Hemen Kaplama sonra ve Toplama sonra Hücreleri Görünüm
Kaplamadan hemen sonra, tek bir standart ters doku kültürü mikroskobu (Şekil 1B) ile 96-çukurlu bir levhanın her çukuruna içindeki tek hücrelerin varlığını görebiliriz. Kaplamanın 8 saat içinde, bu hücreler yerçekimi iyi nedeniyle dibine inmeye başlamış ve ayrık kümeler (Şekil 1C) içine birleşme başlamış olacaktır. 24 saat sonra, birleştirici hücrelerin, birincil agregasyonunu tamamlamış olacak ve tek tek hücreler birbiriyle (Şekil 1D) gelen belirsizdir iyi tanımlanmış, ancak düzensiz agregalar halinde sıkıştırılır olacaktır. İkinci gün (48 saat), agrega, 'temiz' görünmelidir sonuna kadar kuyu (Şekil 1E) içindeki tüm hücreleri alınmış olması; Kuyunun alt bu aşamada agrega dökülmüştür bazı hücrelere sahip olabilmektedir. Sağlanmasıagrega bu zaman noktasında, N2B27 toplanmış olan, onlar çap olarak yaklaşık 150-200 mikron serbestçe oyuk içinde hareket (örn., kuyu alt yapışmadığını), küresel olmalıdır. Diğer ortam içinde toplama (yani., ESLIF veya belirli faktörlerle N2B27) (hazırlanması için, Turner ve ark.) Başlangıç agrega morfoloji ve sonraki uyarılara tepkiyi, değiştirme potansiyeline sahiptir.
Temsilci Morfolojik Değişiklikler
(Şekil 1A, 5A) hr 48 ila 72 Chi içeren ikincil ortamın bir 24 saat darbesinin eklenmesi de germ 19,21 spesifik belirteçler polarize ifadesini gösteren uzatılmış agrega tanımlanır üretir. Hemen Chi darbe (72 saat) sonra, agrega hücreleri döken ve bu gün (Şekil 3A) sonuna doğru bu sinyallere tepkilerini göstermeye başlayacak başlayacaktır. Bu yanıtlaragregalar N2B27 (Şekil 3B) ilk 48 saat agregasyon dönemin ardından almış tedavi bağlıdır, her ikisi de gen ekspresyonunda ve morfolojik değişiklikler ile kendini göstermektedir. Sadece bir son nokta analizi gerekiyorsa, görüntüye agrega için en uygun zaman yaklaşık 96-120 saat olduğunu. Bu noktada agrega açık morfolojileri ve gen ekspresyonu (Şekil 3A) geliştirmiş olacak ve P200 pipet gelen orta o ejeksiyon bağlı olabileceği herhangi çıkarmak için yeterlidir böylece onların büyüklüğü ve kitle hala yeterince düşüktür. Kuyuya agreganın eki önlemek için başarısızlık olumsuz agrega oluşumu (Şekil 5Biv) etkileyecektir. Agregaların morfolojileri ve gen ekspresyonu modeli işleme bağlı olarak değiştirilebilir. Tek tedavi veya faktörlerin kombinasyonları ile ya sürekli ya da darbeli rejimler için Temsilcisi sonuçları BMP4, Dorsomorphin H1 (B gösterilmektedirMP reseptör inhibitörü), ActivinA, SB43 (Aktivin / Düğüm inhibitörü), bFGF ve PD03 (MEK inhibitörü) (Şekil 3B).
Agrega Görüntüleme ve Kantitatif Görüntü Analizi
Büyüklükleri (esas time-lapse görüntüleme 19) ya widefield mikroskopiyle görüntüleme için uygun, ya da sabit ve konfokal görüntüleme 19,21 (Şekil 2) için immunohistokimyasal vardır. Geçerli protokol ve görüntüleme açıklaması yukarıda nicel bilgiler bu agrega elde edilmesini sağlar. Aşağıdaki Konfokal veya geniş alan görüntü yakalama, uzunluk ve (sırasıyla küresel veya uzamış; Şekil 4A, B) agrega çapı veya omurga boyunca gelen gen ifadesi ölçülebilir. Bu analizler, aynı zamanda, bir farklı koşullar altında agrega büyümesi, boyut ve uzama oranının bilgi edinebilir zaman atlamalı görüntüler, (Şekil 4 için direkt olarak uygulanabilir ).

Şekil 1. Tipik bir zaman ders ve erken morfolojileri. (A) agregasyon deneyleri için tipik zaman ders. Hücreler, 96 oyuklu bir plaka içerisinde (P1, P2), fare ES hücreleri süspansiyonu (10 hücre / ul) ihtiva eden N2B27 48 saat boyunca birleştirilir. (B) hemen (t = ~ 5 dk) sonra kaplama, tek tek hücreler olabilir süspansiyon görülür ve hücreler, yaklaşık olarak 100 um çapı olan, her oyuk tek bir agrega oluşmuş 24 saat sonra, 8 saat (C). (D) kümeleri oluşmaya başladı. (E) 48 saat agregasyonu sonra, agrega çapı 150-200 mikron arasında değişmektedir. Bu noktada, agregasyon ortamı (N2B27) çıkarılır ve bir ikincil ortam b değiştirildi önce (A bölümünde p1), deney boyunca veya 24 saat boyunca ya da ilave edilirN2B27 (bölüm A'da p2) için ack. Ölçek çubuğu 100 mikron temsil eder. Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.

Şekil 2 mikroskop lamı üzerine montajı agregatları da kullanılabilecektir. Agregalar giderildi sonra, boyanmış ve orta montaj yerleştirilir, her bir agrega 17 ul damlacık olarak bir mikroskop lamı üzerine pipetlendi (A, B, B '). Yeterli alan kendi birleştirilmesi önlemek için agrega damlacıkları arasında bırakılır. Ara parçaları, çift taraflı bant ile yapılır ve bir mikroskop lamı (A, A ', B) her bir köşesinde yer alır. Bir cam lamel yerleştirildiğinden emin bunlar üzerine olduğunu. Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.
: fo "jove_content" 
Şekil 3. toplanan ES hücrelerinin morfolojisi farklı tedavilerin etkisi. N2B27 2 gün sonra, ES hücreleri agrega oluşturmuşlardır. Özel faktörlerin eklenmesi ya da gen ekspresyonu, uzama potansiyeli ya da bunların genel şekli polaritesine göre agrega fenotipini değiştirebilir 1 gün darbesi (A) ya da sürekli olarak (B) elde edilir. Bu şekilde örnek 120 saat sonra görüntülenmiş ve belirtildiği gibi muamele edilmiş, ya Bra oluşan agregalar :: GFP 30 (A) veya Sox1 :: GFP 27 (B), fare ES hücreleri bulunmaktadır. Ki: CHIR 99.021 31; SB43: SB 431542 32, DM: DorsomorphinH1 33,34; PD03:. PD0325901 th büyük halini görmek için tıklayınızrakamdır.

Agrega Şekil 4. nicel analizi. Bra oluşan tipik bir agrega :: Chi 24 saat darbesinin takip ve 120 saat görüntülü GFP mESCs 25,30. Parlak alan ve GFP kanalının Birleştirilmiş görüntü agreganın floresan ve uzunluğu ölçülebilir hangi boyunca B (A) A noktasından agreganın 'omurga' işareti parçalı hat, (B) gösterilir. Uzunluğu (C), aynı deneyde 24 agrega yuvarlaklığına (D) gösterilmiştir. Böyle yuvarlaklığı (D), dairesellik, çevre ve alan olarak şekil tanımlayıcıları görüntü analiz yazılımı FIJI 35 Görüntü Analizi Cookbook eklentisi kullanarak ölçülebilir. Her bir zaman noktasındaki yatay çizgi ile gösterilen ortalama;Hata çubukları standart sapmayı belirtir; (A) 'daki ölçek çubuğu 200 um gösterir. Muhabir hücre hatları arasındaki ince farklar vardır gibi, Chi bir darbe sonrasında, agrega ortalama maksimum uzunluk ve ortalama asgari yuvarlaklık değişecektir beklenmektedir. Farklı hücre hatları arasında, biz ortalama maksimum uzunluğu 400-800 um ve 0.4 ve 0.6 arasındaki ortalama minimum yuvarlaklığı ~ aralığında olabilir bulmak. Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.

Şekil agrega oluşumunda başarısızlıkların 5. örnekleri. Tekrarlanabilir agrega (A) oluşturma yeteneği, ilk n sayma gibi (Bi) taze ve iyi karışık ikincil orta, (Bii, BIII) gibi kritik faktörlere bağlıdır doğruluğuagrega sağlayan hücreler ve (BIV) ve umber yapışık kolonileri yani oluşturmazlar. 'kazasında' de yüzey içine. Belirtilen koşullar (B) her biri için toplam oluşumu hatalar tipik örnekleri gösterilmektedir. Belirtildiği gibi Ölçek bar; Ayrıntılar için sorun giderme tablosu (Tablo 1), bkz. bu rakamın büyük halini görmek için buraya tıklayınız.

Sorun giderme Tablo 1. Kılavuzu. Agregasyon protokolü ile ilişkili tipik hatalar onların çözümüne olarak önerilerle verilmiştir.

Tablo hücre hatları 2. Tablo AGG oluşumu için testRegates. hücre çizgileri arasındaki ince farklar beklense de, agrega ve oluşumu için tanımlanmıştır ve gözlenmiştir 19,22,27,30,36-40 hücre çizgilerinin bir kısmı, her şeyden önce hatları açısından benzer dinamiklerini göstermektedir uzama ve morfolojisi. Gen ekspresyonu açısından, ekspresyon paterni geninin ifade özgü olduğunu, ancak, her bir hücre hattı olan, ifade şablonu geçişlerinin bir dizi üzerinden tutarlıdır. Tutarlılık için, kültürde 15 geçitleri aşmadı hücrelerden agregaları üretir.

Bu çalışmalarda kullanılan temsili antikorların Tablo 3. listesi. Antikorları ve toplam immün için kullanılan seyreltme faktörler seçim.