1. retroviral İlgi Kodlama TCR Hemichain Construct hazırlanması
- takip eden adımda TCR geninin yerleştirilmesine imkan vermek için Pmx vektör linearize. 3 saat 37 ° C (Tablo 1), EcoRI ve Notl kısıtlama enzimleri ile plazmid DNA Digest 8.
- % 1.2 agaroz jeli üzerinde sindirilmiş plasmidin elektroforez yapın. Tüketim yaklaşık 4.500 baz çifti (bps) bant ve elute 30 ul steril su içinde ticari olarak temin edilebilen jel özütleme kitleri 9 kullanarak.
- Ayrıca Pmx vektör, sırasıyla, 8, EcoRI ve Notl sindirimi sitesi örtüşen 15-20 bps kodlayan ilgi TCR gen için tasarım 5 've 3' primerleri.
- primerleri ile TCR gen yükseltmek. Adım 1.2'de tarif edildiği gibi, yaklaşık 1000 baz PCR ürünü ve elüt bandın elektroforez yapın.
- ticari olarak temin edilebilen plasmid ile her bir lineer fragmanı birleştirilerek sindirilmiş vektör içine TCR genini klonlamakMontaj Ana Karışım reaktif ve 1 saat 50 ° C'de inkübe.
NOT: Her bileşenin nispi hacimleri için imalatçının protokolüne bakınız. Bu montaj yöntemi başlangıçta Gibson ve ark. 10 tarafından tarif edilen tekniğe dayanmaktadır. - (İsteğe bağlı) Etiket TCR gen, insan sinir büyüme faktörü reseptörü, kesik biçiminde hücreleri kalıt işaretlemek (ΔNGFR, amino asitler 1-277) 11 furin klevaj, serin-glisin bağlayıcı ile ayrıldı ve 2A 12,13 dizileri. parçası uçlarının üst üste binen ve adımları 1.3-1.5 tarif edildiği gibi plazmid monte tasarım primerleri kodlayan dizileri içerir.
NOT: Bu diziler referanslar 11-13 bulunabilir. - Kimyasal olarak, yeterli E. Transform üreticinin protokolü 14 aşağıdaki monte plazmid ile E. coli. agar plakaları üzerinde Tohum dönüştürülmüş bakteriler (20 mg / ml lizojeni etsuyu (LB), 15 mg / ml agar ve 1 ug / ml ampisilin) ve 18 saat 37 ° C'de inkübe edin.
- Kültür, 37 ° C ve dakika başına 200 turda bir çalkalama inkübatöründe 16 saat 50 LB ortamında ml (20 mg / ml LB ve 1 ug / ml ampisilin) ve tek bir bakteri kolonisi.
- Üreticinin protokolü takip edilerek ticari olarak temin edilebilen kitler kullanılarak Midiprep plazmidler arındırın. yaklaşık 1 ug / ul konsantrasyon plazmid seyreltilir.
NOT: plazmit anlaştırma protokolü alkali ekstraksiyon yöntemi 15 dayanır.
2. Elektrik üretim kararlı paketleme hücre soyu
NOT: 293GPG ve PG13 Hem hücreler yapışık. Dulbecco Modifiye Edilmiş Eagle Ortamı (DMEM) içinde kültür hücreleri,% 10 fetal dana serumu (FCS) ve 50 ug / ml gentamisin ile takviye edilmiştir. transfeksiyondan önce 1 ug / ml tetrasiklin ile kültür 293GPG hücreleri. Tüm adımlar arasında,% 5 CO2 ile 37 ° C 'de inkübe hücreleri.
- Aşama 1.9 USI elde hemichain kodlayan vektör ile T75 şişesi içinde 16 kültürlenmiş Transfect 293GPG paketleme hücreleriüreticinin protokolü 1 ila 7, aşağıdaki ticari olarak temin edilebilir transfeksiyon reaktifi ng. NOT:% 50-60 confluency Transfect 293GPG hücreleri.
- Aspire 293GPG hücreleri için orta ve taze DMEM ortamı 1 gün sonrası transfeksiyon 10 ml ekleyin.
- Hasat geçici 2 gün şırıngadan kültür ortamının aktarılması ve 0.45 um'lik bir filtreden geçirilerek adım 2.2 sonra transfekte 293GPG hücrelerden virüs üretilir.
Not: Virüs hemen kullanılmıştır veya ileride kullanılmak üzere -80 ° C'de muhafaza edilebilir. - T25 şişesi içinde kültür 1 x 10 5 PG13 hücreleri. Bir hemasitometre kullanarak hücreleri saymak. Bir gün, aspirat kültür ortamı ve polibren 8 ug / ml ile birlikte, adım 2.3 ve 1.5 ml DMEM ortamı ile ilgili 293GPG türetilmiş virüs 1.5 mi ekledikten sonra.
- 4 gün boyunca günde bir kez adım 2.4 de tarif edildiği gibi ilgi TCR hemichain kodlayan stabil PG13 paketleme hücre hattı üretmek retrovirüs kurmak için orta değiştirin.
- Aspire orta ve değiştirme24 saat daha kültür için son enfeksiyondan sonra PG13 hücre hatları için taze DMEM ortamı ile.
Not:% 0.05 tripsin-EDTA çözeltisi ile ayırarak dondurma ya da alt-kültür hücreleri. - Hücrelerin ekim sonra adım 2.3 üç gün açıklandığı gibi transduse PG13 hücre hatları virüsü, T75 2 x 10 6 hücre 10 ml DMEM orta ile şişeyi kültür ve hasat virüsü üretmek için.
Not: Virüs iyi hemen kullanılmıştır ama iki aya kadar -80 ° C'de muhafaza edilebilir.
3. Etkinleştirme ve transdüksiyon insan T hücrelerinin
NOT: İnsan örnekleri alındı ve kurumsal etik komitesi onaylı protokollere uygun olarak kullanılır. Roswell Park Memorial Institute Kültür primer insan hücreleri (RPMI) ortamında,% 10 insan serumu yerine FCS ve 50 | ig / ml gentamisin ile takviye edilmiştir. Tüm adımlar arasında,% 5 CO2 ile 37 ° C 'de inkübe hücreleri.
- yoğunluğuna izole insan periferal kan tek-çekirdekli hücreleri (PBMC)üreticinin protokolü 18 aşağıdaki degrade ayırma.
- retroviral bir enfeksiyon için gerekli proliferasyonunu T hücrelerini aktive etmektedir. Rekombinant insan interlökin-2, anti-CD3 monoklonal antikoru (rhlL-2) ve 50 ng / ml, 100 IU / ml RPMI ortamında 5 ml 6 oyuklu plaka oyuk başına Kültür 2 x 10 7 taze veya çözülmüş PBMC, (klon OKT3).
- Üç gün, stimülasyon sonrası 4 dakika boyunca 350 xg'de pipetleme ve santrifüj T hücreleri toplamak. Süpernatant atılır ve adım 2.7 PG13 virüsü 1 ml yeniden süspansiyon haline getirildi, 24 oyuklu bir plaka içerisinde, oyuk başına 0.5-1 x 10 6 T hücrelerini tohum ve rhIL-2 200 lU / ml ile takviye edilmiş RPMI ortamı 1 mi. Santrifüj 1000 xg'de plakası ve 1 saat 32 ° C.
- 24 saat sonra, 4 dakika boyunca 350 xg'de pipetleme ve santrifüj ile T hücreleri toplamak. Aşama 2.7 PG13 virüsü 1 ml süpernatan ve tekrar süspansiyon hücreleri atın ve rhIL-2 200 lU / ml ile takviye edilmiş RPMI ortamı 1 mi. 6 Infect toplam için bu adımı yineleyiniyonları.
Not: enfeksiyonlarının sayısı hücre çizgisi paket tarafından üretilen virüsün titresi bağlı olarak optimize edilmelidir. Gerekirse, her gün hücrelerinin% 20-30 kaldırarak geçit T hücreleri büyümeyi engellemek için. - 24 saat son enfeksiyondan sonra, 4 dakika boyunca 350 xg'de pipetleme ve santrifüj T hücreleri toplamak. Daha fazla kültürü için rhlL-2, 100 lU / ml RPMI ortamında süpernatan ve tekrar süspansiyon hücreleri atın.
- 2-3 gün adım 3.5, 15 dakika, 4 ° C 'de 30 dakika süre ile 4 ° C'de, daha sonra anti-insan CD3 de HLA multımer ve ko-reseptörü monoklonal antikorları (mAbs) ile leke T hücreleri daha sonra. flow sitometri ile analiz edin. 19 - alakasız multimer ve / veya negatif kontroller (3, Şekil 1) ve untransduced hücreleri kullanır.
- Kişiye merkezli hemichain bir TCRα zinciri ise, 20 akış sitometrisi ile ticari olarak temin edilebilir Vβ özgü antikor paneli kullanarak novo multimer pozitif hücrelerin Vβ kullanımını analiz.
4. Klonlama De Novo TCR Counter-hemichains
- Akış destekli hücre sıralama adım 3.6 sırala de novo multimeir olumlu nüfus.
- Asit guanidinyum thiosiyanat-fenol-kloroform ekstraksiyon yöntemi 21,2 2 kullanılarak kriteri T hücrelerinden RNA izole edin.
Not: RNA -80 ° C 'de muhafaza edilebilir, ancak en kısa sürede mümkün olan cDNA oluşturmak için kullanılır. - Üreticinin protokolü 23,24, aşağıdaki ticari olarak temin edilebilir ters transkriptaz-PCR kiti kullanılarak ekstre RNA'dan cDNA kütüphanesi sentez.
- TCRβ karşı zincirleri klonlanması durumunda, tam uzunlukta adım 3.7 belirlenen, Vβ geni ve TCRβ sabit bölümüne özgü primerler dizayn ve klon TCRβ adımda 1.3-1.9 tarif genler. Aksi 5.1 adıma geçin adım sayacı zinciri TCRα ise 4,5 bakın.
- Ticari olarak mevcut Vα özgü antikorlar sınırlıdır, bu nedenle Vα gen kullanımı olamazAkış sitometrisi ile belirlenir. CDNA uçlarının (RACE), 25 5'-hızlı amplifikasyonu ile klon TCRα karşı zincirler, 5 'RACE kit 6, ticari olarak temin edilebilen.
- üreticinin protokolü takip eden basamakta 4.2 ekstre RNA'dan 5 'RACE uyumlu bir cDNA sentez.
- Tablo 2'de tarif edildiği gibi 1. hafta PCR gerçekleştirin.
- PCR ürününün elektroforez yürütmek ve aşama 1.2'de tarif edildiği gibi, yaklaşık 1100 bps bant elüte.
- Şablon olarak 1. döngü PCR ürünü kullanılarak, Tablo 3'te tarif edildiği gibi 2. döngü PCR gerçekleştirin.
Not: Tablo 3 kapsamında gösterilen tetikleyici dizlerde EcoRI ve Notl klonlama için tasarlandı Pmx vektör ile sindirilmiş. - PCR ürününün elektroforez yürütmek ve aşama 1.2'de tarif edildiği gibi, yaklaşık 1000 bps bant elüte.
- EcoRI ve Notl Klon TCRα genleri Pmx vektör Puri sindirilmişolarak fy plazmidler adımlarda 1.5-1.9 açıklandığı.
5. sulandırma Roman Antijen spesifik TCR Klonlar
Not: RPMI ortamında kültür Jurkat 76 hücreleri ve daha sonra hücre çizgileri% 10 FCS ve 50 | ig / ml gentamisin ile takviye edilmiştir. Tüm adımlar arasında,% 5 CO2 ile 37 ° C 'de inkübe hücreleri.
- Adım 2.3'te üretilen 293GPG virüsü kullanılarak merkezli TCR hemichain ile (insan T hücre çizgisi - - / veya eşdeğer TCR) Jurkat 76 hücreleri 26 transdüksiyonu. Jurkat 76, tohum RPMI ortamı 1 virüsünün ve 1 ml içeren, 24 oyuklu bir plaka içerisinde oyuk başına 5 x 10 4 hücre için. Santrifüj 1000 xg'de plakası ve 1 saat 32 ° C.
- 24 saat enfeksiyondan sonra, 4 dakika boyunca 350 xg'de hemichain transduse Jurkat pipetle ve santrifüj ile 76 hücreleri toplamak. Daha fazla kültürü için taze RPMI ortamı supernatant ve tekrar süspansiyon atın.
- hemichain 2-3 gün adım 5.2 sonra etiketli moleküler ise leke, transduse hücreleri arındırmakAkış yardımlı veya manyetik destekli hücre (isteğe bağlı) 27 sıralayarak ardından anti-NGFR mAb konjuge fluorofor ile ing.
- adımlara 2.1 2.3 takiben, 293GPG virüs adımlarla 4.4 veya 4.5 klonlanmış bir TCR karşı zincirini şifreleyen üretirler.
- Tam TCR sulandırmak için, kararlı bir şekilde adım 5.4 virüs kullanarak adımlarda 5,1-5,3 oluşturulan merkezli TCR hemichain eksprese eden T hücre hattını transduce. adımda 5.1-5.2 tarif edildiği gibi transdüksiyonunu gerçekleştirme.
- 2-3 gün adım 5.5 27 sonra, imalatçının protokolü takip anti-CD3 manyetik destekli hücre sınıflandırma CD3 + transfektanları saflaştınlır.
- Antijen spesifikliği doğrulamak için, anti-CD3 ve / veya ko-reseptör mAb'leri, ve HLA multimer çeşitli karşı zincirleri ile eşleştirilmiş merkezli TCR hemichain oluşan clonotypic TCRler, eksprese eden transfektanlar leke, 3-5 gün CD3 saflaştırma sonrası. 19 - flow sitometri (5 Şekil 4) hücreleri analiz edin.