Birçok biyolojik yapılar zor, modern morfometrik yöntemleri uygulamak için yapım, kolayca tanımlanabilir yerlerinden yoksundur. İşte biz boyutunu ölçmek ve varyasyonu şekillendirmek için kullanılan yarı işaretlerini belirlemek için hesaplama yöntemleri takip diseksiyon ve MikroBT'lerin tarama dahil fare baculum (penis bir kemik), çalışma yöntemleri göstermektedir.
Bu içeriği görüntülemek için JoVE aboneliğiniz gereklidir. Giriş yapın veya ücretsiz denemenizi bugün başlatın.
Yöntem makalesi
Baculum diseksiyonu, mikroBT Tarama ve Morfometrik Analizleri
Bu makalede
Özet
Özet
Modern Morfometri boyutu ve şekli varyasyonu ölçmek için güçlü bir yöntem sağlar. Bir temel gereksinimi yerlerinden tanımlayan koordinatların bir listesi; ancak bu tür koordinatlar örneklerin arasında homolog yapılar temsil etmelidir. Birçok biyolojik nesneler homoloji varsayımı karşılamak için kolayca tespit yerlerinden oluşan ederken, birçok tür yapıları yoksundur. Bir potansiyel çözüm örneklerinin arasında aynı morfolojik bölgeyi temsil bir nesne üzerinde yer yarı işaretlerini matematiksel olarak etmektir. Burada, matematiksel fare baculum (penis kemiği) yarı-işaretlerini tanımlamak için yeni geliştirilmiş bir boru hattı göstermektedir. Bizim yöntemler nesnelerin geniş bir geçerli olmalıdır.
Giriş
Morfometrik alan boyutu ve biyolojik formunun biçimine, bilimsel araştırma, 1, 2, 3, 4, 5, 6 temel bir adım ölçmek için yöntemler çeşitlilik bulunmaktadır. Geleneksel olarak, boyut ve şekil istatistiksel analizi, bir biyolojik yapısına işaretlerini belirlenmesi ve daha sonra, bir çok değişkenli çerçevesinde analiz edilebilir, doğrusal uzaklık, açı ve oranları ölçülerek başlar. Landmark tabanlı Geometrik Morfometri analizi ve görselleştirme
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Protokol
Tüm prosedürler ve personel Hayvan Bakımı ve Kullanımı Komitesi Güney Kaliforniya Enstitüsü Üniversitesi (IACUC), protokol # 11394 tarafından onaylanmıştır.
1. baculum Diseksiyon ve Hazırlık
- İlgili Kurumsal Hayvan Bakım ve Kullanım Komitesi (IACUC) tarafından belirlenen protokollere göre, aşırı maruz kalma karbondioksit yoluyla cinsel olgun erkek fare Euthanize.
- yatar pozisyonda hayvan Lay ve başparmak prepusyal açılması yanal ile basınç uygulayarak penis uzatmak.
- Penis uzamış sonra, mümkün olduğu kadar üstderi ile doku genişletmek.
- makasla, baculum bulunduğu peniste penil vücut proksimal kesti.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Sonuçlar
Protokolde 6 üretilen yarı yerlerinden xyz koordinatlar doğrudan herhangi bir dönüm noktası tabanlı geometrik morfometrik analizi 17 içine alınabilir. Hesaplamalı boru hattı üzerinde fare Bacula 14, yanı sıra balina pelvik ve kaburga kemikleri 16 incelemek için uygulanmıştır. Yarı yerlerinden hesaplama tanımı ile ilgili daha fazla detay araştırmacıların ilgi kendi özel nesne karşılamak için modifiye edilebilir adımla.......
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Tartışma
Yukarıdaki protokol kritik adımlar 1) Bacula diseksiyon vardır, 2) MikroBT'lerin görüntüleri toplama, 3) xyz düz bir dosyaya MikroBT'lerin çıktı dönüştürme, 4) Her numune en nokta bulutu dışarı segmentlere koordinatları, 5) Her numune dönüştürülmesi standart koordinat sistemi, ve 6) yarı yerler tanımlayan. Bu adımlar kolayca farklı nesneleri yerleştirmek için modifiye edilmiştir.
Bu yöntemler, olasılıkla çok kavisli en azından esas olarak "çubuk biçimli" ya da herhangi bir .......
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Açıklamalar
Yazarlar, rekabet eden hiçbir finansal çıkarları olmadığını beyan ederler.
Teşekkürler
Tim Daley ve Andrew Smith ilk günlerinde birçok yararlı hesaplama tartışmalar sağlanan; Tim Daley Hesaplamalı kaynakları Güney Kaliforniya Üniversitesi'nde Yüksek Başarımlı Hesaplama Cluster tarafından sağlanan Protokolün 5. için gerekli program rotate_translate_cylindrical yazdı. Bu çalışma NIH hibe # GM098536 (MDD) tarafından desteklenmiştir.
....Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Malzemeler
| Ad | Şirket | Katalog numarası | Yorumlar |
|---|---|---|---|
| Diseksiyon makası | VWR | 470106-338 | Çoğu boyut çalışmalıdır |
| Diseksiyon Forseps, İnce Uç, Kavisli | VWR | 82027-406 | |
| 1.7 mL mikrosantrifüj tüpü | VWR | 87003-294 | |
| Mutlak Etanol | Fisher Scientific | CAS 64-17-5 | Diseksiyonlar için% 70'e seyreltilmelidir |
| Çiçek Köpüğü | Toptan Çiçek | 6002-48-07 | |
| uCT50 tarayıcı | Scanco Medical AG, Bruttisellen, İsviçre |
Kaynaklar
- Slice, D. E. Geometrics morphometrics. Annu. Rev. Anthropol. 36, 261-281 (2007).
- Slice, D. E. Modern morphometrics in physical anthropology. 6, Springer. (2005).
- Zelditch, M. L., Swiderski, D. L., Sheets, H. D.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Yeniden basım ve izinler
