Bu içeriği görüntülemek için JoVE aboneliğiniz gereklidir. Giriş yapın veya ücretsiz denemenizi bugün başlatın.

Yöntem makalesi

Yatay Gen Transferi Çalışmasında Metodolojisi

16.5K görüntülenme

DOI:

10.3791/55087

10 Mart 2017

* These authors contributed equally

Bu makalede

Özet

Burada Staphylococcus aureus konjugasyon, transdüksiyon ve doğal dönüşümün, in vitro incelenmesi için, üç farklı protokoller açıklanmaktadır.

Özet

Ana fırsatçı insan patojeni Staphylococcus aureus önemli bir özelliği, hızlı bir şekilde antibiyotiklere direnç elde etmek için olağanüstü yeteneğidir. Genomik çalışmalar S. aureus yatay gen transferi (HGT) S. aureus evriminde önemli bir rol oynadığını düşündürmektedir mobil genetik elementlerin bulunan birçok virülans ve direnç genleri taşıdığını ortaya koymaktadır. Ancak, yine de, eksik özellikle son zamanlarda bu bakterinin rapor edilmiştir doğal dönüşümü ile ilgili olan S. aureus HGT incelemek için kullanılan metodolojinin tam ve ayrıntılı bir açıklama. Konjugasyon faj iletimi ve doğal dönüşümün Bu çalışma, in vitro, S. aureus HGT incelemek için yararlı olan, üç protokollerini tasvir eder. Phenicols veren bu amaçla, cfr gen (kloramfenikol / florfenikol direnci), linkozamitler, Oksazolidinonlar, Pleuromutilins ve streptogramin A (PhLOPS içinA) fenotipi -karşı kullanılmıştır. S. aureus, diğer suşlar genetik materyaller aktaran geçtiği mekanizmaları anlamak direncin hızlı satın kavrama esastır ve yaygınlaştırma modları gözetim programlarında bildirilen veya gelecekte daha da yayılmasını moduna tahmin etmek netleştirmek için yardımcı olur.

Giriş

Staphylococcus aureus, doğal insan ve hayvanların deri ve burun boşluğu yaşar bir ortakçı Gram pozitif bir bakteridir. Bu bakteri türleri hastane ve sağlık ortamlarında hastane enfeksiyonlarının önde gelen nedenidir. Ayrıca, farklı antimikrobiyal bileşiklere direnç geliştirme kabiliyeti küresel bir endişe içine bu bakterinin neden olduğu enfeksiyonların yönetimini yapmıştır.

direnç fenotipleri yayılmasında karışan iki ana yollar bilinmektedir: dayanıklı genotiplerin klonal yayılmasını ve bakteriyel havuz arasındaki genetik belirleyicileri yayılmasını. S. aureus, farklı antibiyotik direnç genleri (ve hastalık oluşumunu be....

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Protokol

NOT: Bu çalışmada kullanılan suşlar ve malzemeler sırasıyla Tablo 1'de belirtilen ve Malzeme Tablosu vardır. Iletim deneylerinde, N315 ve pozitif türevleri cfr COL CFR geninin donör (N315-45 ve Col-45) olarak kullanılmıştır. Bu suşlar, daha önceden standart konjügasyon protokolü (aşağıya bakınız), aşağıdaki, verici klinik CFR pozitif Staphylococcus epidermidis soyu (ST2) halinde kullanılarak konjugasyon ile elde edilmiştir. Bu suş pSCFS7 benzeri plazmid 7 cfr genini barındırmıştır.

1. Konjugasyon Filtre çiftleşme Yöntemiyle

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Sonuçlar

Burada temsil edilen sonuçlar, daha önce yayınlanmıştır (yayıncının izni ile referans 7 uyarlanmıştır). Biz HGT üç mekanizmaları araştırmak düşük düzeyli linezolid direnci ve S. aureus suşları PhLOPSA dirençli fenotip 14, 15 ifade edilmesine neden olur CFR geninin, potansiyel iletim yollarını inceledi.

Şekil 1,.......

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Tartışma

Bu eser S. aureus genetik belirleyicilerin HGT incelemek için üç büyük yöntem açıklanır. Iletimi ve konjügasyon yıllardır incelenmiştir, ancak doğal dönüşümün mevcudiyeti son 2 tanındı. Böylece, S. aureus HGT üç ana modları hepsi ile donatılmıştır ve hepsi test genetik belirleyicilerinin olası yayma yolları açıklığa kavuşturmak için gereklidir. Bu çalışmanın amacı, tam protokolleri derlemek ve önceden yayınlanmış çalışmaları 7 kullanılan metodolojil.......

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Açıklamalar

Yazarların açıklayacak hiçbir şeyi yoktur.

Teşekkürler

Bu çalışma kısmen Takeda Bilim Vakfı, Pfizer Akademik Katkı ve JSPS Yabancı Araştırmacılar için Doktora Sonrası Bursu (FC) tarafından desteklenmiştir.

....

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Malzemeler

Bu makalede kullanılan malzemelerin listesi
AdŞirketKatalog numarasıYorumlar
Triptik Soya Suyu (TSB) Becton Dickinson 
Beyin Kalp İnfüzyonu (BHI)Becton Dickinson 
Besin Suyu No. 2OxoidCM0067
Koyun kanı agarEiken Chemical Co., Ltd.E-MR96Üreticiye göre %5 (h/h) koyun kanı ilave edilen triptik soya agarı.
Agar tozuWako Saf Kimya Endüstrileri010-08725
Sodyum sitrat (Trisodyum sitrat dihidrat)Wako Saf Kimya Endüstrileri191-01785
Selüloz Ester Izgaralı 0.45 μ L HAWG filtresiMerck MiliporeHAWG 02500
QIAfilter Plazmid Midi kitiQIAGEN12243
211825211059

Kaynaklar

  1. Lindsay, J. A. Genomic variation and evolution of Staphylococcus aureus. IJMM. 300, 98-103 (2010).
  2. Morikawa, K., et al. Expression of a cryptic secondary sigma factor gene unveils natural competence for DNA transformation in Staphyloco....

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Yeniden basım ve izinler

Etiketler

Konjugasyon ProtokolüFage TransduksiyonuDoğal TransformasyonAntibiyotik Direnç GenleriKoloni PCRMIC AnaliziTriptik Soya BrothKoyun Kanlı Agar