte edildi, Pen-Streptomisin (10 ml Penisilin = ml Streptomisin = 10.000 birim / ml 10.000 ünite /), 2-merkaptoetanol, 1 ml (stok çözeltisi: 50 mM) ve laminin (1 / 500), büyüme faktörleri olmadan. KRİTİK ADIM: Hücre kümeleme azaltmak için yavaş dönen hareketlerle hücreler ekleyerek dikkatle bu adımı uygulayın.
- Kültür ortamı çıkarın. Cam lameller üzerine eklenmiş nöron tutmak topaklaşmayı önlemek için taze laminin çözeltisi 2 ug / ml ihtiva eden taze ortam N2B27 ekleyin. Her 3 günde orta değiştirin. Kurutma hücre önlemek için taze ortam ilave edilmeden önce kalan ortamı (200 ul) bir kısmını muhafaza edin. Alternatif olarak, daha hızlı ilerler ve toplam hacmin (3 mi) değiştirin.
e_title "> 2. lentiviral İletimi
Not: GFP lentiviral vektörler nazik Institut Pasteur Uwe Maskos Laboratory (Paris) tarafından sağlanan ve yayınlanan bir protokolün 5'e göre hazırlandı. GFP ekspresyonu fare fosfogliserat kinaz (PGK) promoteri tarafından tahrik edilir. Bu çalışma için, bir viral titresi 400 ng / ul (PBS 1x stok çözelti) oldu.
- Kültür başına GFP lentiviral vektör de (6-yuvalı plakalar), 40 ng ihtiva eden stok çözeltisi 1 ul ekleyerek viral partiküllerin yolu ile olgunlaştırma herhangi bir aşamasında, insan iPSC türetilmiş nöronlar transdüksiyonu ve taze kültür ortamı içinde 48 saat süreyle inkübe edilir. Not: Bu protokol için inkübasyon süresi omurga yapılarının iyi bir etiketleme verir.
3. İmmünofloresan
Not: Bütün omurga morfolojisinin etiketleme geliştirmek için, immüno-floresan etiketlemesini permeabilize koşullarında bir anti-GFP antikor kullanılarak gerçekleştirilmiştir.
- Oda sıcaklığında 10 dakika süreyle% 4 paraformaldehid içinde lamelleri transduse hücreleri kültür ortamı çıkarın ve gidermek ve ardından 1 x PBS içinde (10 dk) 3 kez yıkayın.
- PBS içinde Immerge mistery lamelleri% 0.05 Triton (100x) ve oda sıcaklığında 1 saat süre ile,% 10 at serumu ile desteklenmiş, daha sonra 1 x PBS içinde 3 kez yıkayın.
- 1x PBS 100 ul% 4 at serumu ve primer antikor (1/1000), GFP karşı ortaya her lamel 1000 kat seyreltildi ile takviye ekleyin. Bir karanlık kutu O inkübe / N 4 ° C'de, daha sonra 1 x 3 defa PBS ile yıkayın.
- PBS Tween 20% 0.5 ile takviye edilmiş olarak ve Alexa Fluor 488-konjuge antikor (1/200) seyreltin ve oda sıcaklığında 1 saat süreyle inkübe edin. Sonra 1x PBS içinde 3 kere yıkayın ve floresan mikroskobu için montaj orta ile cam slaytlar lamelleri monte edin.
4. Dendritik Omurga Görüntüleme
- Konfokal lazer tarama mikroskobu ile konfokal Görüntüleme gerçekleştirin.
- Piramidal morfoloji a ile sağlıklı nöronlar seçinnd tam dendritik arborization ve ayrı deneylerden elde edilen durumda en az 10 nöronlar ölçmek. Dendritin başına 100 mikron - 60 ölçmek.
- 20 uW etrafında örnek düzeyinde tipik bir zirve gücü ile NA objektif 1.3 = 40X yağ ve GFP uyarma için 488 nm lazer hattı kullanarak görüntüleri edinin. 80 nm çapında belirle piksel boyutu düzgün dendritik dikenler örnek.
Not: Gürültü dendritler ve dikenler doğru segmentasyon taviz vermeyen hangi bir görüntü için daha sonra analiz çağrısı. Yukarıda belirtilen mekansal örnekleme ve güç ayarları ile, 3.15 ms'den piksel bekleme zamanı böyle bir görüntü oluşturmak için yeterli fotonları toplamak için yeterli olduğu görülmektedir. Loş numuneler için, görüntü kalitesi 2 ila 4 tarama ortalama geliştirilebilir. Birkaç XY çini satın alma daha sonra birlikte işlemeden önce dikişli gereken ilgi bölgeyi kapsayacak şekilde gerekli olabilir. - Ile, Z-yığını elde, tüm nöron hacmi örnekZ 20 30 Z dilimleri, sonuçta 150 nm ila 300 nm arasında değişen aralığı.
Not: Bu ayarlarla elde yanal uzaysal çözünürlüğü 234 nm ve eksenel çözünürlük 591 nm. Burada seçilen örnekleme yeterli olduğunu, ancak eksenel çözünürlük yansıması için dikenler küçük boyutundan büyük olduğu için, analiz dendritler yana doğru uzanan dikenleri yanadır.
Dendritik Spine 5. 3D Niceleme
Not: Aşağıdaki bölümlerde özel analiz için Imaris yazılım kullanımını tarif eder. Alternatif uygulamalar benzer sonuçlar sağlayabilir NeuronStudio 15 veya Metamorph 8 de dahil olmak üzere, mevcuttur.
Aşağıdaki anahtar ayarları kullanın:
- Bir ön işleme aşaması olarak, yazılım tarafından sunulan görüntü işleme tesisleri ile Gauss filtreleme kullanmak. Görüntü İşleme> smoo yoluyla Gauss filtreleme gerçekleştirinşey> Gauss Filtre. XY piksel boyutuna eşit olması için filtre genişliğini ayarlayın.
- Yazılımın Filament Tracer modülü kullanılarak, dendritler bir yarı otomatik izleme yapın.
- İlk olarak, yazılım Dilim sekmesinde mesafe aracını kullanarak, dendrit çapını tahmin ediyoruz.
- Aşan sekmesinde, Filament aracı tıklayın. Daha iyi bir sağlamlık için bu protokol yarı otomatik izleme dayanır; Atla otomatik oluşturulması tıklayın. Modül arayüzü artık Çizim sekmesini gösteriyor. Burada, bir yöntem, bir tür olarak dendrit ve giriş tahmini dendrit çapı olarak autopath seçin.
- Bir kutunun içine imleç dönüm işaretçi Seç modunu kullanın. Dendrit başlangıç noktasında Shift-sağ tıklayın. Not: Yazılımın ilk hesaplamalar gerçekleştirir.
- Dendritin boyunca hareket ettirin. Başlangıç noktasından (temsilmavi küre olarak ed), büyük olasılıkla dendrit yolu temsil eden bir sarı çizgi gösterilir. Dendrit uç noktası üzerinde Shift-sol tıklayın.
- Otomatik dikenleri segmentasyon gerçekleştirin. Not: takip dendrit üzerindeki dikenler modül arabirimi tarafından otomatik olarak rastlanmaktadır.
- Modül arayüzünde, Yaratılış sekmesine tıklayın. Yeniden açılan listesinde, Dendrit Çap yeniden almak ve Tut veri kutusunu işaretleyin. Ardından yeniden tıklatın.
- Parçalara hacmi gerçek dendrit hacmine tekabül böylece Eşik ayarlayın. Bir Algoritma olarak. Mesafe Map Kısa Mesafe seçin İleri düğmesini tıklatın.
- En küçük omurga baş çapı ve maksimal uzunluğunu tespit, yine yazılımın Dilim sekmesinde mesafe aracını kullanarak, sonra tekrar Aşmak sekmesine gelip parametreleri girin. Fveya bu protokol, 200 civarında değerleri - minimal çapı 300 nm ve maksimal uzunluğu 4 mikron iyi bir başlangıç noktalarıdır. İzin Şube Dikenler kutusunu kontrol etmeyin. İleri düğmesini tıklatın.
- Dikenler temsil mavi noktalar gerçek omurga kafaları lokalize böylece Tohum Noktaları Eşik ayarlayın. İleri düğmesini tıklatın. Not: Çekirdek hesaplaması şu anda yapılıyor ve uzun olabilir.
- Modül arayüzü Araçlar sekmesine giderek dikenleri sınıflandırır. Sınıflandırır Spine tıklayın. İstendiğinde kullanıcı arayüzü, aşağıdaki gibi kendi morfolojisi ile tanımlanan dört sınıfları vardır emin olun: Topaç: uzunluk <1 um; Mantar: Uzunluk (omurga)> 3 ve Max genişliği (baş)> genişliği (boyun) 2 x anlamına gelir; Uzun ince: Ortalama genişlik (kafa) ≥ ortalama genişliği (boyun); Filopodia gibi: Uzunluk ≤ 4 mikron (hiç kafa).
Not: module arayüz sınıflandırma sonuçlarını içeren dört yeni Filament nesneleri oluşturur. - İhracat Istatistiksel veriler: Bu dört nesne arayüzleri herhangi İstatistikler sekmesine gidin.
Düğmesine Dosyaya Aktar Tüm İstatistikleri tıklayın.
Not: Diğer istatistiksel değerler dendritler için ihraç edilebilir (.. Örneğin uzunluk, alan, vb çapı, şube derinliği, dallanma açısı, hacim, ortalama), ve dikenler (örneğin, doğruluk, bağlılık, uzunluk ve farklı hacminin alan omurga parçaları, omurga çapı, yoğunluğu vb.)