RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
tr_TR
Menu
Menu
Menu
Menu
A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Research Article
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Bağırsak lenfositlerinin kantitatif karakterizasyonuna, bu hücrelerin çeşitli bağırsak ve sistemik hastalıklarda kritik bir rol oynadığının giderek daha fazla tanınması nedeniyle artan bir ilgi vardır. Bu protokolde, sonraki akış sitometrik karakterizasyonu için tek hücreli popülasyonların farklı ince bağırsak bölmelerinden nasıl izole edileceğini açıklıyoruz.
bağırsaklar - Vücutta herhangi bir organın bağışıklık hücrelerinin en fazla sayıda içerirler - sürekli yabancı antijenleri, mikrobik ve diyet hem de maruz kalmaktadır. bağırsak sistemik hastalıkların bir dizi için kritik olan bu lümen antijenler immün yanıtı ve bağışıklık hücrelerinin eğitimin şekillenmesine yardımcı olduğunu giderek artan bir anlayış göz önüne alındığında, bağırsak bağışıklık sistemini karakterize ilgi var artmıştır. Bununla birlikte, bir çok yayınlanmış protokoller zor, zaman alıcıdır. Biz, hızlı, tekrarlanabilir ve zahmetli Percoll geçişlerini gerektirmez ince bağırsak lamina propria, intraepitelyal tabaka ve Peyer yamaları lenfositlerin izolasyonu için burada basitleştirilmiş bir protokol mevcut. Protokol, ince bağırsakta üzerine odaklanmış olmakla beraber, bu da kolon analizi için de uygundur. Ayrıca, biz belirli bir bilimsel ques bağlı olarak ek optimizasyon gerekebilir bazı yönlerini vurgulamakyon. Bu yaklaşım daha sonra, akış sitometrik analizinde ve özellikleri alternatif yollarla kullanılabilir uygulanabilir lenfositler, çok sayıda ayrı olarak elde edilir.
İnce bağırsağın temel görevi, genellikle besinlerin 1 sindirim ve emilim olarak kabul edilir. Bu metabolik fonksiyon açıkça gerekli iken, ince bağırsak lümeninin 2 içinde bulunan çevresel antijenlere sürekli baraj konağı korunmasında eşit derecede önemli bir role sahiptir. Bağırsak dış dünyayı ayıran (örn., Lümen antijenler) Sadece tek bir hücre tabakası kalınlığında bir epitel tabakası ile konağın iç ortamdan. Bu şekilde, ince bağırsak, bağışıklık sistemi, işgalci patojenlere karşı güçlü bir yanıtın monte ederken, minimal mukoza girmek için diyet ve ortakçı mikroplardan yabancı antijenleri sağlayan, herhangi bir halinde, bir bağışıklık tepkisi reaktivite için eşik dengeleme üstün görevi, öteki "zararlı" antijenler. Bu antijenlere karşı aşırı ya da uygunsuz immün yanıtlar (patolojik hastalığa yol açabilir, örneğin., Inflamasyonedici bağırsak hastalığı, tip I diyabet, çok merkezli skleroz) ve 3-6 kaçınılmalıdır.
Genel olarak, mide-bağırsak yolu, tüm antikor salgılayan hücreler 7% 70 üzerinde içeren, vücudun en büyük immün organı temsil ettiği düşünülmektedir. Lamina propriya (LP), intraepitelyal tabaka ve Peyer yamaları (PPS) - - ince bağırsak bağışıklık sistemi 3 ana bölmeden oluşur, her lenfosit 2 ayırt edici bir grubu içerir. LP lenfositleri (LPLs) ~% 20 B hücreleri ile esas TCRαβ + T hücreleridir; intraepitelyal lenfositler (IELS) TCRαβ + T hücreleri daha TCRγδ + T hücreleri çok az sayıda B hücrelerini içeren; ve ince bağırsak duvarında gömülü ikincil lenfoid organlar PPs, ~% 80 B hücrelerini içerirler. Bu anatomik bölgelerin her biraz farklı fonksiyonları ve ontolojik üsleri olmasına rağmen, onlar işlev aharmonized moda patojenik hakaretlere gelen ev sahibi korumak için.
Ayrıca, Mikrobiyota özel mikroplar ve özellikle hücre soylarının 8,9 ontogeny arasındaki soydaş ilişkinin tanıma artan bağırsak bağışıklık sisteminin gelişimi için kritik bir belirleyicisi olduğunu büyüyen takdir var. Ayrıca, bağırsak bağışıklık sisteminin eğitim anatomik uzak bölgelerde bağışıklık tepkilerini etkiler göz önüne alındığında (örneğin., Artrit, multipl skleroz, pnömoni), daha önce 10 tanıdı daha bağırsak bağışıklık sisteminin gelişmesi daha hastalık süreçleri ile ilgili olduğu açıkça ortaya çıktı -12. Bu nedenle, kantitatif bağırsak bağışıklık sistemini değerlendirirken ilgi şimdi konak-ortakçı etkileşimleri ve birçok sistemik hastalığın patogenezi de içerecek şekilde konak-patojen etkileşimleri aşmıştır.
mevcut yöntemlerin değişkenliği göz önüne alındığındabağırsak lenfosit izolasyonu gerekli zamanı dengeleme giderek kritik iken verimi, canlılığı ve tutarlılık için optimize edilmiş bir yöntem. Percoll geçişlerini içeren protokoller, zaman ve emek yoğun ve insan hatası potansiyel olarak daha yatkındır değişken verim giden ve 13 canlılığı. Burada, 3 ince bağırsak immün bölmelerden lenfositlerinin izolasyonu ve karakterizasyonu için optimize edilmiş bir protokol sağlar. Buna ek olarak, mukozal bağışıklık sistemi mikrop kaynaklı değişikler verilen artan bir ilgi, bu değişikliklerin kantitatif bağırsak bağışıklık sistemini nasıl etkilediği değerlendirmek için fareler arasında mikroorganizmaların yatay aktarım sağlamak için kullanılabilir adımları içerir.
Tüm çalışmalar Laboratuar Hayvanları Bilimi için Amerikan Derneği (AALAS) tarafından belirlenen veteriner standartlarını karşılayan Harvard Tıp Okulu'nda Kurumsal Hayvan Bakım ve Kullanım Komitesi (IACUC) göre sıkı inceleme ve kuralları uyarınca yapılmıştır.
Co-konut yoluyla Bakterilerin 1. Yatay İletim (İsteğe bağlı)
Peyer yamaları tek bir hücre süspansiyonu 3. hazırlanması
Akım Sitometrisi 4. Yüzey Boyama
Splenositler (Şekil 1A ve 1B) halinde ileri içindeki ve yan saçılma özelliklere sahip farklı bir hücreler popülasyonu elde gereken ince bağırsak lenfositlerin tekli hücre süspansiyonları, akış sitometrik analizi. Doku izolasyon ilk aşamalarında, 4 ° C de muhafaza değilse lenfositleri daha düşük bir ileri dağılım olan ve diğer epitel ve ölü hücrelerden ayırmak için daha zor olan lenfosit popülasyonu ile sonuçlanan, kalıp başlayabilir (Şekil 1C) . Ince bağırsak dokusu tamamen mezenterik yağ temizliği değil Ayrıca, eğer, lenfositler (Şekil 1D) tam bir kayıp hemen hemen yoktur. Bu özellikler hızla çalışan nasıl örnek kalitesini sağlamak için gerekli olan (mezenterik yağ hatta küçük miktarlarda kaldırarak, yani.) (Yani., Doku ısınmak için izin verilmez) ve detaylara dikkat göstermektedir. Typically biz ~ ince bağırsak LPLs (Şekil 1 E)% 80 canlılığı elde.
Şekil 2A Mikrobiyota bileşimi büyük ölçüde belirli bir hücre popülasyonlarının sayıları nasıl etkilediğini gösterir. Daha önce gösterildiği gibi, herhangi bir mikroorganizma tamamen yoksun olan mikropsuz (GF) fareler, spesifik patojensiz (SPF) fareler ile karşılaştırıldığında belirgin bir şekilde olgunlaşmamış küçük bağırsak bağışıklık sistemine sahip ve GF farelerin kolonizasyonu ince bağırsak, bağışıklık sisteminin 14 yeniden normal bir fare Mikrobiyota (MMB) sonuçları. Buna karşılık, gnotobiyotik fareler normal bir insan Mikrobiyota (Hmb) barındıran - ve bu benzer bir sayı ve MMB fareler gibi fekal bakteri çeşitliliği var - GF fareler 14 farksız olan bir ince bağırsak bağışıklık sistemi var.
Dan yararlanmakFarelerin coprophagic doğa, eş-konut fareler bir araya fareler arasında organizmaların yatay iletimine izin veren için basit, ama güçlü bir yöntem temsil eder. Bu yaklaşım bir Mikrobiyota sonuçlanan değişim ince bağırsak bağışıklık sistemini etkileyip etkilemediğini test etmenizi sağlar. Bir örnek olarak, SI LP (Şekil 2B) 14, CD3 + CD8 + T hücrelerinin sayısı normalleşmesine yolaçtı, 4 hafta boyunca MMB farelerle co-gövde HMB fareler gösterdi. Farenin birbirine eş yuva üstesinden varyasyonlar - Bu sonuç, Şekil 2A'da görülen MMB ve HMB fareleri arasındaki fark, bu fareler arasında Mikrobiyota değişimlerine bağlı olduğunu onaylar.

. D. D - Şekil 1. Bağırsak Lenfositler FSC ve splenositler, A Benzer DGM Özellikleri sahipoptimal hazırlanan splenositlerin (A) ve ince bağırsak lamina propria (SI LP) hücreleri (- D B) SSC ve FSC gösteren ot araziler. B. SI LP örneği tarif edilen protokole göre hazırlandı. C. bağırsak doku kasıtlı SI LP hücreleri daha düşük bir FSC sahip başlar göstermek ısınmaya bırakılmıştır. D. mezenterik yağ bir fark SI LP lenfosit nüfus kaybına neden tek hücrelerin hazırlanması öncesinde ince bağırsak kapalı temizlenmiş değildi. E. paneli B tasvir örnek sabitlenebilir canlılığı boya ile adım 4.7 lekeli (örn., EFluor 780) üreticinin talimatlarına göre. Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.

Şekil 2. Küçük intest ve Mikrobiyota Etkileri Olgunlaşmainal Bağışıklık Sistemi. A. CD3 +, CD8 + T hücreleri, SPF, MMB, HMB ve GF farelerin SI LP numaralanmıştır. B. HMB farenin eş barındırılmıştır önceden SI lp, CD3 + CD8 + T hücreleri numaralandırma 4 hafta içinde MMB fareler. co-yer değil MMB ve HMB farenin karşılaştırma amacıyla analiz edildi. Her veri noktası, bağımsız bir fare temsil eder ve Dikey çubuklar, ortalamayı yansıtır. NS, anlamlı değil; * P <0.05; ** P <0.01; *** P <0.001. Şekiller yeniden-ile olan izni-başvuruya 14, B. hafif değişiklik ile bu rakamın daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayınız.
Herhangi bir çıkar çatışması beyan edilmemiştir.
Bağırsak lenfositlerinin kantitatif karakterizasyonuna, bu hücrelerin çeşitli bağırsak ve sistemik hastalıklarda kritik bir rol oynadığının giderek daha fazla tanınması nedeniyle artan bir ilgi vardır. Bu protokolde, sonraki akış sitometrik karakterizasyonu için tek hücreli popülasyonların farklı ince bağırsak bölmelerinden nasıl izole edileceğini açıklıyoruz.
NKS, NIH ödülü K08 AI108690 tarafından desteklenmektedir.
| Steril Eldivenler | Kimberly-Clark | 555092 | |
| steril fare kafesi | Innovive | MS2-AD | kapak, kafes tabanı ve alpha-dri yatak takımı içerir |
| Metal besleyici | Yenilikçi | M-FEED | |
| Su şişesi | Yenilikçi | M-WB-300 | |
| Kart sahibi | Yenilikçi | CRD-HLD-H | |
| Otoklavlanabilir kemirgen chow (NIH-31M) | Zeigler | 4131207530 | |
| RPMI ortamı 1640 | Gibco | 11875-119 | |
| Dithiothreitol (DTT) | Sigma | D5545-5G | |
| 0.5 M EDTA (pH 8.0) | Ambion | AM9262 | |
| Fetal Sığır Serumu (FBS) | GemBio | 100-510 | |
| Dispase II | Invitrogen | 17105-041 | Protokoldeki konsantrasyon, 1.878 U / mg |
| Kollajenaz, tip II | Invitrogen | 17101-015 | protokolündeki konsantrasyon, 245 U/mg aktivite seviyesine dayanmaktadır |
| Diseksiyon makası | Roboz | RS-5882 | |
| Besleme iğnesi (18 G, 2" uzunluk) | Roboz | FN-7905 | |
| 10 ml Şırınga | BD | 305482 | |
| PBS | Gibco | 14190-250 | |
| Tek Kullanımlık Neşter (15 bıçak) | Miltex | 4-415 | |
| Kavisli forseps | Roboz | RS-5211 | |
| Düz forseps | Roboz | RS-5132 | |
| Çok amaçlı kaplar, 120 ml | VWR | 89009-662 | |
| Karıştırma çubuğu | VWR | 58949-062 | |
| Çok konumlu karıştırma plakası, 9 konumlu | VWR | 12621-048 | |
| Paslanmaz çelik konik süzgeç, 3 inç | LCV | ||
| 1.5 ml Tüp | Eppendorf | 0030 125.150 | |
| 100 μ m Hücre süzgeci | Falcon | 08-771-19 | |
| 40 μ m Hücre süzgeci | Falcon | 08-771-1 | |
| 50 ml Konik tüp | Falcon | 352098 | |
| 1 ml Şırınga | BD | 309659 | |
| 96 oyuklu Plaka, yuvarlak tabanlı | Corning | 3799 | |
| Anti-fare CD16/32 (Fc bloğu) | Biolegend | 101320 | |
| (İsteğe bağlı) Sabitlenebilir canlılık boyası eFluor 780 | eBiosciences | 65-0865-18 | |
| %10 Formalin, nötr tamponlu | Thermo Scientific | 5725 |