Bu protokolün amacı, kullanıcılara Lymnaea stagnalis embriyolarının ve larvalarının yüksek verimli dekapsülasyonu için bir dizi yöntem sağlamaktır.
Bu içeriği görüntülemek için JoVE aboneliğiniz gereklidir. Giriş yapın veya ücretsiz denemenizi bugün başlatın.
Bu protokolün amacı, kullanıcılara Lymnaea stagnalis embriyolarının ve larvalarının yüksek verimli dekapsülasyonu için bir dizi yöntem sağlamaktır.
In situ hibridizasyon bütün montaj (WMISH) ilgili (örneğin, bir embriyo veya larva gibi) bir "bütün montaj 'doku terkibi olan bir nükleik asit molekülü (genellikle mRNA'lar) uzamsal çözünürlük veya gelişimsel aşamada sağlayan bir tekniktir. önemli ölçüde karmaşık metazoan genomları fonksiyonel karakterizasyonu, yeni nesil dizi verilerinin tufan ile bir darboğaz haline gelmektedir bir meydan okuma katkıda bulunabilir çünkü WMISH son derece güçlüdür. çok zaman genellikle yeni model sistemler için WMISH deneylere doğasında çeşitli parametrelerini optimize için gereken tekniğin kavramsal basitliğine rağmen; doku tipleri ve gelişim aşamaları arasındaki hücresel ve biyokimyasal ince farklar tek WMISH yöntemi tüm durumlar için uygun olmayabilir anlamına gelir. Biz tutarlı üretmek ve yeniden ortaya çıkan gastropod modeli Lymnaea stagnalis için WMISH yöntemler kümesi geliştirdikgenlerin ve tüm gelişim aşamaları arasında bir aralık için açık WMISH işaretleri. Bu yöntemler, bir ontogenetik pencereye bilinmeyen kronolojik yaş larva atama, onların yumurta kapsüllerden verimli embriyoların kaldırılmasını ve larvaları, her ontogenetik pencere için uygun bir proteinaz-K tedavisinin uygulanmasını ve hibridizasyon sonrası hibridizasyon ve İmmuno dahil adımlar. Bu yöntemler, belirli bir RNA transkripti için ortaya çıkan sinyal prob özel ayarlamalar (öncelikle konsantrasyon ve melezleme sıcaklığı prob) ile daha da rafine olabilen bir zemin oluşturmaktadır.
Yumuşakçalar bilimsel disiplinlerin geniş bir çeşitlilik ilgi tutmak hayvanların bir grup vardır. Morfolojik çeşitlilik 1 rağmen, tür, 3 ticari tıbbi 4 ve bilimsel konularda 5-8 geniş bir yelpazede ve alaka (tür sayısı 2 bakımından sadece Arthropodlara ikinci) zenginliği, iddia edebilir görece az sayıda yumuşakça türü vardır iyi donanımlı bilimsel model ve laboratuar ortamında bakımı kolay hem olacak. Çok böyle nörobiyoloji 9, ekotoksikoloji 10 ve daha yakın evrimsel biyoloji 11,12 olarak disiplinler tarafından kullanılan bir yumuşakça, öncelikle çünkü yaygın dağıtım ve bakım aşırı kolaylığı, Lymnaea stagnalis olduğunu. Bir 'model' organizma olarak popülerlik ve L. mevcut gelişimsel biyologlar 13-19, moleküler araçlar aralığı ve güç kullanımı onun uzun geçmişine rağmen stagnalis bilimsel topluluk çok daha geleneksel hayvan modellerinde (Drosophila, fare, deniz kestanesi, nematodlar) o arkasında yatıyor.
Bir moleküler modeli kabuk oluşumunu rehberlik moleküler mekanizmalar bir ilgi kaynaklanıyor gibi bizim arzu Lymnaea geliştirmektir. Bu Lymnaea 'ın gelişimi sırasında gen ifadesinin, verimli, tutarlı ve duyarlı görselleştirme için izin verecek teknikleri bir dizi rafine bizi motive etti. In situ hibridizasyon bütün montaj (WMISH) yaygın model organizmaların çeşitli kullanılır ve 40 yılı aşkın 20 kullanımda olmuştur. Farklı guises, ISH mekansal kromozomlar, rRNA, mRNA ve mikro-RNA'lar belirli loci lokalize etmek için kullanılabilir.
Zorluklardan biri, önceki L. için WMISH yöntemi rafine hitap için gerekli stagnalis nazikçe ve etkin ayıklanması embriyo ve t değişen aşamaları larvalarının sorun olduO depolandıkları yumurta kapsüller. Bu özütleme, ya da 'kapsülden çıkarma', yeterli malzeme toplamak için etkili bir şekilde elde edilmesi gerekmektedir, aynı zamanda, morfolojik ve hücresel bütünlüğü muhafaza edilirken, in situ deneyde verilen. Diğer model organizmalar da kapsüllü gelişime tabi iken, elimizde bu türler için bildirilen yöntemlerden hiçbiri başarılı L. istihdam edilebilir stagnalis.
Bu yöntemin genel amaçları bu nedenle: L. ayıklamak için stagnalis yüksek verimli bir şekilde kendi kapsüller, embriyolar ve larvalar görüntüleme için tatmin edici bir WMISHsignals embriyo ve larvaları hazırlamak için, WMISH sinyali iyileştirir ön hibridizasyon tedaviler uygulamak.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
NOT: Aşağıdaki adımlar L. embriyonik ve larva aşamaları situ deneyde bir iletken için bir yöntem özetlemektedir Bir adım, bu kelime 'DİKKAT' ve tüm uygun güvenlik prosedürleri ile gösterilir tehlikeli kimyasal kullanımını içerir stagnalis. benimsenmelidir. Tehlikeli kimyasallar için temsili MSDS yaprak Linkler Ek Dosya 1'de verilmiştir. Tüm reaktifler için Tarifler Ek Dosya 2'de verilmektedir.
Kapsülden çıkarma Aparatı 1. Meclis
2. Örnek Toplama, Fiksasyon ve kapsülden çıkarma
NOT: Aksi belirtilmedikçe tüm adımları, oda sıcaklığında gerçekleştirilmektedir.
3. Proteinaz-K, TEA ve Post-fifiksasyon
NOT: Biz hızlı bir şekilde zaman kritik çözümler alışverişi için bir örgü zemin ile en verimli ve nazik bir yöntem küçük sepetlerde aşağıdaki adımları uygulayarak bulabilirsiniz. Bu ev yapılabilir, biz INTAVIS InSituPro -Vsi sıvı taşıma robotu (www.intavis.de/products/automated-ish-and-ihc) ile uyumlu sepetleri (orta boy) kullanın. Bu sepet, hızlı ve kolay değişimi çözeltiler için bir 12 yuvalı doku kültürü çanağı (TCD) oyuklarına arasında hareket edebilir, veya çözelti de bir pipet kullanılarak aspire edilebilir. Alternatif olarak, tüm çözüm borsaları sadece larva süpernatant aspire bu sepet olmadan yapılabilir. Bu durumda, hafif bir girdap hareketi yüzer de kenarından kaldırılacak sağlayan çanağın merkezine tüm embriyolar ve larvaları yoğunlaşacaktır. Aşağıdaki kullanıcı çözüm alışverişi için sepetleri istihdam olduğunu varsayar.
4. Sıcak Yıkayıcı ve İmmuno
Not: aşağıdaki adımlar için bir sıvı kotarma robotu kullanımı da, bu da kolayca manuel olarak yapılabilir. Bu durumda, embriyolar ve larvalar ShoULD. onlar hibritlenmiştir 1.5 ml tüpler içinde tutulması Bütün takip eden çözelti, Değişimleri aspire edildi ve bir P1,000 pipet ile eklenir. elle yapıldığında aşağıdaki adımlardan her biri, her çözeltinin 1 ml istihdam etmelidir.
5. Renk Gelişimi ve Montaj
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Şekil 3'te gösterildiği gibi Örnek WMISH boyanma, yukarıda tarif edilen teknik kullanılarak üretilebilir, ve kabuk oluşumu arasında değişen moleküler bir dizi işlem katılan genlerin mekansal ekspresyonu, çeşitli yansıtırlar (yeni bir gen, 1, 2, 3 ve 4), gelişim aşamaları bir dizi genelinde transkripsiyon regülasyonu (Brachyury) hücre-hücre sinyal (DPP) için. Biz onlar da olur bekliyoruz bu genlerin ifade seviyeleri...
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Burada tarif edilen yöntem, Lymnaea stagnalis tüm gelişim aşamalarında olan muhtemelen farklı sentezleme seviyelerine sahip RNA transkriptlerinin etkin olarak gösterebilir. Onların kapsüller embriyolar ve larvaları çıkarmak için diğer encapsulated- için bildirilen kimyasal, ozmotik şok ve fiziksel tedaviler çeşitli trialed model organizmalar geliştirmek. Ancak, bizim elimizde biz burada açıklamak yöntemi embriyolar ve larvaları zarar vermeden sert kapsül zarı kaldırır sadece yüksek verimli bir teknikti...
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Yazarlar ifşa hiçbir şey yok.
Bu çalışma DFG projesi # JA2108 / 2-1 ile DJJ için fon tarafından desteklenmiştir.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
| Ad | Şirket | Katalog numarası | Yorumlar |
|---|---|---|---|
| Tüy siklet forseps | Ehlert & İş Ortağı | # 4181119 | |
| Silikon boru | Glasger & auml; tebau OCHS GmbH | 760070 | |
| Cam kılcal damarlar | Hilgenberg | 1403547 | |
| 12 kuyulu doku kültürü kapları | Carl Roth | CE55.1 | |
| %37 Formaldehit | Carl Roth | P733.1 | DİKKAT - Kansere neden olabilir. Solunduğunda, cilt ile temas ettiğinde ve yutulduğunda toksiktir. Toksik: Solunması halinde, cilt ile temasında ve yutulması halinde çok ciddi geri dönüşü olmayan etki tehlikesi. |
| Etilendiamin tetraasetik asit | Carl Roth | CN06.3 | DİKKAT - GÖZ TAHRİŞİNE NEDEN OLUR. SOLUNUM YOLLARI VE CILT TAHRIŞINE NEDEN OLABILIR. Toz solumaktan kaçının. Göz, cilt ve giysilerle temasından kaçının. Sadece yeterli havalandırma ile kullanın |
| Magnezyum Klorür | Carl Roth | 2189.1 | |
| Tween-20 | Carl Roth | 9127.1 | DİKKAT - Solunması halinde zararlı olabilir. Solunum yolu tahrişine neden olabilir. Cilt yoluyla emilirse zararlı olabilir. Cilt tahrişine neden olabilir. Göz tahrişine neden olabilir. Yutulması halinde zararlı olabilir. |
| Sodyum Klorür | Carl Roth | 3957.1 | |
| Ficoll type 400 | Carl Roth | CN90.1 | |
| polivinilpirolidon K30 (MW 40) | Carl Roth | 4607.1 | DİKKAT - Solunması halinde zararlı olabilir. Solunum yolu tahrişine neden olabilir. Cilt yoluyla emilirse zararlı olabilir. Cilt tahrişine neden olabilir. Göz tahrişine neden olabilir. Yutulması halinde zararlı olabilir. |
| Nükleaz içermezSığır Serum Albümini | Carl Roth | 8895.1 | |
| Somon spermi | Carl Roth | 5434.2 | |
| Heparin | Carl Roth | 7692.1 | DİKKAT - YAN ETKILER ARASINDA KANAMA, LOKAL TAHRIŞ BULUNUR. SOLUNMASI, YUTULMASI/TEMAS EDILMESI HALINDE OLASI ALERJIK REAKSIYON. GÖZLER/CILT/SOLUNUM YOLU TAHRIŞ EDICI. OLASI AŞIRI DUYARLILIK. HAMİLELİK SIRASINDA ÖLÜ DOĞUM RİSKİNİ ARTIRDIĞI BİLDİRİLMİŞTİR |
| Proteinaz-K | Carl Roth | 7528.1 | |
| Glisin | Carl Roth | 3790.2 | |
| Deiyonize formamid | Carl Roth | P040.1 | DİKKAT - Gözleri ve cildi tahriş eder. Solunması, cilt ile teması halinde ve yutulması halinde zararlı olabilir. Doğmamış çocuğa zarar verebilir. Higroskopik. |
| Standart formamid | Carl Roth | 6749.3 | DİKKAT - Gözleri ve cildi tahriş eder. Solunması, cilt ile teması halinde ve yutulması halinde zararlı olabilir. Doğmamış çocuğa zarar verebilir. Higroskopik. |
| Trietanolamin | Carl Roth | 6300.1 | DİKKAT - Buhar veya buğu solumaktan kaçının. Göz ile temasından kaçınınız. Cilt ile uzun süreli veya tekrarlanan temastan kaçının. Kullandıktan sonra iyice yıkayın. |
| Asetik anhidrit | Carl Roth | 4483.1 | DİKKAT - CİDDİ CİDDİ CİLT VE GÖZ YANIKLARINA NEDEN OLUR. SU ILE ŞIDDETLI REAKSIYONA GIRER. YUTULMASI HALINDE ZARARLIDIR. GÖZLERİ VE SOLUNUM YOLLARINI TAŞİREN BUHAR |
| Maleik asit | Carl Roth | K304.2 | DİKKAT - Gözle teması (tahriş edici), yutulması durumunda çok tehlikelidir. Cilt teması (tahriş edici), soluma (akciğer tahriş edici) durumunda tehlikelidir. Cilt teması halinde hafif tehlikelidir (geçirgen). Gözleri ve cildi aşındırır. |
| Benzil benzoat | Sigma | B6630-250ML | DİKKAT - Solunması halinde zararlı olabilir. Solunum yolu tahrişine neden olabilir. Cilt yoluyla emilirse zararlı olabilir. Cilt tahrişine neden olabilir. Göz tahrişine neden olabilir. Yutulması halinde zararlıdır. |
| Benzil alkol | Sigma | 10,800-6 | DİKKAT - Yutulması halinde zararlıdır. Solunması halinde zararlıdır. Ciddi göz tahrişine neden olur. |
| Gliserol | Carl Roth | 3783.1 | |
| Bloke edici toz | Roche | 11096176001 | |
| Anti DIG Fab parçaları AP konjuge | Roche | 11093274910 | |
| Tris-HCl | Carl Roth | 9090.3 | |
| Dimetilformamid içinde 4-Nitro mavi tetrazolyum klorür ve nbsp; | Carl Roth | 4421.3 | DİKKAT - Doğmamış çocuğa zarar verebilir. Solunması ve cilt ile teması halinde zararlıdır. Gözleri tahriş eder. |
| 5-bromo-4-kloro-3-indolil-fosfat | Carl Roth | A155.3 | DİKKAT - Yutulması halinde potansiyel olarak zararlıdır. Cilde, gözlere veya giysilere temas ettirmeyin. Potansiyel cilt ve göz tahriş edici. |
| N-asetil sistein | Carl Roth | 4126.1 | |
| Dithiothreitol | Carl Roth | 6908.1 | DİKKAT - Göz ve cilt tahrişine neden olabilir. Solunum ve sindirim sistemi tahrişine neden olabilir. Bu malzemenin toksikolojik özellikleri tam olarak araştırılmamıştır. |
| Tergitol | Sigma | NP40S | DİKKAT - Solunması halinde zararlı olabilir. Solunum yolu tahrişine neden olabilir. Cilt yoluyla emilirse zararlı olabilir. Cilt tahrişine neden olabilir. Göz tahrişine neden olabilir. Yutulması halinde zararlı olabilir. |
| Sodyum dodesil sülfat | Carl Roth | CN30.3 | DİKKAT - Yutulması halinde zararlıdır. Cilt ile temasında toksiktir. Cilt tahrişine neden olur. Ciddi göz hasarına neden olur. Solunum yolu tahrişine neden olabilir. |
| Potasyum Klorür | Carl Roth | 6781.1 | |
| di-Sodyum hidrojen fosfat dihidrat (Na2< / sub>HPO4< / sub>• 2H2O) | Carl Roth | 4984.1 | |
| Potasyum dihidrojen fosfat (KH2PO4) | Carl Roth | 3904.1 | |
| Trisodyum sitrat dihidrat (C6H5Na3O7• 2H2O) | Carl Roth | 3580.1 | DİKKAT - Göz, cilt ve solunum yolu tahrişine neden olabilir. Bu malzemenin toksikolojik özellikleri tam olarak araştırılmamıştır. |
| Mineral yağ | Carl Roth | HP50.2 | |
| InSituPro-Vsi | Intavis | www.intavis.de/products/automated-ish-and-ihc |
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.